・書籍［査読有］*Corresponding author

1. Iguchi A, Hongo C (Eds.). Coral Reef Studies of Japan. Springer Nature Singapore. 2018.

• Iguchi A*, Hongo C. Introduction for This Book: General Aspects of the Coral Reefs of Japan. In: Iguchi A, Hongo C (Eds.) Coral Reef Studies of Japan. Springer Nature Singapore. 1-16.    2018.

• Iguchi A*, Hongo C. Concluding Remarks: Future Perspectives on Coral Reef Studies of Japan– From Biology, Earth Science, and Conservation and Restoration. In: Iguchi A, Hongo C (Eds.) Coral Reef Studies of Japan. Springer Nature Singapore. 175-176. 2018.

この書籍は、琉球列島を中心とする日本のサンゴ礁研究の最新の知見について、生態学、遺伝学、化学、地学等の様々な視点から捉えた内容となっております。琉球大学のウェブサイトでの紹介はこちら。

2. Suzuki A*, Iguchi A, Sakai K, Hayashi M, Nojiri Y. Succession of Ocean Acidification and its Effects on Reef-Building Corals. Coral Reefs of Eastern Asia under Anthropogenic Impacts. Takeuchi I, Yamashiro H (eds). pp 97–112. 2023.

この書籍は、東アジアにおける最近のサンゴ礁の変遷を概説し、造礁サンゴ類を対象とした実験研究等を踏まえて、工業化が進んだ海域におけるサンゴ礁維持・成立におけるの新たな視点を提示しています。鈴木・井口らの分担執筆では、主に海洋酸性化と造礁サンゴ類の研究を中心に、これまでの知見について概説しました。

・書籍［査読無］*Corresponding author

1. 井口亮*・喜瀬浩輝．「3‒2 腹足類を中心とするベントスの生態─遺伝子解析によるアプローチ」．里海フィールド科学-京都の海に学ぶ人と自然の絆-．山下洋・益田玲爾・甲斐嘉晃・鈴木啓太・高橋宏司・邉見由美 編著．2022年10月．

この書籍は、京都大学舞鶴水産実験所が、里海を舞台に人と自然の絆とその恵みを未来につなぐ方策を探るために、科学的知見を取りまとめたものです。井口・喜瀬の分担執筆では、日本海の腹足類の遺伝子解析研究を中心に、これまでの知見について概説しました。

・学術雑誌に発表した原著論文［査読有］*Corresponding author

・Accepted, In press

1. Hamamoto K*, Mizuyama M, Nishijima M, Maeda A, Gibu K, Poliseno A, Iguchi A*, Reimer JD. Diversity, Composition and Potential Roles of Sedimentary Microbial Communities in Different Coastal Substrates around Subtropical Okinawa Island, Japan. Environmental Microbiome accepted.

2. Ohno Y, Takahashi A, Tsutsumi M, Kubota A, Iguchi A, Iijima M, Mizusawa N, Nakamura T, Suzuki A, Suzuki M, Yasumoto J, Watabe S, Sakai K, Nemoto T, Yasumoto K. Live imaging of center of calcification formation during septum development in primary polyps of Acropora digitifera. Frontiers in Marine Science accepted.

・2024

3. Kamata M, Kitano YF, Iguchi A, Nozawa Y, Nagai S, Chen A, Wada N, Tang SL, Yamakita T, Taninaka H, Yasuda N*. Genetic divergence of Pocillopora damicornis between temperate and subtropical regions: the need to monitor hidden genetic lineage distribution with regard to migration-load risks under climate change. Bulletin of Marine Science online first 2024.

4. Manullang C*, Tarigan A, Iguchi A, Nakamura T. Intraspecific variation in response to elevated pCO2 and temperature in the branching reef coral Acropora digitifera from different habitats. Coral Reefs online first 2024. 酸性化海水と高温ストレスのサンゴへの複合影響を個体群レベルで評価するために、経験水温の異なる地点からのコユビミドリイシ集団を用いた飼育実験を実施した。その結果、石灰化速度は2つの地点で異なり、顕著な違いが観察されたのは水温が比較的低い地点の群体のみで、特にコントロールと酸性化海水処理で顕著な違いが観察された。これらの種内変動は、順化、特定の遺伝子型の影響、あるいは群体の表現型の可塑性といった要因から生じる可能性がある。

5. Iguchi A*, Nishijima M, Ikeuchi E, Yokooka H, Sugishima H, Ikeda K, Miwa R, Sekido Y, Iwasaki N, Suzumura M, Tsukasaki A, Tanaka Y, Kato S, Minatoya J, Okamoto N, Kunishima T, Ise Y, Suzuki A*. Utilizing environmental DNA and imaging to study the deep-sea fish community of Takuyo-Daigo Seamount. npj Biodiversity 3:14, 2024. 北西太平洋の海山の一つにおいて、環境DNA手法と、画像観察で得られた結果を比較した。その結果、画像観察では捉えられない海山周辺の深海性魚種を環境DNAによって検出した。また、天然の「大量濾過装置」であるカイメン類に、海水の環境DNAと同等の深海性魚類の検出数を確認した。今回実施した手法は、海山における環境ベースラインの効率的な調査への貢献が期待される。産総研からのプレスリリース記事はこちら。鉄鋼新聞。

6. Kise H*, Saito N, Gibu K, Asato M, Kita T, Matsuzaki K, Iguchi A*. Population structure and genetic connectivity of the big blue octopus Octopus cyanea in the Ryukyu Archipelago, Japan. Aquatic Conservation: Marine and Freshwater Ecosystems 34:e4153, 2024. 琉球列島において水産重要種であるワモンダコ集団を対象に、遺伝的集団構造解析と幼生分散シミュレーションと組み合わせた解析を実施した。その結果、八重山集団は沖縄島集団から孤立する傾向が見られたが、全体としては高い遺伝的多様性が維持されており、個体群間の頻繁な遺伝的交流が示唆された。

7. Hamamoto K, Iguchi A*, Gibu K, Ozawa H, Kojima M, Mizuno S, Yoshioka Y, Saito N, Fujita Y*. Asymmetric patterns of genetic population structures in a mangrove whelk at the range edges. Science of the Total Environment 934:173248, 2024. K. Hamamoto and A. Iguchi contributed equally to this work. インド太平洋に広く分布するキバウミニナを対象に、分布中心の集団と縁辺集団の遺伝的集団構造比較を、先行研究のデータも合わせて行った。その結果、2000 km以上地理的に離れているにも関わらず遺伝的な隔離がないこと、南北の辺縁集団で歴史的な維持過程が異なっていることが示唆された。

8. Iguchi A*, Gibu K, Yorifuji M, Nishijima M, Suzuki A, Ono T, Matsumoto Y, Inoue M, Fujii M, Muraoka D, Fujita Y, Takami H. Transgenerational acclimation to acidified seawater and gene expression patterns in a sea urchin. Science of the Total Environment 930:172616, 2024. 海洋酸性化に対する世代間応答を明らかにするために、成熟ウニを用いた二世代飼育実験を酸性化海水中で行った。馴化した親ウニ由来の幼生は、酸性化した海水中で高い生存率を示し、サイズ減少も少なかった。また、馴化した親と馴化していない親由来の幼生間で異なる遺伝子発現パターンが観察され、酸性化海水への抵抗性に関与している可能性が示唆された。

9. Hisatsune K, Murata T, Taniguchi M, Asano T, Ogata K, Iguchi A, Zaitsu K*. Development of a rapid-fire drug screening method by probe electrospray ionization tandem mass spectrometry for human urine (RaDPi-U). Analytical and Bioanalytical Chemistry 416:2503-2513, 2024. 微量な尿試料から、薬物犯罪捜査において最も重要度の高い40種類の薬物を、たった3分で迅速に分析可能な手法「RaDPi-U」を開発した。簡単な3つの手順で結果が得られるため、分析に不慣れな人でも利用可能であり、薬物犯罪捜査や急性薬物中毒の薬物分析などへの貢献が期待される。産総研からのプレスリリース記事はこちら。マイナビニュース・日経新聞・MONist。

10. Ikeuchi E*, Iguchi A, Nakamura T, Fukami H. Seasonal variation of grazing scars on massive Porites corals in Sekisei Lagoon, Okinawa, Japan. Galaxea, Journal of Coral Reef Studies 26:3-8, 2024. 日本最大のサンゴ礁であり、季節変動が明瞭な石西礁湖において、塊状ハマサンゴ類の深度、魚類による齧り痕の比率、光合成効率の関係を調べた。光合成効率と齧り痕の比率の頻度に季節変動があること、水温が低い時期には、光合成効率の高い群体は、光合成効率の低い群体よりも、齧り痕からの回復が速い可能性が示唆された。

11. Iguchi A*, Iijima M, Mizusawa N, Ohno Y, Yasumoto K, Suzuki A, Suga S, Tanaka K, Zaitsu K*. Single-polyp metabolomics for coral health assessment. Scientific Reports 14:3369, 2024. 微細試料の分析が可能なPESI/MS/MSを用いることで、小さなサンゴポリプ１個での内因性代謝プロファイルの取得を実現し、化学物質がサンゴの内因性代謝に及ぼす影響を迅速かつ簡便に評価可能になった。今回確立された評価手法は、人為起源物質の影響軽減に向けた代替物質探索や、成長増加・代謝促進のようなポジティブな影響評価に活用されることが期待される。産総研からのプレスリリース記事はこちら。環境ビジネスオンライン・週刊粧業。

12. Hamamoto K, Iguchi A*, Gibu K, Ozawa H, Fujita Y. A discovery of the northernmost population of the giant mangrove whelk Terebralia palustris (Mollusca: Gastropoda: Potamididae) on Zamami Island and its genetic variability. Plankton and Benthos Research 19:60-65, 2024. マングローブ域によく見られるキバウミニナは、これまで日本の宮古島から報告された個体群が本種の最北の個体群として認識されてきたが、慶良間諸島の座間味島から新たな個体群を発見し、その特徴及び遺伝的集団構造について報告した。

13. Maruyama R, Yasumoto K, Mizusawa N, Iijima M, Yasumoto-Hirose M, Iguchi A, Hermawan OR, Hosono T, Takada R, Song K-H, Shinjo R, Watabe S, Yasumoto J*. Metagenomic analysis of the microbial communities and associated network of nitrogen metabolism genes in the Ryukyu limestone aquifer. Scientific Reports 14:4356, 2024. 沖縄県南部地域の地下水の水質分析及びメタゲノム解析を実施した。サイト間で異なる微生物群集を有していること、あるサイトでは脱窒酵素遺伝子と共に硝酸還元酵素遺伝子を持つ微生物が増加しており、硝酸還元が地下水中の硝酸性窒素の減少に関わっている可能性が示された。琉球大学からのプレスリリース記事はこちら。

14. Iguchi A*, Hayashi M, Yorifuji M, Nishijima M, Gibu K, Kunishima T, Bell T, Suzuki A, Ono T. Whole transcriptome analysis of demersal fish eggs reveals complex responses to ocean deoxygenation and acidification. Science of the Total Environment 917:169484, 2024. 海洋酸性化・貧酸素化の複合影響に対するシロギス卵の遺伝子発現を網羅的に評価した。遺伝子発現に対する貧酸素化の影響は海洋酸性化よりも顕著であった。貧酸素海水区では、解糖系に関与する遺伝子群の発現が増加しており、酸素欠乏によって電子伝達経路が働きにくくなった結果、解糖系を動かすことで、ATPの産生を補おうとしているためと考えられた。また、貧酸素と酸性化海水の複合条件区では、発現変化が対照区と類似している遺伝子も多く見られ、見かけ上緩和されていることが示された。産総研からのプレスリリース記事はこちら。環境新聞・日刊工業新聞・朝日新聞1・朝日新聞2。

15. Maeda A*, Nishijima M, Iguchi A, Ota Y, Suzumura M, Suzuki A. Environmental DNA metabarcoding of foraminifera for biological monitoring of bottom water and sediments on the Takuyo-Daigo Seamount in the northwestern Pacific. Frontiers in Marine Science 10:1243713, 2024. 環境DNAメタバーコーディング解析を用いて、拓洋第5海山周辺にて採取された海水および堆積物コアで同定された浮遊性および底生有孔虫群集の時間的または垂直的な変化を評価した。海水試料では、浮遊性有孔虫群集の大まかな時間的変動が見られた。底生有孔虫の系統では単孔虫類が最も多かった。検出された有孔虫の塩基配列は堆積物層が深いほど減少したが、これは生きた個体数の減少と堆積物中のDNAの劣化の両方を反映している可能性などが考えられた。

16. Ota Y*, Iguchi A, Nishijima M, Mukai R, Suzumura M, Yoshioka H, Suzuki A, Tsukasaki A, Aoyag i T, Hori T. Methane diffusion affects characteristics of benthic communities in and around microbial mat-covered sediments in the northeastern Japan Sea. Chemosphere 349:140964, 2024. 日本海東部に位置する酒田沖のメタン湧出域における微生物マット周辺の底生大型動物群集の特徴と地球化学的パラメータとの関係を調べた。その結果、メタンの拡散は堆積物の酸化還元条件と有機物供給に影響を与えること、DNAメタバーコーディング解析により、環形動物が優占する底生生物群集は、硫化物の多い堆積物と関連していること、微生物マットの外の環境は内部よりも生物多様性が高いことが明らかとなった。

