★Presentation total 67,      *invited talk, 依頼・招待講演

• 1. 井上健太郎, 内山良一, 金子泰之, 宮崎泰可, 高城一郎, 甲斐健吾, 金野琉聖, 非構造化電子カルテテキストのベクトル化に基づくSFTS確定・疑い例の解析, IIBMP2026, 神奈川, 2026年8月26-8月28日. (Poster) 

  2. 井上健太郎, 生物システムのための動的ネットワーク可視化ツール, 第48回日本分子生物学会年会, 神奈川, 2025年12月3-12月5日. (Poster) 

  3. Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Mathematical model of NFkB signaling regulated by TRAF6 in B cell, IIBMP2023, 千葉, 2023年9月7-9日 (Poster)

  4. 住吉 凪海, 関谷 麻杜, 西野 光一郎, 井上健太郎, iPS細胞のDNAメチル化解析, 第45回日本分子生物学会年会, 千葉, 2022年11月30-12月2日. (Poster) 

  5. *井上健太郎, 生命科学のビックデータ解析, 宮崎大学イブニングセミナー, 宮崎, 2022年3月3日. (Oral)

  6. 井上健太郎, シグナル伝達経路における転写因子-標的遺伝子のフィードバックエンリッチメント解析, 生命医薬情報学連合大会(IIBMP2021), Gather.town, 2021年9月27-29日. (Web poster)

  7. 井上健太郎, Wide parameter space analysis for reproducible parameter sets in simple model, 生命医薬情報学連合大会(IIBMP2020), Zoom, 2020年9月1-3日. (Web poster)

  8. *井上健太郎, 細胞の仕組みをITの力で読み解く, 宮崎大学イブニングセミナー, 宮崎, 2019年12月12日. (Oral)

  9. 井上健太郎, 転写を介したシグナル伝達システムのフィードバックループ, 第42回分子生物学会年会, 福岡, 2019年12月3-6日. (Poster)

  10. Kentaro Inoue, Sensitivity analysis for elementary circuits in signal transduction model, ICSB2019, Okinawa, November 1-5, 2019. (Poster)

  11. Kentaro Inoue, Pathway analysis and enrichment analysis for signaling pathway system, IIBMP2019, Tokyo, September 9-11, 2019. (Poster)

  12. 井上健太郎, シグナル伝達経路のネットワーク構造とダイナミクスにおける数理モデルの感度特性, 第41回分子生物学会年会, 横浜, 2018年11月28-30日. (Poster)

  13. Kentaro Inoue, Global sensitivity analysis in signaling pathway model, IIBMP2018, Tsuruoka, September 19-21, 2018. (Poster)

  14. *井上健太郎, シグナル伝達系の数理モデル, MZセミナー, 宮崎, 2018年5月17日 (Oral)

  15. Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Mathematical model and experiments for canonical NF-kB signaling, 新学術領域「数理シグナル」 第２回シンポジウム, 東京, 2018年2月10日 (Poster)

  16. 井上健太郎, シグナル伝達系における大規模モデルのシミュレーションに向けた研究, ConBio2017 (第４０回分子生物学会年会), 神戸, 2017年12月6～9日 (Poster)

  17. 井上健太郎,  シグナル伝達系の大規模数理モデルにおけるパラメタ推定法, 情報処理学会第51回バイオ情報学研究会, 札幌, 2017年9月26日 (Oral)

  18. 井上健太郎,  シグナル伝達系の数理モデル解析, JSBi九州地域部会セミナー, 下関, 2017年3月10日 (Oral)

  19. Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Gouhei Tanaka, Kazuyuki Aihara, Mariko Okada-Hatakeyama, Mathematical model for  NF-κB signal transduction system, The 2016 (26th) annual meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology (JSMB2016),  Poster No.P6, Fukuoka, September 7-9, 2016. (Poster)

  20. Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Kazunari Iwamoto, Michio Hiroshima, Yasushi Sako, Mariko Okada-Hatakeyama, Cooperative Mechanisms in Signaling Pathway for  Switch-like Nuclear Translocation of NF-κB, Single Molecule Approaches to Biology Gordon Research Conference, Hong Kong, July 3-8, 2016. (Poster)

  21. *井上健太郎, 実験と数理モデルによるNF-kappaBシグナル伝達システムの解析, 第38回BMIRC研究会, 福岡, 2016年5月2日. (Oral)

