期刊論文
黃愷羚、吳宗憲(2024.4)。政策模擬教學方法影響學生學習能力之研究-以共有資源治理之教學為例。理論與政策，97，73-103。
Shih-Yun Wu, Yi-Te Lai, Yi-Chun Lin, Chang-Hsien Wu, Yu-Min Chen (2022) Influence of Legislation on Public Attitude towards Animal Welfare in Taiwan. Society & Animal. (SCI)
Wu,Shih-Yun & Wu, Chang-Hsien(2021.9). Examining Taiwan Animal Welfare Legislation from the Empirical Perspective of Law Enforcement. Global Journal of Animal Law.
吳宗憲(2021.9)。台灣動物保護警察機制之設計與可行性評估：以審議民主為精神的調查。理論與政策，89，53-82。
吳宗憲、張雅彥、陳奕伶(2020.9)。利他動機類型影響社會企業選擇及管理模式之研究。理論與政策，86，1-28。
吳宗憲(2020.3)。建構人類世的動物保護治理機制。中外文學，491，97-132。(THCI)。
蕭人瑄、吳宗憲、王順美(2019.12)。模擬失敗為治理成功之母？ FishBanks情境模擬教學應用於公共資源困境之啟示。環境教育研究，14(2)。
吳宗憲、辜雅禪(2019.12)。團體諮商課程對動物保護檢查員同情疲勞影響之研究。環境教育研究，14(2)。
吳宗憲，郭怡貞(2019. 4)，動保文官同情疲勞現象、成因、影響及因應策略之思辨。東吳政治學報，37(1)，115-172 。(TSSCI)
吳宗憲(2019.9)。以政策模擬提升公共治理教學效果之設計及反省。國家文官學院 T&D 飛訊，258 ，1-39 。
李天申、蕭名凱、吳宗憲(2018.12)。行政院農業委員會設置「動物保護基金」之可行性分析 。理論與政策，79，45-66。
吳宗憲(2018.04)。如何評估道德政策執行績效？以我國地方政府動物保護績效指標之建構為例。文官制度季刊，10(2)，85-114。
吳宗憲、 蕭名凱、陳奕伶(2018.3)。台灣在全球反避稅局勢下的際遇與擔憂。展望與探索，16(3)：100-110。
吳宗憲(2017.12)。政策試點解決爭議性道德政策之嘗試：以宜蘭縣流浪犬絕育回置政策為例。政策與人力管理，8(2)：49-90。
吳宗憲(2017.12)。由「證據基礎」轉向「證據影響」：論「政策試點」方法的侷限與展望。理論與政策，75，29-54。
吳宗憲、蕭名凱(2017.6)。我國動物保護行政組織診斷之研究-道德性政策理論的觀察。中國行政評論，23(2)，30-69。
吳宗憲(2016.9)。在殞落了一位年輕獸醫師之後。 清流雙月刊，5，70-71。
吳宗憲 (2016.3) 。論新階段動物保護行政體制的改革。 台灣動物之聲 ， 63 ，26-27。
胡慧君、吳宗憲(2016.1)。當「道德」遇上「審議」--2014流浪犬政策公民會議效果之研究。文官制度季刊，8(1)，77-114。
吳宗憲 (2015.10) 。「人與動物關係學」與動物保護政策：臺灣經驗的啟示。 思想 ，29 ，179-200 。
吳宗憲(2015.8)。「道」不同不相為謀？--「道德」影響動物保護政策委外可行性之研究。民主與治理，2(2)，1-34。
吳宗憲、吳琬華 (2015.4) 。公共政策模擬情境教學實施經驗及反思。 研習論壇 ，172，24-32 。