17. Kushida Y*, Kise H, Iguchi A, Fujiwara Y, Tsuchida S. Description of the fifth sea pen species that attaches to hard substrates by modifying its peduncle. Deep-Sea Research Part I 203:104212, 2024. 日本の深海の海洋保護区から発見されたウミエラ類の1新種、Anthoptilum gnome sp.nov.について記載するとともに、そのミトコンドリアゲノム及び系統的位置についても報告した。産総研からのプレスリリース記事はこちら。GSJ地質ニュース。

・2023

18. Ishida-Castañeda J*, Iguchi A, Sakai K. Changes in DNA methylation in response to heat stress and symbiotic conditions in coral primary polyps. Marine Ecology Progress Series 714:113-117, 2023. 褐虫藻との共生と高温ストレスが、サンゴのDNAメチル化に及ぼす影響を調べるために、コユビミドリイシの初期ポリプを用いた評価を実施した。その結果、褐虫藻との共生状態では、DNAメチル化の程度が減少すること、また、高温ストレスでは共生状態でDNAメチル化の程度が増加することが明らかとなった。

19. Ishida H*, Mukai R, Ikeuchi E, Kise H, Nishijima M, Iguchi A, Suzuki A, Suzumura M. Preliminary study on the acute effects of hydrogen sulfide on Amphipoda (Lysianassoidea; Pseudorchomene sp. and Anonyx sp.) collected from deep-sea floors in the Sea of Japan. Marine Pollution Bulletin 192:115102, 2023. 深海域のメタンハイドレート域から深海性端脚類を採取し、DNAバーコーディングでAnonyx sp.とPseudorchomene sp.として推定種を絞り込んで、硫化水素暴露実験を行った。その中でPseudorchomene sp.は、飼育実験環境下では1年以上生息できたこと、硫化水素暴露実験では沿岸域の端脚類より比較的高い耐性を示すことが明らかとなり、深海性生物の暴露実験系の対象として優れていることが示された。

20. Washburn TW*, Iguchi A, Yamaoka K, Nagao M, Onishi Y, Fukuhara T, Yamamoto Y, Suzuki A. Impacts of the first deep-sea seafloor massive sulfide mining excavation tests on benthic communities. Marine Ecology Progress Series 712:1-19, 2023. 沖縄トラフで実施された熱水鉱床掘削試験における、攪乱前と攪乱後3年までの近傍の複数の観測点における埋在性底生生物の動態と環境変化との関連を調べた。潮流の方向と地形が採掘の影響の範囲に大きく影響すること、大型の大型動物相は小型の動物相よりも採掘の影響に対する抵抗力や回復力が弱い可能性が示唆された。Feature articleに選出。

21. Manullang C, Singh T, Sakai K*, Miyagi A, Iwasaki A, Nojiri Y, Iguchi A. Separate and combined effects of elevated pCO2 and temperature on the branching reef corals Acropora digitifera and Montipora digitata. Marine Environmental Research 188:106030, 2023. 酸性化海水と高温ストレスのサンゴへの複合影響を評価するために、コユビミドリイシとエダコモンサンゴを用いた飼育実験を実施した。その結果、2種ともに酸性化海水よりも高温ストレスに対して鋭敏ではあったが、コユビミドリイシの方がより顕著な影響を受けた。複合ストレス区では、高温ストレスの方が死亡率増加や石灰化低下の主な要因であり、その影響は両種において相加的であった。

22. Kise H*, Santos MEA, Fourreau CJL, Iguchi A, Goto R, Reimer JD. Evolutionary patterns of host switching, lifestyle mode, and the diversification history in symbiotic zoantharians. Molecular Phylogenetics and Evolution 182:107732, 2023. スナギンチャク類29属27種を対象に、ミトコンドリア・核DNAマーカー配列を用いた、これまでで最も包括的な分子系統解析により、宿主交換のパターンと多様化の歴史を調べた。その結果、宿主交換を繰り返しながら多様化してきたこと、新しい宿主へのコロニー形成が、スナギンチャク類の形態的・生態的特殊化を促進したことなどが示された。

23. Suda K*, Sakamoto S, Iguchi A, Tamaki H. Novel quantitative method for individual isotopomer of organic acids from 13C tracer experiments determines carbon flow in acetogenesis. Talanta 257:124328, 2023. 酢酸生成菌の代謝反応における炭素の流れを調べるために、13Cトレーサー実験で生成する個々の酢酸およびギ酸アイソトポマーの相対量を簡便かつ正確に決定する方法を開発した。 水性試料直接注入法を用いたGC-MSと最小二乗法による質量スペクトル分析によりアイソトポマーの個々の存在量を計算することが可能となり、開発した手法を、メタノールと重炭酸塩で培養した酢酸菌の炭素固定機構の研究に適用した。 

24. Afzal MS, Takeuchi K, Iguchi A, Sakai K, Dirgantara D, Nakamura T*. An assessment of Ryukyu Archipelago's coral communities over a wide latitudinal range. Deep Sea Research Part II 208:105270, 2023. 琉球列島のサンゴ群集の詳細なベースライン評価を行うために、琉球列島の6地域において、底生生物群集を比較調査を行った。全体としては、17科55属のサンゴが記録され、サンゴ群集組成の詳細把握に成功した。これらの結果は、琉球列島のサンゴ群集の現状を明らかにし、将来の生態系の変化を比較できるような、広域的な生態系のベースラインデータを提供するものである。

25. Kise H, Iguchi A*, Saito N, Yoshioka Y, Uda K, Suzuki T, Nagano AJ, Suzuki A, Iwasaki N. Genetic population structure of the precious coral Corallium japonicum in the Northwest Pacific. Frontiers in Marine Science 10:1052033,2023. H. Kise and A. Iguchi contributed equally to this work. 宝石珊瑚の1種であるアカサンゴの集団遺伝解析を行った結果、基本的には本研究で調べた地理的範囲では遺伝子流動が広く維持されているが、幼生分散シミュレーションと組み合わせた解析により、遺伝的に他の集団と異なるいくつかの集団が見つかり、地理的に限られた遺伝子流動が示唆された。本研究で得られた情報は、アカサンゴの保全・持続的利用を図るために必要となる、ベースラインデータとして活用されることが期待される。産総研からのプレスリリース記事はこちら。毎日新聞。

26. Wada N, Iguchi A, Urabe Y, Yoshioka Y, Abe N, Takase K, Hayashi S, Kawanabe S, Sato Y, Tang SL*, Mano N*. Microbial mat compositions and localization patterns explain the virulence of black band disease in corals. npj Biofilms and Microbiomes 9:15, 2023. サンゴの黒帯病（BBD）の移動速度が異なるサンプルを対象に、マイクロスケールでの表面構造、細菌組成、空間分布が異なることを明らかにした。移動速度は、BBDマット内の中間層に局在するArcobacteraceaeに属する細菌種の相対量と正の相関があり、Rhodobacteraceaeに属する細菌種の相対量とは負の相関が見られ、BBDの微生物組成が病原性の重要な決定因子であることが明らかになった。

27. Kise H*, Nishijima M, Iguchi A, Minatoya J, Yokooka H, Ise Y, Suzuki A. A new hexactinellid sponge-associated zoantharian from the northwestern Pacific Ocean. ZooKeys 1156:71–85, 2023. 拓洋第5海山の深海域から採取された、カイメン類と共生するスナギンチャク類の新属・新種である、Parachurabana shinseimaruae Kise, gen. nov. et sp. nov.について、形態学的観察及び遺伝子解析のデータを合わせて報告した。

28. Kise H, Iguchi A*, Ikegami T, Onishi Y, Goto K, Tanaka Y, Washburn TW, Nishijima M, Kunishima T, Okamoto N, Suzuki A. Genetic population structures of common scavenging species near hydrothermal vents in the Okinawa Trough. Scientific Reports 13:2348, 2023. H. Kise and A. Iguchi contributed equally to this work. 沖縄トラフに存在する熱水噴出孔周辺で採取された海洋ベントス複数種（魚類、十脚類、端脚類）を対象とした遺伝子解析を実施した。端脚類に関しては、分子同定から複数の推定種を抽出し、個体数が多く見られたグループを絞り込んだ。そして分子集団遺伝学的解析を実施し、基本的な遺伝的多様性情報と連結性パターンの把握を行い、将来の広域での連結性解析に向けた情報基盤を固めた。

29. Singh T, Sakai K*, Ishida J, Iguchi A. Short-term improvement of heat tolerance in naturally growing Acropora corals in Okinawa. PeerJ 11:e14629, 2023. 高温ストレスによるサンゴの耐熱性の向上可能性を野外で明らかにすることを目的として、自然生育のサンゴ群体のモニタリングを行った。高温ストレスの程度は、2016年より2017年の方が最小ながら有意に高かったが、同じ群体では2016年より白化および死滅が少なかった。また、2016年に部分死亡を起こした群体は、2016年に部分死亡を起こさなかったコロニーに比べ、2017年に高い割合で完全白化したことから、野外においても、高温ストレスによって、サンゴ共生体の耐熱性が改善された可能性が示唆された。

・2022

30. Hibino Y, Iguchi A, Zaitsu K*. Preliminary study to classify mechanisms of mitochondrial toxicity by in vitro metabolomics and bioinformatics. Toxicology and Applied Pharmacology 457:116316, 2022. ヒト肝がん由来細胞株のHepG2細胞に、毒性機序が異なるミトコンドリア毒性化合物を曝露してメタボローム解析を行い、得られた多変量データ解析を実施した。その結果、ミトコンドリア毒性の機序を判別する指標分子を特定することに成功し、創薬研究における医薬品の新たな毒性評価法確立への応用が期待される。産総研からのプレスリリース記事はこちら。日刊工業新聞・日経バイオテク。

31. Kitade S, Endo N, Nogata Y, Matsumura K, Yasumoto K, Iguchi A, Yorisue T*. Faint chemical traces of conspecifics delay settlement of barnacle larvae. Frontiers in Marine Science 9:983389, 2022. フジツボのキプリス幼生の着生を誘起する化学物質の一つとして知られる、海水溶存性着生誘起フェロモン（WSP）の濃度による効果を調べるために、タテジマフジツボを対象とした実験を行った。その結果、WSPは、低濃度では着生を誘起せず、着生を抑制する働きを持つことを明らかとなった。低濃度のWSP刺激はキプリス幼生にとって、同種個体が存在する生息に適した着生場所が比較的離れた場所に確実に存在するという情報となり、着生場所の探索を継続させていると考えられた。産総研からのプレスリリース記事はこちら。日本の研究.com。

32. Kushida Y*, Imahara Y, Wee HB, Fernandez-Silva I, Fromont J, Gomez O, Wilson N, Kimura T, Tsuchida S, Fujiwara Y, Higashiji T, Nakano H, Kohtsuka H, Iguchi A, Reimer JD. Exploring the trends of adaptation and evolution of sclerites with regards to habitat depth in sea pens. PeerJ 10:e13929, 2022. 八放サンゴ亜綱ウミエラ目における生息水深帯の変遷に伴う骨片の適応と進化の傾向を明らかにするために、浅海域から深海域に生息するウミエラ類を網羅的に採集し、形態観察・分子系統解析・祖先形質の復元解析・統計解析を実施した。その結果、ウミエラ類およびその骨片の多様化は水深と関係があることが明らかとなり、異なる環境に進出するタイミングで骨片の多様化が生じていることが明らかとなった。プレスリリース：琉球大学・立正大学・筑波大学・JAMSTEC。日本の研究.com。

33. Gibu K, Ikeuchi E, Bell T, Nakamura T, Yoshioka Y, Suzuki A,  Iguchi A*. Calcification rates of a massive and a branching coral species were unrelated to diversity of endosymbiotic dinoflagellates. Molecular Biology Reports 49:9101–9106, 2022. K. Gibu and E. Ikeuchi contributed equally to this work. サンゴの成長率に共生藻類の多様性がどのように影響するかを把握するために、成長率が顕著に異なる種内系統のサンプルを用いたメタバーコーディング解析を行った。その結果、今回対象としたコユビミドリイシ・ハマサンゴに関しては、褐虫藻の多様性は種間では顕著に異なったものの、種内では明瞭な変異は見られず、成長率との関連は見られなかった。

34. Kise H*, Moritaki T, Iguchi A, Reimer JD. Epizoanthidae (Hexacorallia: Zoantharia) associated with Granulifusus gastropods (Neogastropoda: Fasciolariidae) from the Indo-West Pacific. Organisms Diversity & Evolution 22:543–554, 2022. 腹足類と共生するヤドリスナギンチャク科について、形態観察と分子系統解析を組み合わせて分類学的研究を行った。その結果、対象標本とその近縁種間の系統関係が明らかとなり、さらに北西太平洋からヤドリスナギンチャク属1種を新種記載した。

35. Ohno Y, Iguchi A*, Iijima M, Yasumoto K, Suzuki A. Coastal ecological impacts from pumice rafts. Scientific Reports 12:11187, 2022. 小笠原諸島で集中的な海底火山噴火が発生し、その約2ヶ月後に噴火地点から西に1300km離れた琉球列島の沖縄島沿岸に未曾有の量の軽石がもたらされた。本研究では、沖縄本島北部における、海岸の砂浜、河口、サンゴ礁、マングローブ林などに大規模な軽石の浅瀬化による生態系の変化を示す初期の証拠を報告した。産総研からのプレスリリース記事はこちら。日本の研究.com・日刊工業新聞・読売新聞・GSJ地質ニュース。