  22. Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Mariko Okada-Hatakeyama, 定量的実験と数学モデルによるNF-kappaB活性化システムの統合解析, 第38回分子生物学会年会,  Poster No.1P0789 , 兵庫, 2015年12月1-4日 (Poster)

  23. 吉田 圭介、前川 利男、Yujuan Zhu、Claire R. Guillet、Bruno Chatton、井上 健太郎、内山 健、石橋 健一、山田 拓司、大野 尚仁、白鬚 克彦、岡田 眞里子、石井 俊輔, ATF7はエピジェネティック記憶を通じて、自然免疫記憶を制御する , 第３8回分子生物学会年会,  Poster No.2LBA060 , 兵庫, 2015年12月1-4日. (Poster)

  24. Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Mariko Okada-Hatakeyama, Dynamic modeling for oscillatory and switch-like behavior of NF-κB activity, International Conference of Systems Biology (ICSB2015),  Poster No.18 , Biopolis, Singapore, November 23-24, 2015. (Poster & selected oral presentation)

  25. Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Mariko Okada-Hatakeyama, Dynamic model and experimental validation for oscillation and switch-like response of NF-κB activity, 生命医薬情報学連合大会2015,  Poster No.P3, 京都, 2015年10月29-31日. (Oral & Poster) 研究奨励賞受賞

  26. Hisaaki Shinohara, Marcelo Behar, Kentaro Inoue, Michio Hiroshima, Tomoharu Yasuda, Takeshi Nagashima, Shuhei Kimura, Hideki Sanjo, Shiori Maeda, Noriko Yumoto, Sewon Ki, Shizuo Akira, Yasushi Sako, Alexander Hoffmann, Tomohiro Kurosaki, Mariko Okada-Hatakeyama, Positive Feedback Within a Kinase Signaling Complex Functions as a Switch Mechanism for NF-κB Activation, GIW/InCoB 2015, Tokyo, September 9-11, 2015. (Highlight track)

  27. Hiroyuki Masunaga, Ryunosuke Itasaki, Kentaro Inoue, Mariko Okada and Hiroyuki Kurata, Dynamic sensitivity analysis of the ErbB signaling network, GIW/InCoB 2015, Poster No. P134, Tokyo, September 9-11, 2015. (Poster)

  28. Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Mariko Okada-Hatakeyama, Dynamic modeling of BCR signaling pathway to NF-kappaB activation, 2nd Symposium on Complex Biodynamics & Networks , Poster No.05, Yamagata, May 11-13, 2015. (Poster)

  29. 井上健太郎, NFkB活性化システムの数理モデル, 理研シンポジウム「細胞システムの動態と論理Ⅶ, 埼玉, 2015年4月2,3日. (Oral & Poster)

  30. 井上健太郎, 篠原久明, 岡田眞里子, BCRシグナリングによるNFkBの振動とスイッチライク応答のシステム解析, 生命動態合同シンポジウム, Poster No.7 , 京都, 2015年3月16,17日. (Poster)

  31. Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Mariko Okada-Hatakeyama, System analysis for oscillation and switch-like response of NF-kappaB in B cell, The Third BMIRC International Symposium, Poster No.12, Fukuoka, March 5-6, 2015. (Poster)

  32. Noorlin Mohd Ali, Daisuke Koishi, Kentaro Inoue,  Hiroyuki Kurata, Genetic Modification Flux (GMF): A tool to predict flux distribution of mutants, The Third BMIRC International Symposium, Poster No.7, Fukuoka, March 5-6, 2015. (Poster)

  33. *井上健太郎, 実験とシミュレーションによるシグナル伝達システムのダイナミクス解析, 早稲田大学浜田研究室主催第２回講演会, 東京, 2015年2月24日. (Oral)

  34. 井上健太郎, NF-kBシグナル伝達経路のモデリング, 第7回定量生物学の会, Poster No.49 , 福岡, 2015年1月11,12日. (Poster)

  35. 井上健太郎, 篠原久明, 岡田眞里子, 動力学モデルによる転写因子NFkB活性の振動およびデジタル応答の制御メカニズム解明, 第３回生命医薬情報学連合大会, Poster No.C-05 , 仙台, 2014年10月2-4日. (Poster) Received the Excellent Poster Award.