吳宗憲、胡慧君 (2015.3) 。分析「寵物用人藥」政策中的談判策略。 台灣動物之聲，62 ，41- 43 。
吳宗憲 (2014.09) 。「聞聲救苦」或「濫用靈性」？職場靈性影響組織行為之實證研究─以文官靈性為中介變項。公共行政學報，47 ，73-107 。 (TSSCI)
吳宗憲(2014.9)。道德政策及其治理。人事月刊，349，23-24。
吳宗憲、許耿銘 (2014.8) 。組織變革對員工之影響 ─ 以公共服務動機為調節變項。文官培訓所 T&D 飛訊 ，196。
吳宗憲(2014.7)。公僕所為何來？--台南市政府文官公共服務動機影響工作努力意願之實證研究。政策與人力管理，4(4)，81-134。
吳宗憲、黃浩瑋 (2014.6) 。促參承辦人工作動機和團隊關係對其工作態度的影響研究。 行政暨政策學報 ，58 ，87-119 。 (TSSCI)
吳宗憲、侯凱翔(2014.5)。由談判利益分析兩岸協議監督機制之設計--交易成本理論觀點。展望與探索，12(5)，100-106。
吳宗憲、許耿銘(2014.4) 。職務分類制度效果評估之研究。人事行政，187 ，72-86。
吳宗憲(2014.4)。當政治遇上動物--多元政治意識形態下的動物保護觀點。應用倫理評論，56，23-43。
吳宗憲(2014.3)。如何緩解道德爭議的不可治理性？－－Ｑ方法分析同伴動物保護政策爭議之經驗。中國行政評論，20：1（8），211-252。
吳宗憲(2013.10)。 台北市政府促進民間參與公共建設經驗之「結構不確定性」－－代理人理論失落的一角。空大行政學報，26(3)，53-93。
吳宗憲 (2012.9) 。台南市政府文官公共服務動機與工作滿意、工作努力意願之實證研究。公共行政學報，43 ，91-126 。 (TSSCI)
吳宗憲、黃浩瑋 (2012.8) 。「促進民間參與公共建設」承辦人員的組織承諾之研析，研習論壇月刊，140 ，43-58 。
吳宗憲 (2012.6) 。道德政策理論之應用：台灣寵物業管理政策之個案研究。行政暨政策學報，54 ，121-164。 (TSSCI)
吳宗憲(2012.6)。「道德政策」是「不可治理」的嗎？──道德政策理論的介紹與反思。政策與人力管理，3(1)，123-162。
吳宗憲、黃建皓(2012.6)。論道德政策所引起的民主治理危機──以台南市民流浪動物政策態度為例。政策研究學報，12，92-134。
吳宗憲、郭怡貞 (2011.7) 。我國動物保護行政人力資源分析。 台灣動物之聲 ，55 ，38-41 。
吳宗憲 (2011.3) 。道德政策理論都會治理所缺少的一環。研習論壇月刊，123 ，40-46 。
孫本初、吳宗憲、宣介慈 (2011.1) 。都會政府永續促進民間參與公共建設之政策管理。 國家文官學院 T&D 飛訊，111 ，1-22 。
吳宗憲、郭怡貞 (2011.1) 。我國動物保護行政組織結構之現狀與分析。台灣動物之聲，53 ，38- 41 。
吳宗憲、曾凱毅(2010)。促進民間參與公共建設政策為何成為台北市政府的選擇？──交易成本理論的初探性應用。文官制度季刊，2(3)，107-149。
孫本初、吳宗憲、宣介慈 (2010.11) 。論文官中立「可能如何」及「如何可能」 ? 。國家文官學院 T&D 飛訊， 106 ， 1-9 。
吳宗憲、郭怡貞 (2010.10) 。我國動物保護行政組織業務面現況及分析。台灣動物之聲，52 ，41- 45 。
孫本初、吳宗憲 (2010.08) 。政府與非營利組織互動模式研究之回顧與前瞻。研習論壇，116，25 -43 。
吳宗憲 (2010.07) 。當「動物福利」碰到「公共政策」的教學。台灣動物之聲，51 ，38-41 。