36. Zaitsu K*, Kawakami D, Chang J, Hisatsune K, Taniguchi M, Asano T, Iguchi A*. Metabolomics and data-driven bioinformatics revealed key maternal metabolites related to fetal lethality via Di(2‐ethylhexyl)phthalate (DEHP)-exposure in pregnant mice. ACS Omega  27:23717–23726, 2022. 健康被害が懸念されているDEHP（フタル酸ビス(2-エチルヘキシル)）の生体影響評価のために、DEHP曝露マウスと対照妊娠マウスの血清メタボローム解析を行った。血清中の169種類の代謝物を検出することに成功し、機械学習によって、DEHP曝露の16の潜在的バイオマーカーを決定できた。また、ネットワーク解析により、ニコチン酸が代謝ネットワークにおいて最も影響力のあるハブ代謝物であることが示された。

37. Iijima M, Yasumoto J, Mori-Yasumoto K, Yasumoto-Hirose M, Iguchi A, Suzuki A, Mizusawa N, Jimbo M, Watabe S, Yasumoto K*. Visualisation of phosphate in subcalicoblastic extracellular calcifying medium and on a skeleton of coral by using a novel probe, fluorescein-4-isothiocyanate-labelled alendronic acid. Marine Biotechnology 24:524–530, 2022. リン酸塩がサンゴ石灰化阻害をどのように引き起こすかを明らかにするために、リン酸塩の新規蛍光プローブであるFluorescein‐4‐Isothiocyanate‐Labelled Alendronic Acid (FITC-AA)を合成し、サンゴ初期ポリプを用いて検証した。その結果、リン酸塩はサンゴポリプの細胞内を通過せず、細胞間の隙間を通過し骨格表面に吸着することが明らかになった。

38. Yamakita T*, Sodeyama F, Iguchi A, Kitano YF, Teshima KM, Shimura A, Nakabayashi A, Nagai S, Nakamura T, Aizawa H, Yasuda N. Consideration of Genetic Structure in the Ecologically and Biologically Significant Marine Areas (EBSA) Criteria: A Review of Convention on Biological Diversity (CBD) Regional Workshops and A Case Study of Coral Reef Conservation Planning. Frontiers in Marine Science 9:823009, 2022. 生物多様性条約（CBD）の生態学的または生物学的に重要な海洋地域（EBSA）の選定において、サンゴの遺伝情報を用いて検討を進めた。その結果、遺伝的指標を用いない指標では熱帯域の重要地域が多く抽出されたが、遺伝的指標を用いることで温帯域を含む重要地域が特定できることが明らかとなった。

39. Maeda A*, Kuroyanagi A, Iguchi A, Gaye B, Rixen T, Nishi H, Kawahata H. Seasonal variation of fluxes of planktic foraminiferal tests collected by a time-series sediment trap in the central Bay of Bengal during three different years. Deep-Sea Research Part I 83:103718, 2022. 浮遊性有孔虫の群集を制御する要因と、堆積物記録における気候・海洋過程の指標としての可能性を検討するために、ベンガル湾の堆積物トラップ試料を用いて解析を行った。その結果、堆積物トラップ試料から、28種の浮遊性有孔虫が検出され、群集構造とフラックスの季節性の詳細を把握することに成功した。

40. Bell T, Manullang C, Sakai K, Suzuki A, Iguchi A*. Near-future levels of pCO2 impact skeletal growth of coral primary polyps (Acropora digitifera). Galaxea, Journal of Coral Reef Studies 24:63-68, 2022. サンゴ一斉産卵時に得られたサンゴポリプを用いて、pCO2濃度を調整した海水（現在：約400 ppm・近未来：約600 ppm）におけるサンゴの成長量を評価した結果、近未来レベルでも石灰化が有意に低下することが確認された。

41. Bell T, Manullang C, Kumagai NH, Sakai K, Suzuki A, Iguchi A*. Calcification responses of subtropical corals to ocean acidification: a case study from Sesoko Island, Okinawa, Japan. Galaxea, Journal of Coral Reef Studies 24:51-61, 2022. 瀬底島周辺で見られるサンゴ6種を対象に、環境条件をほぼ均一にして複数段階の酸性化海水に暴露した結果、種間差に起因すると思われる石灰化応答パターンの変異が明らかとなった。

42. Baird AH*, Edwards AJ, Guest JR, Harii S, Hatta M, Lachs L, ...Iguchi A, ...Yamazato K. A coral spawning calendar for Sesoko Station, Okinawa, Japan. Galaxea, Journal of Coral Reef Studies 24:41-49, 2022. これまで沖縄県・瀬底島で観察されてきたサンゴ類の産卵パターンの概要を把握するために、これまでの産卵データを統合してデータペーパーとして取りまとめた。その結果、瀬底島における大まかな分類群に対応したサンゴ産卵パターンを把握することに成功した。

・2021

43. Shinzato C, Takeuchi T, Yoshioka Y, Tada I, Kanda M, Broussard C, Iguchi A, Kusakabe M, Marin F, Satoh N, Inoue M. Whole-genome sequencing highlights conservative genomic strategies of a stress-tolerant, long-lived scleractinian coral, Porites australiensis Vaughan, 1918. Genome Biology and Evolution 13:evab270, 2021. 長い寿命と高いストレス耐性で特徴づけられるハマサンゴの遺伝的基盤を明らかにするために、その全ゲノムを解読した。その結果、他のサンゴのゲノムと同程度の品質のゲノムアセンブリと遺伝子モデルを構築することに成功し、ハマサンゴを特徴づける遺伝子群の全容を把握することに成功した。 

44. Kawakami D, Tsuchiya M, Murata T, Iguchi A, Zaitsu K*. Rapid quantification of extracellular neurotransmitters in mouse brain by PESI/MS/MS and longitudinal data analysis using the R and Stan-based Bayesian state-space model. Talanta 231:122620, 2021. マウス脳内の細胞外神経伝達物質をPESI/MS/MSで迅速に定量し、RとStanベースのベイズ状態空間モデルを用いて経時的なデータ解析を行う新規手法を開発した。マウス線条体における細胞外のL-グルタミン酸（L-Glu）とγ-アミノ酪酸（GABA）の定量を、プローブエレクトロスプレーイオン化/タンデム質量分析法（PESI/MS/MS）とin vivo脳マイクロダイアリシスを併用することで、迅速に行うことが可能となった。産総研からのプレスリリース記事はこちら。

45. Fujita J*, Drumm DT, Iguchi A, Tominaga O, Kai Y, Yamashita Y. Small vs. large eggs: comparative population connectivity and demographic history along a depth gradient in deep-sea crangonid Argis shrimps. Biological Journal of the Linnean Society 134:650-666, 2021. 日本海を中心に採取されたArgis属を対象とした詳細な分子集団遺伝学的解析を行い、その遺伝的集団構造の把握と卵サイズによる分散能力の差異との関連について議論した。 

46. Iguchi A*, Tada I, Nagano AJ, Yasuda N. Genetic structure of Pacific crown-of-thorns starfish (Acanthaster cf. solaris) in southern Japan based on genome-wide RADseq analysis. Coral Reefs 40:1379-1385, 2021. サンゴの捕食者として知られるオニヒトデの北限域の集団を対象に、ゲノムワイドでの遺伝的変異を検出可能なRAD-seq解析を実施し、遺伝子流動及び遺伝的多様性の把握を行った。その結果、北限域においても遺伝子流動が頻繁に行われており、遺伝的多様性も高く保たれていることが明らかとなった。

47. Takata K, Iwase F, Iguchi A, Yuasa H, Taninaka H, Iwasaki N, Uda K, Suzuki T, Nonaka M, Kikuchi T, Yasuda N*. Genome-wide SNP data revealed notable spatial genetic structure in the deep-sea precious coral Corallium japonicum. Frontiers in Marine Science 8:667481. 2021. 宝石サンゴの1種であるアカサンゴを対象に、高知県沖にてゲノムワイドでの遺伝的変異を検出可能なMIG-seq解析による遺伝的集団構造の把握を試みた。そして有意な集団構造を検出できる地理的範囲とそのために必要となるSNPsの把握に成功した。

48. Fujita J*, Iguchi A, Tohkairin A, Hamatsu T, Kai  Y. First record of the deep-water Argis toyamaensis yokoya, 1933 (Decapoda, Crangonidae) in the sea of Okhotsk, based on mitochondrial DNA sequences. Crustaceana 94:507-511, 2021. オホーツク海で採取されたトゲザコエビを形態及びミトコンドリアDNAで精査し、その詳細について報告した。

49. Iijima M, Yasumoto J, Iguchi A, Koiso K, Ushigome S, Nakajima N, Kunieda Y, Nakamura T, Sakai K, Yasumoto-Hirose M, Mori-Yasumoto K, Mizusawa N, Amano H, Suzuki A, Jimbo M, Watabe S, Yasumoto K*. Phosphates bound to calcareous sediments hamper skeletal development of juvenile coral. Royal Society Open Science 8:201214. 2021. 底質に含まれるリン酸塩がサンゴの石灰化に及ぼす影響を明らかにするために、沖縄島北部及び南部地域の市街地や農地に近い沿岸域の石灰質の砂を採取し、砂と共にコユビミドリイシの稚サンゴを飼育した。その結果、場所によっては砂から飼育海水に約20 µMと高濃度のリン酸塩が溶出し、稚サンゴの骨格形成を妨げることが示された。本研究により、石灰質の底質のリン酸塩・蓄積型栄養塩がサンゴの生育に負の栄養を及ぼすことを明らかとなった。産総研からのプレスリリース記事はこちら。沖縄タイムス・琉球新報・日刊工業新聞・日刊ケミカルニュース・日本の研究.com・環境展望台。

50. Baird AH*, Guest JR, Edwards AJ, Bauman AG, Bouwmeester J, Mera H, ...Iguchi A, ...Yusuf S. An Indo-Pacific coral spawning database. Scientific Data 8:35. 2021. サンゴ最大のイベントである産卵現象の概要を把握するために、これまで世界中で観察されてきたサンゴ類の産卵データを統合し、データペーパーとして取りまとめた。今後のサンゴ産卵現象の包括的理解に向けたベースラインとしての活用が期待される。

・2020

51. Manullang C, Herwindra I, Iguchi A, Miyagi A, Tanaka Y, Nojiri Y, Sakai K*. Responses of branching reef corals Acropora digitifera and Montipora digitata to elevated temperature and pCO2. PeerJ 8:e10562. 2020. 琉球列島でよく見られるサンゴ2種、コユビミドリイシとエダコモンサンゴを対象に、高温ストレスと酸性化海水に対する生理的応答を評価した。その結果、種間で顕著な応答の違いが確認され、共生藻の遺伝子型の違いなどが関与していることが示唆された。

52. Yorisue T*, Iguchi A, Yasuda N, Yoshioka Y, Miyagi A, Mizuyama M, Fujita Y. Extensive gene flow among anchialine cave habitats in a stygobitic shrimp. Royal Society Open Science 7:191731. 2020. 琉球列島の海底洞窟に多く見られるリュウグウモエビを対象に、ゲノムワイドでの遺伝的変異を検出可能なMIG-seq解析による遺伝的集団構造の把握を行った。その結果、対象種が海底洞窟という非常に特異的な生息地に見られるにも関わらず、海底洞窟間で遺伝子流動が広く維持されていることが明らかとなった。

53. Yorisue T*, Iguchi A*, Yasuda N, Yoshioka Y, Sato T, Fujita Y. Evaluating the effect of overharvesting on genetic diversity and genetic population structure of the coconut crab. Scientific Reports 10:10026, 2020. T. Yorisue and A. Iguchi contributed equally to this work. 琉球列島に広く生息し、食用にもなる大型甲殻類ヤシガニを対象に、サイズによる個体群構造と遺伝子マーカーによる遺伝的集団構造の把握を行った。その結果、島間で遺伝子流動が広く維持されている一方で、人為的影響による体サイズ減少と性比の偏りが生じていることなどが明らかとなった。産総研からのプレスリリース記事はこちら。日本の研究.com・八重山毎日新聞・環境展望台・つくばサイエンスニュース・沖縄タイムス・朝日新聞 。GSJ English site。GSJ地質ニュース。Scientific Reports Top 100 in Ecology 2020に選出。

54. Zaitsu K*, Eguchi S, Ohara T, Kondo K, Ishii A, Tsuchihashi H, Kawamata T, Iguchi A. PiTMaP: A new analytical platform for high-throughput direct metabolome analysis by probe electrospray ionization/tandem mass spectrometry using an R software-based data pipeline. Analytical Chemistry 92:8514–8522, 2020. ハイスループットかつ直接メタボローム解析が可能なPESI/MS/MSと、ソフトウェアRによるデータ処理を合わせた新規の分析プラットフォーム、"PiTMaP"を確立した。本プラットフォームでは、前処理操作を行うことなく、臓器などの試料から直接、エネルギー代謝に関わる72の代謝産物を2.4分でプロファイリングでき、多変量解析や有意差検定を含めたデータ解析を1分以内に処理できる。さらに、肝臓障害モデルマウスの肝臓、および悪性度が異なるヒト髄膜腫の脳試料に対してPiTMaPを適用し、その有効性を確認した。産総研からのプレスリリース記事はこちら。日本の研究.com・科学新聞。GSJ English site.