  36. Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Marcelo Behar, Alexander Hoffmann, Mariko Okada-Hatakeyama, Kinetic modeling of NF-kappaB signaling pathway, Poster No. O06, 22nd Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2014), Boston, USA, July 13-15, 2014. (Poster)

  37. 井上健太郎, NFkBシグナル伝達系の速度論モデル, 理研シンポジウム「細胞システムの動態と論理Ⅵ」, 埼玉, 2014年4月3,4日. (Oral)

  38. Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Mariko Okada-Hatakeyama, Dynamic modeling of NF-kB signaling system in B cell, The Second BMIRC International Symposium, Poster No. 4, Fukuoka, January 29-30, 2014. (Poster)

  39. Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Mariko Okada-Hatakeyama, Dynamic modeling of NF-kB signaling system in B cell, Genome Informatics Workshop (GIW2013), Poster No.13 , Singapore, December 16-18, 2013. (Poster)

  40. Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Marcelo Behar, Alexander Hoffmann, Mariko Okada-Hatakeyama, Dynamic modeling for NF-kB signal transduction system, Poster No.P1-0112, 第３６回分子生物学会年会, 神戸, 2013年12月3日. (Poster)

  41. Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Mariko Okada-Hatakeyama, System analysis for NF-kB signal transduction pathway, The 2nd Joint Conference on Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology, Poster No. 76, Tokyo, October 29-31, 2013. (Poster)

  42. Noorlin Mohd Ali, Kentaro Inoue, Hiroyuki Kurata, Database for predicting a metabolic flux distribution within a cell, 情報処理学会第35回バイオ情報学研究会, Hokkaido, September 19-20, 2013. (Oral)

  43. 井上健太郎, システム生物学の合成的アプローチ, 東京工業大学瀬々研究室セミナー, 東京, 2013年8月20日. (Oral)

  44. Kentaro Inoue, Kazuhiro Maeda, Takaaki Miyabe, Hiroyuki Kurata, CADLIVE Toolbox for MATLAB: Comprehensive Analysis Tool for Dynamic Models in Systems Biology, The First BMIRC International Symposium, Poster No., Fukuoka, February 28- March 1, 2013. (Poster)

  45. Noorlin Mohd Ali, Ryo Tsuboi, Yudai Matsumoto, Daisuke Koishi, Kentaro Inoue, Hiroyuki Kurata, Data Preparation in Analyzing Metabolic Fluxes, The First BMIRC International Symposium on Frontiers in Computational Systems Biology and Bioengineering, Poster No., Fukuoka, February 28- March 1, 2013. (Poster)

  46. Kentaro Inoue, Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata, CADLIVE: Mathematical Modeling, simulation, parameter estimation and robustness analysis on MATLAB, Genome Informatics Workshop (GIW2012), Poster No.P-43, Tainan, December 12-14, 2012. (Poster)

  47. Noorlin Mohd Ali, Ryo Tsuboi, Yudai Matsumoto, Daisuke Koishi, Kentaro Inoue, Hiroyuki Kurata, Integrating Heterogeneous Omics Data to Analyze Metabolic Networks, Poster No. 718, 第35回分子生物学会年会, 福岡, 2012年12月11-14日. (Poster)

  48. Kentaro Inoue, Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata, CADLIVE: Mathematical Model Construction on MATLAB, Joint Conference on Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology, Poster No. B83_31, Tokyo, October 15-17, 2012. (Poster)

  49. 井上健太郎、倉田博之、スペクトラルクラスタリング改良法のタンパク質相互作用ネットワークへの適用、CMRU研究会"ネットワーク科学の数理と展開"、宮城、2012年9月13-14日. (Poster)

  50. Shinichi Shimozono, Kentaro Inoue, Hiroyuki Kurata, Efficient Grid Graph Layout by Approximate Point-set Matching on the Plane, 情報処理学会第30回バイオ情報学研究会, Fukuoka, August 9, 2012. (Oral)

  51. Noorlin Mohd Ali, Kentaro Inoue, Soma Tabata, Hiroyuki Kurata, The effect of implementing objective functions in analyzing the changes of enzyme activity profiles, 情報処理学会第30回バイオ情報学研究会, Fukuoka, August 9, 2012. (Oral)

  52. Kentaro Inoue, Sinichi Shimozono, Hiroyuki Kurata, Grid layout algorithm for biochemical networks using approximate pattern matching, International Conference on Bioinformatics (InCoB2011), Poster No. 229, Kuala Lumpur, Malaysia, November 30 - December 2, 2011. (Poster & selected oral presentation)

  53. Kentaro Inoue, Sinichi Shimozono, Hiroyuki Kurata, Hybrid Grid Layout Algorithm For Biochemical Network Maps, The 2011 Joint conference of CBI & JSBi, Poster No. JSBi-13, Hyogo, November 8-10, 2011. (Poster & selected oral presentation)

