โรงเรียนลำผักชี เดิมชื่อว่า "โรงเรียนประชาบาลตำบลลำผักชี" อำเภอหนองจอก กรุงเทพมหานคร ตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 25 กรกฎาคม พ.ศ.2483 โดยนายอำเภอตั้งขึ้น ดำรงโรงเรียน โดยวิธีโรงเรียนประชาบาล จัดทำการเรียนการสอนตามหลักสูตรประถมศึกษาประชาบาล และเปิดสอนครั้งแรกโดยอาศัยโรงนา ที่นายบุง วัลลิภะคะ เป็นราษฎรในท้องถิ่น ได้มีจิตศรัทธาบริจาคโรงนาให้เป็นที่เรียนขนาด 6x15 เมตร ประกอบขึ้นด้วยไม้ไผ่ ในเวลาต่อมาโรงนาที่ใช้จัดการเรียนการสอนเกิดผุพังและหลังคารั่ว นายตาด แย้มจันทร์ ครูใหญ่ในขณะนั้น จึงได้บอกบุญกับบรรดาผู้ปกครอง เพื่อหาทุนในการซ่อมแซมตลอดมา

ในปี พ.ศ.2499 ได้จัดสร้างอาคารเรียนหลังใหม่ขึ้นในเดือนพฤศจิกายน 2499 เป็นอาคารเรียนแบบ ป.1 กรมสามัญศึกษา ขนาด 8x15 เมตร จากนั้นได้ย้ายไปสร้างที่แห่งใหม่ ในที่ดินของ นายเล็ก - นางรอด ดีประเสริฐ ซึ่งได้อุทิศให้กับโรงเรียน เป็นพื้นที่ 2 ไร่ ขนาด 40x50 เมตร แต่ทั้งนี้พื้นที่ดังกล่าวเป็นที่ลุ่ม นายตาด แย้มจันทร์ จึงได้ติดต่อเรือขุดมาช่วยตักดิน เพื่อปรับสภาพพื้นที่ให้เหมาะสมกับการจัดกิจกรรมการเรียนการสอนมาจนถึงปัจจุบัน