55. Sanmiya K*, Koja Y, Iguchi A. The cloning of cDNAs for the Heat-shock Transcription Factors HSFA1, HSFA2, and HSFA3 from Tobacco. Tropical Agriculture and Development 64:34-40, 2020. タバコのストレス応答に関連する新規遺伝子の抽出のために、高温ストレス暴露サンプルを用いた遺伝子クローニングを行った。その結果、熱ショック因子であるHSFA1・HSFA2・HSFA3のクローニングに成功し、その遺伝子系統関係についても把握した。

56. Iguchi A*, Nishijima M, Yoshioka Y, Miyagi A, Miwa R, Tanaka Y, Kato S, Matsui T, Igarashi Y, Okamoto N, Suzuki A. Deep-sea amphipods around cobalt-rich ferromanganese crusts: taxonomic diversity and selection of candidate species for connectivity analysis. PLoS ONE 15:e0228483, 2020. コバルトリッチクラスト周辺での連結性解析に用いるための端脚類の候補種を選定するために、北太平洋・南鳥島南東沖の海山から採取した標本を用いてDNAバーコーディング解析を実施した。その結果、Abyssorchomene属の1種を候補種として定めた。本種を用いてRAD-seq解析を実施し、一塩基多型での変異が十分に観察され、今後の連結性解析に使用可能であることが明らかとなった。

57. Mizuyama M*, Iguchi A, Gibu K, Iijima M, Reimer JD. Comparison of Symbiodiniaceae diversities in different members of a Palythoa species complex (Cnidaria: Anthozoa: Zoantharia) – implications for ecological adaptations to different microhabitats. PeerJ 8:e8449, 2020. 琉球列島の潮間帯に見られるイワスナギンチャク属種群を対象に、種間での褐虫藻の遺伝子型組成の変異について調べた。その結果、種間で褐虫藻の遺伝子型組成に偏りが見られ、各種の生息環境との関連が示唆された。

・2019

58. Sakai K*, Singh T, Iguchi A. Bleaching and post-bleaching mortality of Acropora corals on a winners and losers reef in 2016. PeerJ 7:e8138, 2019. 2016年に生じたサンゴ大規模白化現象の際に、沖縄県瀬底島周辺のモニタリングサイトにおけるミドリイシ属サンゴ123群体の変化を追跡した。その結果、白化後の生残率には種間差及び群体サイズでの差が見られた。集団内でも生き残る群体が見られたことから、比較的緩やかな高温ストレス条件下では、ストレス耐性の高い遺伝子型の群体が選抜される可能性が示唆された。

59. Zaitsu K*, Noda S, Ohara T, Murata T, Funatsu S, Ogata K, Ishii A, Iguchi A. Optimal inter-batch normalization method for GC/MS/MS-based targeted metabolomics with special attention to centrifugal concentration. Analytical and Bioanalytical Chemistry 411:6983–6994, 2019. マウス血漿試料を用いて、GC/MS/MSでのメタボローム解析によって得られたデータを対象に、遠心処理及びデータ補正法の影響評価を行った。その結果、遠心処理はバッチ間のデータ変動に大きな影響を及ぼすこと、また、データの補正にはTotal Intensity補正法が有効であることが示された。

60. Iguchi A*, Yoshioka Y, Forsman ZH, Knapp ISS, Toonen RJ, Hongo Y, Nagai S, Yasuda N*. RADseq population genomics confirms divergence across closely related species in blue coral (Heliopora coerulea). BMC Evolutionary Biology 19:187, 2019. アオサンゴ種内で見つかっているHC-A・HC-Bの2系統間の遺伝的分化パターンを、ゲノムワイドでの一塩基多型変異の把握が可能なezRAD法を用いて解析を行った。その結果、2系統がゲノムレベルでも顕著に遺伝的に異なることが明らかとなった。また、各系統に特徴的な形質と関連する候補遺伝子を絞り込み、機能遺伝子レベルでの遺伝的変異の検出にも成功した。

61. Suzuki S*, Ataka M, Djukic I, Enoki T, Fukuzawa K, Hirota M, Hishi T, Hiura T, Hoshizaki K, Ida H, Iguchi A, Iimura Y, Ise T, Tanaka K, Kina Y, Kobayashi H, Kominami Y, Kurokawa H, Kobayashi M, Matsushita M, Miyata R, Muraoka H, Nakaji T, Nakamura M, Niwa S, Noh NJ, Sato T, Seino T, Shibata H, Suzuki R, Takahashi K, Tsunoda T, Utsumi Y, Watanabe K. Harmonized data on early stage litter decomposition using tea material across Japan. Ecological Research  34:575-576, 2019. 幅広い気候帯に属している日本列島にまたがってリター及び土壌有機物の分解速度を統一された手法で評価するために、ティーバッグを用いた手法を適用した。2012年から2016年の間に1904個のティーバッグを用いた評価を日本各地で実施し、各地域の環境データと合わせて取りまとめた。

62. Iguchi A*, Sanmiya K, Watanabe K. Identification of ALMT and MATE as aluminum tolerance candidate genes from a typical acid soil plant, Psychotria rubura (Rubiaceae). PeerJ 7:e7739, 2019. 亜熱帯域から熱帯域にかけて広く分布し、酸性土壌に適応しているアカネ科ボチョウジ属のボチョウジ（Psychotria rubura）のトランスクリプトーム解析を行い、2万個以上の遺伝子を同定した。その中で、酸性土壌への適応に寄与していると考えられるリンゴ酸輸送体（ALMT）とクエン酸輸送体（MATE）に着目し、先行研究との比較を行った。本研究で得られたトランスクリプトームデータは、多様化が進んでいるボチョウジ属の土壌適応の詳細の解明につながることが期待される。

63. Nakabayashi A, Yamakita T, Nakamura T, Aizawa H, Kitano YF, Iguchi A, Yamano H, Nagai S, Agostini S, Teshima KM, Yasuda N*. The potential role of temperate Japanese regions as refugia for the coral Acropora hyacinthus in the face of climate change. Scientific Reports 9:1892, 2019. 亜熱帯域から温帯域にかけて広域に生息するクシハダミドリイシの遺伝子解析を行い、サンゴの地域絶滅リスクを評価した。その結果、温帯域の一部はサンゴの絶滅リスクが低いこと、そして全てのサンゴ種が亜熱帯域から温帯域へ簡単には移動できないことが明らかとなった。産総研からのプレスリリース記事はこちら。日本の研究.com・つくばサイエンスニュース・大学ジャーナル。GSJ地質ニュース。

64. Aihara Y, Maruyama S, Baird AH, Iguchi A, Takahashi S*, Minagawa J*. Green fluorescence from cnidarian hosts attracts symbiotic algae. Proceedings of the National Academy of Sciences 116:2118-2123, 2019. サンゴの蛍光タンパク質と褐虫藻との関わりについて、室内実験、野外実験によって検証し、サンゴの蛍光タンパク質が褐虫藻を誘引することを明らかにした。褐虫藻誘引の動画はこちら。産総研からのプレスリリース記事はこちら。日本の研究.com・朝日新聞・産経新聞・毎日新聞・マイナビニュース。

・2018

65. Kume D*, Iguchi A, Endoh H. Onset of Accelerated Muscle Deoxygenation during 20-m Shuttle Run Test in Boys. Pediatric Exercise Science 30:474-479, 2018. 20mシャトルランの筋酸素動態の把握を子供を対象に行った。その結果、大人の場合と同様に、20mシャトルラン中に筋の脱酸素化応答が変化するポイントがあることが分かったが、変化パターンが大人と異なる場合があることも示唆された。

66. Iwasaki S*, Suzuki A, Iguchi A, Sasaki O, Kano H, Ohno Y, Enomoto K. Effect of seawater turbulence on formation of coral primary polyp skeletons. Coral Reefs 37:939-944, 2018. 水流がサンゴ初期ポリプの成長に及ぼす影響の詳細を明らかにするために、飼育容器の振盪有り無しで褐虫藻の無いポリプの飼育を行い、X線マイクロCTを用いた形態評価を行った。その結果、水流がある方が全体的に成長が速く、骨格の枝も太くなり、水流が褐虫藻獲得前のサンゴの初期生残に影響を与える可能性が示唆された。

67. Zaitsu K*, Noda S, Iguchi A, Hayashi Y, Ohara T, Kimura Y, Koketsu Y, Kosaki T, Kusano M, Sato T, Ishikawa T, Tsuchihashi H, Suzuki K, Ishii A. Metabolome analysis of the serotonin syndrome rat model: abnormal muscular contraction is related to metabolic alterations and hyper-thermogenesis. Life Sciences 207:550-561, 2018. セロトニン症候群（SS）は、選択的セロトニン再取り込み阻害薬の過剰摂取等から脳内セロトニン濃度が上昇して発症するとされるが、作用機序は不明な点が多く、有用なバイオマーカーも存在しない。そこで、SSモデルラットを作成し、血漿、肝臓、腓腹筋及び骨格筋を対象に、体調変化と遺伝子発現パターンを調べるとともに、GC/MS/MSでのメタボローム解析を行った。その結果、モデル群での直腸温の上昇、腓腹筋の異常収縮による嫌気呼吸の亢進が観察され、また代謝産物ネットワークにおける相互作用の挙動等、これらの変化との関連が示唆される代謝産物の変動が見られた。

68. Taira J*, Higa I, Tsuchida E, Isomura N, Iguchi A. Neurotransmitters in hermatypic coral, Acropora spp., and its contribution to synchronous spawning during reproductive event. Biochemical and Biophysical Research Communications 501:80-84. 2018. サンゴの一斉産卵現象に関与する可能性のある神経伝達物質の詳細を明らかにするために、LC/MSを用いた神経伝達物質定量化手法を確立した。この手法を用いて、産卵前後や過酸化水素処理前後で神経伝達物質であるドーパミン・アドレナリン・ノルアドレナリンの変動について評価し、産卵への関与について議論した。沖縄タイムス。

69. Kume D*, Iguchi A, Endoh H. Accelerated point of muscle deoxygenation during the 20-m shuttle-run test. Clinical Physiology and Functional Imaging 38:390-395. 2018. 全身持久力を評価するためのフィールドテストとして幅広く実施されている、20mシャトルランの筋酸素動態の把握を行った。その結果、20mシャトルラン中に筋の脱酸素化応答が加速するポイントがあること、そのポイントは運動パフォーマンスと関連性があることが明らかとなった。

70. Bell T*, Iguchi A,  Suzuki A, Seki A, Yokoyama Y. Testing possible relationships between Acropora digitifera genes, seawater chemistry and skeletal elements. Geochemical Journal 52:263-272. 2018. サンゴの骨格内の化学成分とその組成に関与する可能性のある遺伝子群との関係を把握するために、コユビミドリイシの遺伝子データベースを参考に、各元素の代謝に関与する遺伝子数と海水中の元素組成の関係について調べた。その結果、各元素に関連する遺伝子数は特定の元素で多い傾向があったが、明確な傾向は見られず、今後遺伝子発現量も視野に入れた研究の必要性が浮き彫りとなった。

71. Gushi M, Iguchi A, Takeuchi I*. Spawning of Acropora digitifera in an aquarium as recorded by continuous interval photography using an underwater camera. Plankton and Benthos Research 13:17-20. 2018. 琉球列島周辺で多く見られるサンゴの一種、コユビミドリイシを対象に、ワイパー式メモリー水中カメラを用いて、10分間隔でサンゴ産卵前後の画像データを取得した。得られた画像解析を行うことで、コユビミドリイシの産卵パターンの詳細を把握することに成功し、サンゴの産卵観察における本機器の有効性が示された。

72. Taira J*, Toyoshima R, Ameku N, Iguchi A, Tamaki Y. Vanillin production by biotransformation of phenolic compounds in fungus, Aspergillus luchuensis. AMB Express 8:40. 2018. 泡盛の特徴香気成分としては主にバニリンが知られており、バニリンの生成には微生物が関わっている可能性が示唆されているが、その詳細は明らかではない。本研究では、泡盛生産の過程で使われている黒麹菌のバニリン生成機構の解明を、化学分析とゲノム解析から試みた。その結果、バニリン生成の新しい経路と関連遺伝子の詳細を把握することに成功した。沖縄タイムス。

73. Yorisue T*, Yoshioka Y, Sakuma K, Iguchi A. Evaluating the occurrence of cryptic invasions of a rocky shore barnacle, Semibalanus cariosus, between Japan and the northeastern Pacific. Biofouling 34:183-189. 2018. 沿岸性生物の隠蔽種の侵入の可能性について評価するために、太平洋の東西沿岸域に見られるチシマフジツボを対象とした分子集団遺伝学的解析を実施した。日本のサンプルには、1971年に採取されたサンプルも含めて解析した。その結果、太平洋の東西で遺伝的分化が見られた。日本側の遺伝子型頻度に関しては、現在も過去も顕著な差は見られなかった。そのため、チシマフジツボにおいては、太平洋の東西間での交流は制限されていることが示唆された。