  54. Kentaro Inoue, Shinichi Shimozono, Hideaki Yoshida and Hiroyuki Kurata,  Hybrid Layout Algorithm using Approximate Pattern Matching in Two Dimensional Space for Biochemical Network Layout, 情報処理学会第24回バイオ情報学研究会,  Kyoto, March 10-11, 2011. (Oral)

  55. Kentaro Inoue, Kazuhiro Maeda, Yuki Kato, Hiroyuki Kurata, CADLIVE: A platform for network modeling and simulation of biological pathway, The proceedings of the 2010 annual conference of the Japanese Society for Bioinformatics, Poster No. P6, Fukuoka, December 13-15, 2010. (Poster)

  56. Kentaro Inoue, Sayaka Tomeda, Shinpei Tonami, Hideaki Yoshida, Shin Shimozono, Hiroyuki Kurata, CADLIVE: Data Converter with Network Layout programs, The 11th International Conference on Systems Biology (ICSB2010), Poster No. P02.550, Edingburgh, October 10-15, 2010. (Poster)

  57. Kentaro Inoue, Hiroyuki Kurata, A novel spectral clustering of protein interaction networks, International Conference on Bioinformatics (InCoB2010), Poster No. 15(#122), Tokyo, September 26-28, 2010. (Poster) Received the Best Poster Award.

  58. Kentaro Inoue, Hiroyuki Kurata, Adjustable diffusion matrix-based spectral clustering for protein-protein interaction network, The 20th International Conference on Genome Informatics (GIW2009), Poster No. P064, Yokohama, December 14-19, 2009. (Poster)

  59. Sayaka Tomeda, Sinpei Tonami, Kentaro Inoue, Kazuhiro Maeda, Hiroyuki Kurata, Extended CADLIVE: Multi-user Framework and Data Integrator, The 20th International Conference on Genome Informatics (GIW2009), Poster No. S004, Yokohama, December 14-19, 2009. (Software demonstration)

  60. 前田和勲、井上健太郎、留田紗彌可、倉田博之、CADLIVE: 生化学ネットワーク構築からシステム解析まで、統合データベースプロジェクトシンポジウム「データベースが拓くこれからのライフサイエンス」、東京、2009年6月12日. (Poster)

  61. Kentaro Inoue, Weijiang Li, and Hiroyuki Kurata, Modular decomposition based spectrum for protein-protein interaction network, 情報処理学会第17回バイオ情報学研究会,  Okinawa, May 25-26, 2009. (Oral)

  62. Kentaro Inoue, Tetsuya Shimabara, Toshikazu Onaka, Erika Fujiura, Hiroyuki Kurata, Extended CADLIVE: Computer-aided rational design of living systems, The  2008 annual conference of the Japanese Society for Bioinformatics, Poster No. S02-1-2, Osaka, December 15-16, 2008. (Software demonstration)

  63. Kentaro Inoue, Shogo Takagi, Sayaka Tomeda, Masayo Ono, Hiroyuki Kurata, CADLIVE : An integrative system of life information, The 2007 annual conference of Japanese Society for Bioinformatics, Poster No. S1, Tokyo, December, 17-19, 2007. (Software demonstration)

  64. Yuki Shimokawa, Kazuhiro Maeda, Kentaro Inoue, Hiroyuki Kurata, CADLIVE: Integration for large-scale network data, The Seventeenth International Conference on Genome Informatics 2006 (GIW2006), Poster No. S02-1-2, Yokohama, December 18-20, 2006. (Software demonstration)

  65. Kentarou Inoue and Hiroyuki Kurata, CADLIVE: Computer-Aided Design of Living Systems, The 7th International Conference on Systems Biology (ICSB-2006), Poster No. F115, Yokohama, October 9-11, 2006.  (Poster)

  66. 深野祐哉、 井上健太郎、 山道俊介、 倉田博之、 細胞周期モデルの機能モジュール展開とシミュレーション、 第28回日本分子生物学会年会、 Poster No. 3P-0183、 福岡、2005年12月7-10日. (Poster)

  67. 井上健太郎、 桐原智恵子、 下川由紀、 倉田博之、包括的生命分子ネットワークのコンピュータ上での再構成、第28回日本分子生物学会年会、Poster No. 3P-0184、福岡、2005年12月7-10日. (Poster)