吳宗憲 (2010.06) 。都會治理中的新課題：道德性政策的爭議。府際研究通訊，10 ，9-14 。
孫本初、吳宗憲 (2010.05) 。願景管理在公私協力中的重要角色。國家文官學院 T&D 飛訊，95 ，1-13 。
孫本初、吳宗憲 (2010.04) 。政府治理應該何去何從？。 文官通訊電子報 ， 4 。
吳宗憲 (2010.01) 。英國動物健康與福利策略方案對我國動物保護的啟示。 台灣動物之聲，49，30- 33 。
吳宗憲(2009)。非營利組織辦理兩岸文教交流活動時策略性順服行為。國家發展研究學報，9(1)，37-83。
吳宗憲(2009)。公私「協力」抑或公私「挾利」：兼論中山先生對資本的主張。國立國父紀念館《孫學研究》學報，6，97-120。
吳宗憲 (2008) 。臺灣民主轉型與金權政治。 臺灣民主季刊， 5 (3) ， 177-184 。(TSSCI)
吳秀光、吳宗憲(2008)。台北市政府促進民間參與公共建設政策之研究。政策研究學報，8，23-75。
吳宗憲(2008)。多元治理模式應用到開發中國家政府再造之困難。人事月刊，274，4-1。
孫本初、吳宗憲 (2008) 。政府的跨域管理在全球治理下的應用。研習論壇月刊，92，8-16 。
孫本初、吳宗憲 (2008) 。由交易成本理論分析政府對非營利組織的管理。 國家文官學院 T&D 飛訊，68 ，1-14 。
吳宗憲 (2007) 。論政府跨域管理代理鏈中的領導與激勵。 研習論壇月刊，84 ，18-24 。
孫本初、吳宗憲 (2007) 。政府的跨域績效管理。 研習論壇月刊，83 ，12-19 。
吳宗憲(2007)。公共選擇途徑下官僚行為理論之實證研究-以台北市政府政府線上申辦服務政策為例。考銓季刊，51，113-132。
吳宗憲(2006)。大陸開放外資設立銀行對我金融政策產生影響之分析。展望與探索月刊，4(12) ，100-105。
吳宗憲(2006)。從談判結構分析兩岸春節包機政策之成功因素。展望與探索月刊，4(2)，94-100。
吳宗憲(2005)。大陸對台商融資政策之分析。展望與探索月刊，3(11)，82-88。
吳宗憲(2005)。「評Ann.C.NGOs and Civil Society: Democracy by Proxy?」。台大政治科學季評，6。
吳秀光、吳宗憲 (2005) 。政治談判之內涵與技巧。 文官培訓所 T&D 飛訓， 8 。
孫本初、吳宗憲(2004)。以治理模式的激勵概念分析公務員服務法改革之趨勢。人事月刊，39 (5)，24-35。
吳宗憲(2004)。公共管理模式與政策轉移之探究。考銓季刊，41，177-191。
吳秀光、吳宗憲(2004)。中共網際網路管制政策之分析。展望與探索月刊，2(7)，54-67。
吳宗憲(2004)。兩岸出版交流現狀與展望。展望與探索月刊，2(2)，51-62。
吳宗憲(2003)。WTO架構下的大陸媒體集團化現象：理性型模、市場機制抑或社群精神。展望與探索月刊，1(6)，46-57。
吳宗憲 (2002) 。論韋伯「官僚制」在中國行政中的適用性。研習論壇月刊， 24 ，22-29 。
吳宗憲 (2002) 。政策合法化理論之研究。 研習論壇月刊，20 ，20-32 。
吳宗憲(2002)。論理性型模、市場機制及社群精神之治理模式及其調和。考銓季刊，32，118-134。
吳宗憲(2002)。論策略管理對政府設計與非營利組織互動關係之啟示。考銓季刊，30，113-130。
王坤生、吳宗憲(2002)。以公共選擇理論分析大陸台商子弟學校設立過程之研究。共黨問題研究，28(6)。