・2017

74. Yoshioka Y, Tanabe T, Iguchi A*. The presence of genes encoding enzymes that digest carbohydrates in coral genomes and analysis of their activities. PeerJ 5:e4087. 2017. サンゴのゲノム情報を活用して、糖質加水分解酵素がサンゴのゲノムに複数存在していること、また、これら酵素の各生活史段階での発現パターンが明らかとなった。また、プレートアッセイにより、複数サンゴ種において、糖質加水分解酵素の活性が確認された。今後、サンゴ由来の糖質加水分解酵素の詳細な生理的役割の解明が望まれる。

75. Bell T, Nishida K, Ishikawa K, Suzuki A, Nakamura T, Sakai K, Ohno Y, Iguchi A, Yokoyama Y*. Temperature controlled culture experiment using primary polyps of Acropora digitifera: their growth rate variation and skeletal Sr/Ca, Mg/Ca and Na/Ca. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology 484:129-135. 2017. コユビミドリイシの初期ポリプを作成し、複数段階の温度区を設定して、 初期ポリプの成長率及び骨格組成（Sr/Ca、Mg/Ca、Na/Ca）を調べた。その結果、骨格成長は各温度区で大きな変異が見られた。初期ポリプ骨格のSr/Caは温度と強い相関を示し、Mg/CaとNa/Caは弱い相関を示した。以上のことから、コユビミドリイシの初期ポリプのSr/Caはロバストな温度指標になることが示唆された。

76. Fujita J*, Drumm DT, Iguchi A, Ueda Y, Yamashita Y, Ito M, Tominaga O, Kai Y, Ueno M, Yamashita Y. Deep-sea phylogeographic structure shaped by paleoenvironmental changes and ongoing ocean currents around the Sea of Japan in a crangonid shrimp Argis lar. Zoological Science 34:406-413. 2017. 北太平洋の深海域に多く見られるクロザコエビを対象に、日本周辺及びオホーツク海、ベーリング海のサンプルを用いて、ミトコンドリアDNAの部分塩基配列を基に分子系統地理解析を行った。その結果、クロザコエビには大きく3つのグループが確認された。グループの一つは日本海に優先し、遺伝的多様性が比較的低かったことから、氷期の日本海の環境変動によって集団の縮小が生じたことが示唆された。また、現在の海流によって、グループ間で交流が部分的に生じていることも示唆された。

77. Sekizawa A, Uechi H, Iguchi A*, Nakamura T, Kumagai NH, Suzuki A, Sakai K, Nojiri Y. Intraspecific variations in responses to ocean acidification in two branching coral species. Marine Pollution Bulletin 122:282-287. 2017. A. Sekizawa, H. Uechi, and A. Iguchi contributed equally to this work. 沖縄島周辺でよく見られる枝状サンゴ2種を対象に、多群体を用いた共通環境実験系により、酸性化海水が石灰化と光合成効率に及ぼす影響評価を行った。その結果、種間・種内でその応答に明確な変異が見られた。本研究の成果は、今後の海洋酸性化進行によって、サンゴ群集がどのように変化 していくのかを予測することや、サンゴ群集修復技術として注目を集めているサンゴ移植技術の高度化への応用が期待される。沖縄高専からのプレスリリース記事はこちら。弘前大学からのプレスリリース記事はこちら。QAB琉球朝日放送・沖縄タイムス。academist Journalでも関連成果の解説を行っています（こちら）。

78. Kuraya E*, Yamashiro R, Touyama A, Nakada S, Watanabe K, Iguchi A, Itoh S. Aroma Profile and Antioxidant Activity of Essential Oil from Alpinia zerumbet. Natural Product Communications 12:1321-1325. 2017. 沖縄在来植物である月桃の精油成分を対象に、GC/MSによって得られた揮発性成分、精油収量、抗菌活性の関係を、個体別、地域別、季節別に分けて評価した。その結果、月桃精油成分の特徴的な化学成分が明らかとなり、その組成は個体差が見られたこと、精油収量と抗菌活性に負の相関関係が見られることが示された。沖縄高専ウェブサイトの記事はこちら。

79. Nakajima Y*, Nishikawa A, Iguchi A, Nagata T, Uyeno D, Sakai K, Mitarai S. Elucidating the multiple genetic lineages and population genetic structure of the brooding coral Seriatopora (Scleractinia: Pocilloporidae) in the Ryukyu Archipelago. Coral Reefs 36:415–426. 2017. 琉球列島のトゲサンゴ属サンゴを対象に、ミトコンドリアDNAマーカーによる系統地理学的解析とマイクロサテライトマーカーによる分子集団遺伝学的解析を行った。その結果、3つの遺伝的に大きく異なる系統群が確認された。また、各系統郡内での遺伝的分化は顕著で、琉球列島における集団間の遺伝的交流は大きく制限されている可能性が示唆された。

80. Nakamura T, Iguchi A*, Suzuki A, Sakai K, Nojiri Y. Effects of acidified seawater on calcification, photosynthetic efficiencies, and the recovery processes from strong light exposure in coral Stylophora pistillata. Marine Ecology 38:e12444. 2017. T. Nakamura and A. Iguchi contributed equally to this work. サンゴ飼育実験でよく用いられているショウガサンゴ複数群体を対象に、5段階の酸性化海水中での石灰化、光合成効率、強光暴露後の回復パターンについて調べた。その結果、どの群体においても、酸性化海水による影響はあまり見られず、今後海洋酸性化が進行しても、本種は影響を受けにくい可能性が示唆された。弘前大学からのプレスリリース記事はこちら。NHK・QAB琉球朝日放送・沖縄タイムス。

81. Ikeuchi E*, Ohno Y, Iguchi A, Nakamura T. Non-bleached colonies of massive Porites may attract fishes for selective grazing during mass bleaching events. PeerJ 5:e3470. 2017. 2016年の大規模サンゴ白化時において、石西礁湖における塊状ハマサンゴ類の白化の割合と、魚類による齧り痕の割合を調べた。その結果、白化しにくいとされる塊状ハマサンゴ類においても、半数近くが白化していたこと、また、魚類による齧り痕は、白化していない群体に多く見られた。このことから、魚類は白化しにくい群体を選択的に齧っていることが示唆された。琉球大学のウェブサイトで紹介されました（こちら）。

82. Ohno Y*, Iguchi A, Shinzato C, Gushi M, Inoue M, Suzuki A, Sakai K, Nakamura T. Calcification process dynamics in coral primary polyps as observed using a calcein incubation method. Biochemistry and Biophysics Reports 9:289-294. 2017.サンゴの骨格形成の時空間動態を明らかにするために、褐虫藻を含まないサンゴポリプを用いて、カルセイン染色によって骨格形成を高解像度で経時的に観察した。その結果、造骨細胞間での骨格形成の可視化や、骨格形成時における石灰化母液の動態を把握することに成功した。

83. Ohno Y*, Iguchi A, Shinzato C, Inoue M, Suzuki A, Sakai K, Nakamura T. Aposymbiotic primary coral polyp counteracts acidification by active pH regulation. Scientific Reports 7:40324. 2017. サンゴが周辺の海水のpH変化にどのように応答しているのかを明らかにするために、褐虫藻を含まないサンゴポリプを用いたpHイメージングを高解像度で行った。その結果、サンゴが能動的に体内pHを変化させて、周辺海水のpH変化に応答していることが明らかとなった。産総研からのプレスリリース記事はこちら。日本の研究.com。産経ニュース・沖縄タイムス。academist Journalでも関連成果の解説を行っています（こちら）。

・2016

84. Fujita J*, Zenimoto K, Iguchi A, Kai Y, Ueno M, Yamashita Y. Comparative phylogeography to test for predictions of marine larval dispersal in three amphidromous shrimps. Marine Ecology Progress Series 560:105-120. 2016. 日本周辺に生息する両側回遊性ヌマエビ類が、どのように集団を維持・形成しているかを明らかにするために、Caridina属3種を対象に、ミトコンドリアCOI遺伝子配列を用いた比較集団解析を行った。その結果、日本周辺と琉球列島周辺で遺伝的に分化している種もいれば、広く交流が維持されている種も見られるなど、集団構造は種間で顕著に異なることが明らかとなり、各種の生態的特徴と関連している可能性が示唆された。

85. Iwasaki S*, Inoue M, Suzuki A, Sasaki O, Kano H, Iguchi A, Sakai K, Kawahata H. The role of symbiotic algae in formation of coral primary polyp skeleton: 3D morphological study based on X-ray micro-CT. Geochemistry, Geophysics, Geosystems 17:3629-3637. 2016. 地球温暖化と海洋酸性化が褐虫藻有り・無しのサンゴ初期ポリプに及ぼす影響の詳細を明らかにするために、X線マイクロCTを用いた形態評価を行った。その結果、褐虫藻を有するポリプでは、基部の石灰化が顕著に促進されていることが明らかとなった。また、酸性化海水でポリプの成長率は顕著に低下するが、骨格密度自体には変化が見られないことなども明らかとなった。

・2015

86. Iguchi A*, Suzuki A, Sakai K, Nojiri Y. Comparison of the effects of thermal stress and CO2-driven acidified seawater on fertilization in coral Acropora digitifera. Zygote 23:631-634. 2015. 地球温暖化と海洋酸性化がサンゴの受精に及ぼす影響を明らかにするために、100年後を想定した高温ストレスと酸性化海水を設定して、コユビミドリイシの受精率に及ぼす影響を調べた。その結果、酸性化海水中では受精率に変化は見られなかったが、高温ストレス下では受精率の低下が見られたことから、地球温暖化の方が、海洋酸性化よりも対象種の受精率に悪影響を及ぼしうることが示唆された。

・2014

87. Iguchi A*, Kumagai NH, Nakamura T, Suzuki A, Sakai K, Nojiri Y. Responses of calcification of massive and encrusting corals to past, present, and future ocean carbon dioxide concentrations. Marine Pollution Bulletin 89:348-355. 2014. A. Iguchi and N.H. Kumagai contributed equally to this work. 塊状及び被覆状のサンゴ種を用いて、海洋酸性化による成長速度への影響を調べる比較実験を行い、6種の海洋酸性化指標に対する応答パターンの違いを比較解析した。解析ではベイズ法の活用により炭酸系パラメータの変動を確率分布としてモデル化することで精度の高い影響推定を可能とした。解析の結果、サンゴの形状や炭酸系パラメータにより海洋酸性化に対する応答が異なることが示された。また酸性化に対し曲線的に成長速度が減少する応答パターンを評価する場合は、ベイズ法によるモデルが優れていることが明らかとなった。

88. Tanaka Y*, Iguchi A, Nishida K, Inoue M, Nakamura T, Suzuki A, Sakai K. Nutrient availability affects the response of juvenile corals and the endosymbionts to ocean acidification. Limnology and Oceanography 59:1468-1476. 2014. 富栄養化と酸性化海水が、着底直後のサンゴ初期ポリプの成長や骨格組成、サンゴ体内の褐虫藻に及ぼす影響について調べた。その結果、富栄養、酸性化海水によって、褐虫藻密度やクロロフィル量、そして成長に複合的に影響を引き起こすことが示唆された。

89. Nishida K, Ishikawa K, Iguchi A, Tanaka Y, Sato M, Inoue M, Nakamura T, Sakai K, Suzuki A*. Skeletal oxygen and carbon isotope compositions of Acropora coral primary polyps experimentally cultured at different temperatures. Geochemistry, Geophysics, Geosystems 15:2840-2849. 2014. 一斉産卵時に得られたコユビミドリイシの配偶子を用いてサンゴ初期ポリプを作成し、複数段階の温度区を設定して、初期ポリプの成長率及び骨格組成を調べた。その結果、初期ポリプの石灰化は温度に対して鋭敏に応答することが明らかとなった。また、初期ポリプの骨格組成を調べ、過去の研究成果とも合わせて、本研究で用いた骨格サンプルにおける温度復元の可能性についても検討を進めた。

90. Nishida K, Iguchi A, Ishimura T, Sakai K, Suzuki A*. The skeletal isotopic responses of the Scleractinian coral Isopora palifera to experimentally-controlled water temperatures. Geochemical Journal 48:e9 - e14. 2014. サンゴ礁域によく見られるニオウミドリイシを対象に、温度を複数段階設定した条件下での飼育実験を行った。その結果、ニオウミドリイシの石灰化は温度変化に対して鋭敏に応答すること、また温度変化と相関のある骨格プロキシの検討を行い、過去の温度復元に本種が適していることが示唆された。

・2013

91. Tanaka Y*, Iguchi A, Inoue M, Mori C, Sakai K, Suzuki A, Kawahata H, Nakamura T. Microscopic observation of symbiotic and aposymbiotic juvenile corals in nutrient-enriched seawater. Marine Pollution Bulletin 68:93-98. 2013. 着底後の幼サンゴの成長を顕微鏡下で観察し、栄養塩負荷や褐虫藻有無の効果を実験的に調べた。その結果、栄養塩によって活性化する底生藻類の被覆によってサンゴの成長が阻害されること、褐虫藻の獲得が底生藻類に対する抵抗力を高めることが示された。幼サンゴの生残や成長を高めるには、早く褐虫藻を獲得できるか、周囲の底生藻類に対する捕食圧は十分か、などの条件が重要になってくると考えられた。

92. Hayashi E, Suzuki A*, Nakamura T, Iwase A, Ishimura T, Iguchi A, Sakai K, Okai T, Inoue M, Araoka D, Murayama S, Kawahata H. Growth-rate influences on coral climate proxies tested by a multiple colony culture experiment. Earth and Planetary Science Letters 362:198-206. 2013. 複数のハマサンゴ群体を、約6年に及ぶ長期飼育実験を行い、骨格の成長速度、骨格の酸素同位体比、Sr/Ca比の変動と水槽で実測された水温等の環境パラメータとの精密対比を行った。同一環境下での飼育にも関わらず、成長率に顕著な群体差が見られた。これらの群体の成長軸に沿う酸素同位体比、Sr/Ca比には、明瞭な季節変化が認められた。群体間の大きな成長速度の差にも関わらず、酸素同位体比、Sr/Ca 比ともに群体間の変異は小さく、気候指標としての安定性が示唆された。

・2012

93. Nakajima Y*, Nishikawa A, Iguchi A, Sakai K. Regional genetic differentiation among northern high-latitude island populations of a broadcast-spawning coral. Coral Reefs 31:1125-1133. 2012. ミドリイシ属サンゴの1種、Acropora sp.1を対象に、マイクロサテライトマーカーを用いて、沖縄島と小笠原間の遺伝的交流関係を調べた。両地域間では、顕著ではないが、有意な遺伝的分化が観察された。遺伝的多様性に関しては、両海域間で差は見られなかった。また、有意なIsolation by distanceが観察されたことから、今回調べた地理的スケールは、対象種の分散範囲を網羅する範囲内で行えたことが示唆された。

94. Inoue M*, Shinmen K, Kawahata H, Nakamura T, Tanaka Y, Kato A, Shinzato C, Iguchi A, Kan H, Suzuki A, Sakai K. Estimate of calcification responses to thermal and freshening stresses based on culture experiments with symbiotic and aposymbiotic primary polyps of a coral, Acropora digitifera. Global and Planetary Change 92-93:1-7. 2012. 褐虫藻有り・無しのサンゴ初期ポリプを作成し、複数段階の温度・塩分濃度を設定して、初期ポリプの石灰化率及び白化率を調べた。全体として、褐虫藻有りの初期ポリプの成長が顕著に速かった。温度変化に対しては、褐虫藻有り無しで、異なる応答パターンが見られた。また、高温ストレス下では、顕著な白化、骨格の微細構造に異常が見られた。塩分濃度変化に対しては、褐虫藻有り無し間で応答パターンに差は見られなかった。

95. Nakajima Y*, Nishikawa A, Iguchi A, Sakai K. The population genetic approach delineates the species boundary of reproductively isolated corymbose acroporid corals. Molecular Phylogenetics and Evolution 63:527-531. 2012. 沖縄島周辺海域で同所的に生息するコユビミドリイシとその隠蔽種だったAcropora sp.1の2種において、系統解析用マーカーによる分子系統解析と、高感度のマイクロサテライトマーカーによる集団解析を行った。その結果、分子系統解析ではこれまでの研究と同様に種間の系統パターンは不明瞭だったが、集団解析においては種間で大きな遺伝的分化が見られ、同所においても生殖隔離が起こっている可能性が示唆された。

96. Iguchi A*, Ozaki S, Nakamura T, Inoue M, Tanaka Y, Suzuki A, Kawahata H, Sakai K. Effects of acidified seawater on coral calcification and symbiotic algae on the massive coral Porites australiensis. Marine Environmental Research 73:32-36. 2012. 海洋酸性化は、多くの石灰化生物に負の影響を及ぼすことが報告されている。本論文では、沖縄周辺のサンゴ礁域に普通に見られる、ハマサンゴを用いて、海洋酸性化が、ハマサンゴの石灰化と共生藻に及ぼす影響について、室内飼育実験によって調べた。その結果、これまでの報告と同様に、ハマサンゴの石灰化は、酸性化海水中では抑制された。ハマサンゴの光合成活性も、酸性化海水中では減少することも示された。また、石灰化及び光合成活性の減少傾向は、群体間で顕著に異なることが示された。

・2011

97. Kaneko N, Kudodera T*, Iguchi A. Taxonomic study of shallow-water octopuses (Cephalopoda: Octopodidae) in Japan and adjacent waters using mitochondrial genes with perspectives on octopus DNA barcoding. Malacologia 54:97-108. 2011. マダコ科に属する34種のタコ類を対象に、主に日本周辺から採集し、また、博物館に保管されている標本も含めて、形態観察及び分子系統解析を行った。基本的には、これまでの分類学的研究を支持する結果が見られた一方で、分類学的位置を再検討する必要性も示唆された。種内の遺伝的変異は、種間の遺伝的変異よりも明らかに小さく、隠蔽種の存在は確認されなかった。得られたデータは、今後タコ類のDNAバーコーディングにも活用されることが期待される。

98. Iguchi A*, Shinzato C, Forêt S, Miller DJ. Identification of fast-evolving genes in the scleractinian coral Acropora using comparative EST analysis. PLoS ONE 6:e20140. 2011. オーストラリアに多く見られるハイマツミドリイシと、カリブ海のAcropora palmataでは、比較的規模の大きい遺伝子データベースが作成されている。これらのデータベースを活用して、加速進化遺伝子がサンゴのゲノムにどの程度存在するのかを調べた。その結果、加速進化遺伝子を複数発見することに成功した。今後これらの候補遺伝子をマーカーとして、サンゴがどのように適応・進化してきたのか、明らかになることが期待される。

・2010

99. Nakajima Y*, Nishikawa A, Iguchi A, Sakai K. Gene flow and genetic diversity of a broadcast-spawning coral in northern peripheral populations. PLoS ONE 5:e11149. ミドリイシ属サンゴの1種、コユビミドリイシを対象に、マイクロサテライトマーカーを用いて、琉球列島全域の遺伝的交流関係及び遺伝的多様性を調べた。少数の地域間で、有意な遺伝的分化が見られたが、基本的には琉球列島全域で遺伝的交流が見られた。遺伝的多様性の変化に関しては、緯度との相関は見られず、分布の最縁辺でも、高い遺伝的多様性が観察され、高い遺伝子流動が縁辺部でも起こっていることが示唆された。2010.琉球大学のウェブサイトで紹介されました（http://www.u-ryukyu.ac.jp/tmp/sokuhou2010062401/）．

100. Morita M, Suwa R*, Iguchi A, Nakamura M, Shimada K, Sakai K, Suzuki A. Ocean acidification reduces sperm flagellar motility in broadcast spawning reef invertebrates. Zygote 18:103-107. 2010. M. Morita, R. Suwa, and A. Iguchi contributed equally to this work. 海洋酸性化が海産無脊椎動物の受精に及ぼす影響を明らかにするために、コユビミドリイシとナマコの1種から精子を採集し、複数段階の酸性化海水下での精子鞭毛運動を顕微鏡下で観察した。実験に用いた2種の精子において、酸性化海水中では明らかな精子鞭毛運動の低下が観察された。海水の二酸化炭素濃度の増加に伴い、精子鞭毛運動の低下が生じた。これらの結果から、将来、海洋酸性化がサンゴの受精能を低下させる可能性があることが示唆された。Top 10 most-read articles (January, 2010). 

101. Morimoto N*, Furushima Y, Nagao M, Irie T, Iguchi A, Suzuki A, Sakai K. Water quality variables across Sekisei reef, a large reef complex in Southwestern Japan. Pacific Science 64:113-123. 2010. サンゴ礁における気候の季節性と地形が水質に及ぼす影響を調べるため、石西礁湖の半閉鎖的な礁湖と開放的な場所とで、濁度とchl・NOx-N・NH4-N濃度を通年で測定した。その結果、濁度とchl濃度の時間変動は礁湖内外で異なり、閉鎖的な礁湖の地形が気候の変化に伴う堆積物の再懸濁などの影響を強めたと推測された。一方、NOx-N・NH4-N濃度の不明瞭な季節性は、礁湖でのその放出と損失の均衡によるものと考えられた。

102. Suwa R, Nakamura M*, Morita M, Shimada K, Iguchi A, Sakai K, Suzuki A. Effects of acidified seawater on early life stages of scleractinian corals (Genus Acropora). Fisheries Science 76:93-99. 2010. 海洋酸性化がサンゴに及ぼす影響を明らかにするために、二酸化炭素濃度を制御した水槽実験系を用い、ミドリイシ属サンゴの初期生活史の酸性化海水への耐性を調べた。その結果、幼生の生存期間への影響は見られなかったが、変態した一次ポリプの成長率と共生藻の取り込み率は酸性化海水中で有意な低下がみられた。これらの結果から、将来、海洋酸性化がサンゴの一次ポリプの成長と共生成立を遅らせる可能性が示唆された。平成25年度日本水産学会論文賞受賞．

・2009

103. Iguchi A, Morita M, Nakajima Y, Nishikawa A, Miller DJ*. In vitro fertilization efficiency in coral Acropora digitifera. Zygote 17:225-227. 2009. これまでのサンゴの受精実験は、高濃度の精子に長時間（4-8時間）卵を曝露しているのが普通であるため、受精率を過剰に見積もっている可能性があった。そこでコユビミドリイシを対象に、卵を精子に曝露する時間を割り振って受精率を調べたところ、30分以上の曝露時間で、受精率が飽和に達することが分かった。今後のサンゴの受精実験では、卵を精子に曝露するのは1時間程度にするのが望ましいことが示唆された。

104. Nakajima Y*, Nishikawa A, Iguchi A, Sakai K. Novel and cross-species amplifiable microsatellite markers in two Acropora species. Plankton and Benthos Research 4:38-41. 2009. ミドリイシ属サンゴ2種（コユビミドリイシ、Acropora sp. 1）を対象に、異種間で適用可能なマイクロサテライトマーカーの開発及び探索を行った。コユビミドリイシから開発された新規マーカー1種類及び、他のミドリイシ属サンゴから開発された既存のマーカー5種類、計6種類のマーカーが、上記2種に適用可能であることが示された。ミドリイシ属サンゴにおいては、新規のマーカー開発だけでなく、既存のマーカーを利用することも考慮すべきであることが示された。

105. Nakajima Y*, Nishikawa A, Isomura N, Iguchi A, Sakai K. Genetic connectivity of the broadcast-spawning coral Acropora digitifera analyzed by microsatellite markers in the Sekisei Reef, southwestern Japan. Zoological Science 26:209-215. 2009. 表層海流によるシミュレーションによって、石西礁湖内の南北両地域間で幼生の交流が隔てられている可能性を検証するために、コユビミドリイシを対象に、マイクロサテライトマーカーを用いて石西礁湖内での遺伝的交流関係の把握を試みた。解析の結果、コユビミドリイシでは、南北両地域間では明瞭な遺伝的分化は見られず、石西礁湖全体では遺伝的交流が保たれていることが示唆された。

106. Morita M*, Iguchi A, Takemura A. Roles of calmodulin and Calcium/calmodulin-dependent protein kinase in flagellar motility regulation in the coral Acropora digitifera. Marine Biotechnology 11:118-123. 2009. サンゴの精子鞭毛運動の分子基盤について調べ、免疫染色、Ca2+オーバーレイアッセイにより、精子にはカルモジュリン（CaM）とカルシウム／カルモジュリン依存性タンパクキナーゼ（CaMK）の存在が確認された。また、CaMとCaMKの阻害剤によって、活性化された精子鞭毛運動が阻害された。サンゴは動物の進化系統樹の基底に位置することから、CaMとCaMKはサンゴを含む動物全般の精子鞭毛運動において重要な役割を果たしていることが示唆された。

・2008

107. Shinzato C, Iguchi A, Hayward DC, Technau U, Ball EE*, Miller DJ*. Sox genes in the coral Acropora millepora: divergent expression patterns reflect differences in developmental mechanisms within the Anthozoa. BMC Evolutionary Biology 8:311. 2008. 動物の進化系統樹の基底に位置し、単純な体制を示すサンゴの1種、ハイマツミドリイシを対象に、Sox遺伝子群の構造解析及び発現解析を行い、サンゴとイソギンチャクとの間で比較を行った。その結果、Soxは、サンゴの神経分化などの役割を担っていることが分かった。また、サンゴとイソギンチャクの間で、Soxの発現パターンが著しく異なるものも見られ、刺胞動物の系統内でも発生過程に大きな変化が生じた可能性が示唆された。Featured article, highly accessed article. 

108. Iguchi A, Ueno M, Maeda T, Minami T, Toyohara H*, Hayashi I. Molecular-based method to distinguish sympatric deep-sea whelks, Buccinum striatissimum and Buccinum tenuissimum in the Sea of Japan. Plankton and Benthos Research 3:101-103. 2008. 日本海の代表的な水産重要種であるエッチュウバイ、オオエッチュウバイは、形態からの識別が困難である場合が多い。これら2種が、ミトコンドリアの16SrRNA遺伝子配列では明らかに異なることに注目して、PCR-RFLP法によって、簡便に識別できる手法を開発した。また、同所的に2種が採集される地点のサンプルを用いた遺伝子解析も行い、これら2種が同所的に生息して生殖隔離されている可能性があることも示した。

109. Knack B, Iguchi A, Shinzato C, Hayward DC, Ball EE, Miller DJ*. Unexpected diversity of cnidarian integrins: expression during coral gastrulation. BMC Evolutionary Biology 8:136. 2008. B. Knack and A. Iguchi contributed equally to this work. 動物の進化系統樹の基底に位置し、単純な体制を示すサンゴの1種、ハイマツミドリイシを対象に、integrin遺伝子群の構造解析及び発現解析を行った。その結果、サンゴには予想以上に多くの種類のintegrinが存在し、また、いくつかのintegrinは、原腸陥入に関わるような発現パターンを示すことも分かった。これらの結果から、多様化したintegrin遺伝子群が、刺胞動物において重要な機能を担っていることが示唆された。

・2007

110. Iguchi A, Márquez LM, Knack B, Shinzato C, van Oppen MJH, Willis BL, Hardie K, Catmull J, Miller DJ*. Apparent involvement of a β1-type integrin in coral fertilization. Marine Biotechnology 9:760-765. 2007. A. Iguchi and L.M. Marquez contributed equally to this work. 哺乳類の受精において、精子と卵の膜の結合と融合に関わるとされるintegrinが、サンゴの受精にも関わっているかどうかを調べた。ハイマツミドリイシから同定され、卵での発現が確認されたintegrin α、integrin βのうち、integrin βの抗体を用いて、受精時にintegrin βの機能を阻害させると、受精現象は正常に進行せず、integrin βがサンゴの受精に関わっていることが分かり、integrinの受精への役割は、多くの動物で保存されている可能性が示唆された。ミドリイシの産卵写真がMarine Biotechnology誌の表紙として掲載。

111. Iguchi A*, Ito H, Ueno M, Maeda T, Minami T, Hayashi I. Molecular phylogeny of the deep-sea Buccinum species (Gastropoda: Buccinidae) around Japan; inter- and intraspecific relationships inferred from mitochondrial 16SrRNA sequences. Molecular Phylogenetics and Evolution 44:1342-1345. 2007. 日本海の代表的な深海生物であるエゾバイ属腹足類の種分化過程を明らかにするために、日本周辺で採集されたエゾバイ属8種を対象に、ミトコンドリアDNAの部分塩基配列を基に分子系統解析を行った。その結果、それらが4つのグループに分かれ、グループ内では亜種程度の分化である一方で、グループ間では明らかに種レベルで分かれていることを示し、そのグループが殻の形態と陰茎の形態で特徴づけられることを明らかにした。"Deep-Sea Biodiversity: Pattern and Scale" (Michael A. Rex and Ron J. Etter eds. Harvard University Press)で紹介された。

112. Iguchi A*, Takai S, Ueno M, Maeda T, Minami T, Hayashi I. Comparative analysis on the genetic population structures of the deep-sea whelks Buccinum tsubai and Neptunea constricta in the Sea of Japan. Marine Biology 151:31-39. 2007. 日本海に優占するツバイとチヂミエゾボラ両種の遺伝的集団構造の比較解析を行った。その結果、ツバイとチヂミエゾボラとで日本海への侵入と分布拡大のタイミングが異なることで、両種の間に集団構造の差異が生じたことが示唆された。また、ツバイの地域集団の分岐年代を推定した結果、42万年以上前と推定され、これまで氷期の環境変動によって何度も環境悪化を受けた日本海において、ツバイが生き延びた可能性が示された。"Deep-Sea Biodiversity: Pattern and Scale" (Michael A. Rex and Ron J. Etter eds. Harvard University Press)で紹介された。

・2006

113. Morita M*, Nishikawa A, Nakajima A, Iguchi A, Sakai K, Takemura A, Okuno M. Eggs regulate sperm flagellar motility initiation, chemotaxis, and inhibition in the coral, Acropora digitifera, A. gemmifera, and A. tenuis. Journal of Experimental Biology 209:4574-4579. 2006. ミドリイシ属サンゴ3種を対象に、精子鞭毛運動の観察を行った。今回用いた3種の精子は、海水中では静止していたが、それぞれの種の卵の近くでは精子鞭毛運動の開始が見られた。一方で、異なる種の卵では精子鞭毛運動は生じず、種特異性があることが確認された。また、精子が卵に大量に付くと、卵から精子鞭毛運動を停止する物質が放出されることも分かり、一斉産卵を行うサンゴの繁殖様式に適応していると考えられた。

・2005

114. Iguchi A, Ito H, Ueno M*, Maeda T, Minami T, Hayashi I. Morphological analysis of a deep-sea whelk Buccinum tsubai in the Sea of Japan. Fisheries Science 71:823-828. 2005. 日本海に広く生息するエゾバイ科エゾバイ属腹足類の一種、ツバイを対象に、計測形質を基にして、雌雄間並びに、ミトコンドリアDNAの部分塩基配列によって区別される4地域集団間で形態比較を行った。その結果、ツバイには雌雄二型があることが示された。また、4地域間で見られた形態的差異は、遺伝的なものか、あるいは4地域間の環境の差異による表現型の可塑性が関与していることが示唆された。

・2004

115. Iguchi A*, Ueno M, Maeda T, Minami T, Hayashi I. Genetic population structure of the deep-sea whelk Buccinum tsubai in the Japan Sea. Fisheries Science 70:569-572. 2004. 日本海に広く生息するエゾバイ科エゾバイ属腹足類の一種、ツバイの遺伝的集団構造を調べるために、日本海の各地点から採集された個体を用いて、ミトコンドリアDNAの部分塩基配列を基に比較した。分子系統樹は4つのクラスターからなり、4つの地域集団が確認された。ツバイの主要生息水深は200mから1000mの間であるが、4つの地域集団は主要生息水深の水平的な幅が狭まる、あるいは欠如している場所で分かれていることが示唆された。本研究で示された地域集団の明瞭な遺伝的分化は、本種の資源管理の指針作りにおける基礎情報となることが期待される。

・学術雑誌に発表した総説［査読有］*Corresponding author

1. Zaitsu K*, Eguchi S, Iguchi A. Bioinformatics and data science for mass spectrometric data analysis. Medical Mass Spectrometry 7:17-25. 2023. 本総説では、質量分析データを用いた著者らの先行研究を中心に概説し、一般的に使用されているバイオインフォマティクスやデータサイエンスのツールについても紹介し、その応用に関する今後の展望を述べた。

2. Kawahata H*, Fujita K, Iguchi A, Inoue M, Iwasaki S, Kuroyamagi A, Maeda A, Manaka T, Moriya K, Takagi H, Toyofuku T, Yoshimura T, Suzuki A. Perspective on the response of marine calcifiers to global warming and ocean acidification – Behavior of corals and foraminifera in a high CO2 world “hot house”. Progress in Earth and Planetary Science 6:5. 2019. 本総説は、サンゴと有孔虫の地球的規模の環境変化に対する石灰化応答について、これまで著者らが実施してきた室内飼育実験、同位体分析、高解像度顕微鏡観察による成果を含めて概説した内容である。The Most Downloaded Paper Award 2020に選出（詳しくはこちら）・The Most Cited Paper Award 2022に選出（詳しくはこちら）。

3. Iguchi A*. Unveiling molecular basis of fertilisation in scleractinian corals using extensive genomic information. Current Bioinformatics 9:182-187. 2014. 本総説では、現在拡大が進んでいるサンゴのゲノム情報を活用して、サンゴの受精の分子基盤をどのように明らかにしうるかについて述べた。これまで哺乳類などで分かっている受精に関与する遺伝子群に着目して行う候補遺伝子アプローチ、あるいは、受精に関わる遺伝子が加速進化しやすいことに着目して、網羅的に近縁種間での相同遺伝子を比較する手法について概説し、今後の方向性について述べた。

4. 井口亮*・磯村尚子．造礁サンゴの環境変化に対する順応機構と適応の可能性．海の研究 21:175-186. 2012. サンゴの環境変化に対する応答を調べた研究や総説は多く存在する一方で、サンゴの順応的応答に関する解説は限られている。本総説では、環境変化に対するサンゴの順応的応答及びその機構について、種々の環境要因毎に分けて、これまで行われてきた室内実験の結果や、応募者らの研究成果も合わせて概説した。また、環境の変化に応じて、集団内の遺伝子型の変化が生じてストレス耐性の閾値が変化する、適応の可能性についても触れた。

5. Iguchi A*. A review of genetic intra- and interspecific relationships of deep-sea Buccinum and Neptunea species around Japan (with special reference to the Sea of Japan). Plankton and Benthos Research 5:83-89. 2010.  本総説は、応募者が日本周辺、特に日本海を中心に、DNAマーカーを用いてこれまで明らかにしてきた深海性エゾバイ・エゾボラ属腹足類の遺伝的な種内分化と種間関係についてレビューしたものである。基本的な内容は、応募者がこれまで出した5本の原著論文の研究成果をまとめたものであり、今後の同分野での研究の方向性について述べた。本総説は、応募者が受賞した、2009年度日本ベントス学会奨励賞の総説論文である。

6. 諏訪僚太・中村崇・井口亮・中村雅子・守田昌哉・加藤亜記・藤田和彦・井上麻夕里・酒井一彦・鈴木淳*・小池勲夫・白山義久・野尻幸宏．海洋酸性化がサンゴ礁域の石灰化生物に及ぼす影響．海の研究 19:21-40. 2010. R. Suwa, T. Nakamura, and A. Iguchi contributed equally to this work. 海洋酸性化が海洋酸性化が起こる仕組みと共に、海洋酸性化がサンゴ礁域の石灰化生物に与える影響に関するこれまでの知見を概説した。サンゴ礁の主要な石灰化生物である造礁サンゴや紅藻サンゴモ、有孔虫に関しては、その石灰化機構を解説し、海洋酸性化が及ぼす影響について調べた様々な研究例を取り上げた。また、これまでの研究から見えてきた海洋酸性化の生物への影響評価実験を行う上で注意すべき事項、そして今後必要となる研究の方向性についても述べた。

7. 諏訪僚太*・井口亮. 造礁性サンゴに共生する褐虫藻の分子系統学的研究に関するレビュー（北西太平洋を中心に）．日本サンゴ礁学会誌 2008年12月号．10:1-11. 2008. R. Suwa and A. Iguchi contributed equally to this work. 本総説では、造礁サンゴに共生する褐虫藻を対象とした、分子系統学的手法による北西太平洋でのこれまでの研究成果を基に、他の地域と比較した場合の同海域の褐虫藻の遺伝子型の分布パターンなどについて概説した。また、これまで褐虫藻の遺伝子型決定に用いられてきた分子生物学的手法の問題点にも触れ、今後の同分野での研究の方向性について述べた。

8. Forêt S, Kassahn K, Grasso LC, Hayward DC, Iguchi A, Ball EE, Miller DJ*. Genomic and microarray approaches to coral reef conservation biology. Coral Reefs 26:475-486. 2007. 本総説では、これまでサンゴを含む刺胞動物で得られている遺伝子データベースやゲノム配列などのゲノム情報について概説し、サンゴ礁生物を対象としたマイクロアレイ解析及び比較ゲノミクス的アプローチの応用可能性について述べた。また、加速遺伝子探索を含む、サンゴのストレス応答機構の解明にはこれらのアプローチが非常に有効であり、生命現象の理解に根差したサンゴ礁保全の指針作りにも重要であることについても触れた。

・学術雑誌に発表した資料等［査読有］*Corresponding author

1. 池内絵里*・鈴木克明・井口亮・鈴木淳．トカラ列島周辺の深海域における表層堆積物の微生物群集構造．地質調査研究報告 73:323-328. 2022.［概報］トカラ列島近海の海洋地質調査（GB21-1）で採集された表層堆積物中の微生物群集の遺伝子解析を実施した。その結果、多くのDNA配列がProteobacteria門のGammaproteobacteriaとAlphaproteobacteriaに属し、次にActinobacteriota門に属すること、また、微生物群集構造は、深度帯や基質の種類によってグループ化される傾向が見られた。

2. 池内絵里*・井口亮・中村崇．塊状ハマサンゴ群体の非白化部位に集中した魚類によるかじり取り痕．沖縄生物学会誌 56:53-56. 2018. ［資料］沖縄県奥武島に見られた塊状ハマサンゴ群体を1年間モニタリングした結果、群体内に白化の回復が異なる、あるいはブダイ類によるかじり痕密度が異なる部位が混在していることが確認された。

・学術雑誌に発表した総説［査読無］*Corresponding author

1. 小埜恒夫*・村岡大祐・林正裕・依藤実樹子・鈴木淳・井口亮・藤井賢彦・Patrick Bernardo Lawrence．沿岸域における海洋酸性化と貧酸素化の複合影響評価．沿岸海洋研究．60:85-88．2022年8月．本総説では、海洋酸性化・貧酸素化複合影響飼育実験および被験個体の網羅的遺伝子発現解析、沿岸域におけるpH・溶存酸素濃度モニタリングおよび数値モデルを用いた沿岸域 pH・溶存酸素濃度の将来予測について、現在までに行われている研究と得られた知見について紹介した。

2. 井口亮*・水山克・頼末武史・藤田喜久．遺伝子解析による琉球列島の海底洞窟性生物群集の多様性と集団形成・維持機構に関する研究の現状と今後の課題．TAXA．46:28-33． 2019年3月．本総説では、海底洞窟あるいは類似環境に生息している生物種の遺伝子解析の事例を紹介しつつ、主に群集・個体群レベルでの今後の研究課題について述べた。

3. 鈴木淳*・井口亮・酒井一彦・中村崇・藤田和彦・田中泰章・入江貴博・加藤亜記・大野良和・林正裕・山本雄三・磯野良介・諏訪遼太・井上麻夕里・野尻幸宏．海洋酸性化がサンゴなどの石灰化生物に与える影響評価実験．月刊海洋．50:237-246．2018年6月．本総説では、これまで筆者らが行ってきた海洋酸性化プロジェクト関連の成果をまとめると同時に、石灰化動態の詳細を把握することが可能なライブセルイメージングなど、最新の研究手法を用いた今後の研究の方向性についても述べた。

3. 宇田幸司*・井口亮・鈴木知彦．宝石サンゴの遺伝子研究─ミトコンドリアゲノム解析と研究動向．生物の科学・遺伝．72:52-58．2018年5月．本総説では、筆者らが宝石サンゴを対象に実施してきたミトコンドリアゲノム解析の概要について概説し、また今後の方向性として、次世代シーケンサーを用いたRADseq解析やeDNA解析の有効性についても述べた。

4. 井口亮*・中島祐一・藤田純太・鈴木淳・酒井一彦．サンゴの分布境界と石灰化応答との関連を探る．月刊地球．39:31-37．2017年1月．我が国周辺で見られるサンゴ類は、分布北限域に生息しているが、分布の制限要因については不明な点が多い。本総説では、サンゴ類を含む日本の沿岸性海洋生物の集団解析とサンゴ類の石灰化応答を中心に、分布縁辺域でのサンゴ類の生活史の維持に関する知見について概説し、今後の研究の展望と課題について述べた。

5. 井口亮*・伊藤寛治・高井晋平・上野正博・前田経雄・南卓志・豊原治彦・林勇夫．日本周辺に生息する深海性腹足類エゾバイ・エゾボラ属の遺伝的な種内分化と種間関係に関する研究（日本海を中心に）．海洋と生物．30:676-684．2008年10月．本総説では、筆者らが日本周辺、特に日本海を中心に、DNAマーカーを用いてこれまで明らかにしてきた深海性エゾバイ・エゾボラ属巻貝の遺伝的な種内分化と種間関係について、氷河期の海水面低下時には近隣海域から隔離されて何度も環境悪化を受けた日本海の古環境変動と関連づけて概説し、今後の同分野での研究の方向性について述べた。

・シンポジウム・ワークショップ・招待講演等

1. 井口亮（産総研・地質情報）．「沖縄の自然環境を舞台にしたバイオインフォマティクス研究の展開」．シンポジウム：沖縄ならではのSociety5.0実現に向けて．2023年8月9日．沖縄県立博物館・美術館（おきみゅー） 講堂．※シンポジウムレポート。

2. 井口亮・喜瀬浩輝（産総研・地質情報）・太田雄貴（産総研・環境創生）・池内絵里・西島美由紀（産総研・地質情報）・石田洋（海生研究）・塚崎あゆみ・鈴村昌弘（産総研・環境創生）・鈴木淳（産総研・地質情報）．「メタンハイドレート賦存域周辺の深海生物を対象とした遺伝子解析による環境研究の紹介」．Japan Geoscience Union Meeting 2023．2023年5月21日．幕張メッセ．発表番号MIS19-02．

3. 井口亮（産総研・地質情報）．「遺伝子解析で沖縄島沿岸の生物多様性を俯瞰し統合解析を行う先に何が見えるか」．第39回 地質調査総合センターシンポジウム 美ら海の産業と環境の調和を科学の力で～陸-沿岸-海洋研究の最前線～．2023年3月3日．沖縄県立博物館・美術館（おきみゅー） 講堂．

4. 井口亮（産総研・地質情報）．「造礁サンゴ類の環境応答に関する総合的研究」．第44回（令和4年度）沖縄研究奨励賞贈呈式．2023年1月25日．パシフィックホテル沖縄．

5. 井口亮（産総研・地質情報）．「海洋生物に迫る危機を地球規模・地域規模の環境変化から読み解けるか」．2022年度1年理数科SSH特別授業講師（環境科学）．2023年1月12日．沖縄県立向陽高校．

6. 井口亮（産総研・地質情報）．「遺伝子解析で沖縄周辺の浅海・深海域の海洋生物の分布を紐解く」．第38回 地質調査総合センターシンポジウム 美ら海から知る美ら島の歴史　～500万年間の地史を求めて～．2022年12月21日．沖縄県立博物館・美術館（おきみゅー） 講堂．

7. 井口亮・鈴木淳・飯島真理子（産総研・地質情報）・安元純（琉大・農）・中村崇（琉大理・琉大熱生研）・酒井一彦（琉大熱生研）・安元剛（北里大・海洋生命）・水澤奈々美（北里大・海洋生命）・熊谷直喜（国環研）．「高CO2時代に対応したサンゴ礁保全に資するローカルな環境負荷の閾値設定に向けた研究」．Japan Geoscience Union Meeting 2022．2022年5月24日．幕張メッセ．発表番号AHW24-07．

8. 井口亮（産総研・地質情報）．「海洋生物に迫る危機を地球規模・地域規模の環境変化から読み解けるか」．2021年度1年理数科SSH特別授業（環境科学）講師．2022年1月18日．沖縄県立向陽高校・オンライン．※報告レポート。

9. 井口亮（産総研・地質情報）．「海洋ベントス生態学のフロンティアー底質に着目してー」．企画者：井口亮（産総研・地質情報）．第68回生態学会シンポジウムS14．2021年3月21日．オンライン大会．

10. 井口亮（産総研・地質情報）．「多変量解析における統計解析言語Rの活用」．名古屋大学×島津製作所 最新質量分析「Bioinformaticsが拓く、質量分析の夜明け」- 質量分析とBioinformaticsの融合からみえる世界-．2021年2月17日．Webinar．

11. 井口亮（産総研・地質情報）．「地球規模・地域規模の環境変化から読み解く海洋生物に迫る危機」．2020年度1年理数科SSH特別授業（環境科学）講師．2020年12月8日．沖縄県立向陽高校．※報告レポート。

12. 井口亮（産総研・地質情報）・飯島真理子（産総研・地質情報）・ベル智子（グアム大学・環境）・西島美由紀（産総研・地質情報）・中村崇（琉大理・琉大熱生研）・酒井一彦（琉大熱生研）・鈴木淳（産総研・地質情報）・安元純（琉大・農）・水澤奈々美（北里大・海洋生命）・安元剛（北里大・海洋生命）・熊谷直喜（国環研）．「地球的規模・地域的規模の環境変化がサンゴ石灰化に及ぼす影響ーサンゴポリプ実験系による検証ー」．東京大学大気海洋研究所共同利用研究集会「バイオミネラリゼーションと石灰化　-遺伝子から地球環境まで-」・共催：第15回バイオミネラリゼーションワークショップ．コンビーナー：中島礼（産業技術総合研究所）．2020年11月13日．オンライン集会．

13. 井口亮（産総研・地質情報）．「先輩からのアドバイス 研究者への道」．向陽 SSH 生徒研究発表会・特別講演会．2020年1月28日．沖縄県立向陽高校．※報告レポート。

14. 井口亮（産総研・地質情報）．「海洋ベントスの遺伝的集団構造を俯瞰する―熱帯・亜熱帯沿岸域を中心に―」．マリンバイオテクノロジー学会「若手の会シンポジウム」．2018年11月26日．日本大学生物資源科学部．

15. Akira Iguchi. A test of the Abundant Centre Model: A case study of Tropical Organisms in Northern Peripheral Area. JASAG 2018 Symposium. 18th, September, 2018. 2nd Floor Hall, Center for Co-Evolutional Social Systems, Kyusyu University, Japan.

16. 井口亮（沖縄高専・生物資源）．「スーパーコーラルを特徴づける生物要因の解明」．研究集会「データサイエンスの発展と実社会への応用」．開催責任者：太田佐栄子・西井龍映（九大IMI）．2017年12月14日．沖縄工業高等専門学校．

17. Akira Iguchi. Abundant Center Hypothesis: reef organisms along the Japan coastal area. KIKAI international symposium for coral reef sciences 2015, 23th, August, 2015, Central community centre, Kikai Island, Japan.

18. 井口亮（沖縄高専・生物資源）．「沖縄周辺域のサンゴとサンゴ礁の最近の変動と気候要因」．気候変動に関する政府間パネル（IPCC）公開シンポジウム「地球温暖化問題について考えよう！最新の科学と温室効果ガス排出量監視の取りくみ」．主催：気候変動に関する政府間パネル（IPCC）、公益財団法人地球環境戦略研究機関（IGES）、共催：琉球大学．2015年3月16日．ANAクラウンプラザホテル沖縄ハーバービュー．

19. 井口亮（沖縄高専・生物資源）．「サンゴの遺伝的多様性と海洋酸性化影響」．環境省環境研究総合推進費一般向け研究成果報告会「海洋酸性化がわが国周辺の生物に与える影響を評価する」．主催：環境研究総合推進費2A-1203課題、共催：環境省、独立行政法人国立環境研究所．2015年2月21日．TKP市ヶ谷カンファレンスセンター６A．

20. 井口亮（沖縄高専・生物資源）．「サンゴの分布境界と石灰化応答との関連を探る」．東京大学大気海洋研究所共同利用研究集会「バイオミネラリゼーションと石灰化 -遺伝子から地球環境まで-」．コンビーナー：遠藤一佳（東京大学）．2014年12月13日．東京大学大気海洋研究所．

21. 井口亮（沖縄高専・生物資源）．「変動環境下における造礁サンゴの多様性の進化」．2014年度日本サンゴ礁学会大会．2014年度日本サンゴ礁学会川口奨励賞受賞講演．2014年11月29日．高知城ホール．

22. 井口亮（沖縄高専・生物資源）．「変動環境下でのサンゴ集団内の遺伝的変異ー物質循環との関連ー」．「B-BG21 熱帯ー亜熱帯沿岸生態系における物質循環」．2014年度日本地球惑星連合大会．コンビーナ：渡邉敦・藤田和彦・本郷宙軌．2014年5月1日．横浜パシフィコ．

23. 井口亮（沖縄高専・生物資源）．「はじめにー固着生物の遺伝的多型情報から熱帯性生物の分布境界を考えるー」．「分布境界のサンゴ礁生態学」．2013年度日本サンゴ礁学会大会自由集会②．企画者：井口亮（沖縄高専・生物資源）・本郷宙軌（琉大・理）．2013年12月12日．沖縄科学技術大学院大学．講演要旨集 p.4．

24. 井口亮（沖縄高専・生物資源）．「水環境の変化はサンゴの成長を阻害するかー室内飼育実験からの検証ー」．第16回日本水環境学会シンポジウム「熱帯・亜熱帯地域の水環境その3:海域環境」．2013年11月10日．琉球大学．要旨集p.49．

25. 井口亮（琉大・熱生研）．「造礁サンゴの分子生態学的アプローチ：植物研究との比較」．「サンゴ礁生態学：植物生態学とのアナロジー」．企画者：熊谷直喜，井口亮（琉大・熱生研），向草世香（JST さきがけ，長大水産，琉大熱生研）．第60回生態学会企画集会T08．2013年3月6日．グランシップ静岡．

26. Akira Iguchi. A test of the abundant-centre model: reef organisms in northern peripheral area. Joint International Seminar: Past and present changes in marine ecosystems and biodiversity in the Asia-Pacific region, Oral presentation, 18th, March, 2013, University of the Ryukyus, Okinawa, Japan. 

27. 井口亮（琉大・熱生研）．「北限海域における造礁サンゴ-褐虫藻共生体の環境変化に対する適応の可能性」．第15回日本サンゴ礁学会大会サンゴ礁学シンポジウム「サンゴ礁学の成果と展望」．オーガナイザー：酒井一彦，山野博哉，茅根 創．2012年11月25日．東京大学．

28. 井口亮・熊谷直喜（琉大・熱生研）．「サンゴ礁生態系ネットワークについて考える」．「~若手の異分野連携を考える~日本サンゴ礁学会若手会」．第15回日本サンゴ礁学会大会自由集会．オーガナイザー：井上志保里（東京大学），高橋麻美（琉球大学）．2012年11月23日．東京大学．

29. Akira Iguchi. Natural genetic variation of coral populations underlying adaptive potential to global warming. LIPI - JSPS Asian Core Program Joint International Seminar on Coastal Ecosystems in Southeast Asia, 13th, November, 2012, Jakarta, Indonesia. p.101.

30. 井口亮（琉大・熱生研）．「サンゴの石灰化に見られる種内変異と今後の環境変化に対する適応の可能性」．東京大学大気海洋研究所共同利用研究集会「バイオミネラリゼーションと石灰化 -遺伝子から地球環境まで-」．コンビーナー：中島礼（産業技術総合研究所）．2012年11月9日．東京大学．

31. 井口亮（琉大・熱生研）．「造礁サンゴ-褐虫藻共生体の環境変化に対する適応の可能性-北限海域のサンゴ群集の事例から-」．「空間・場所がもつ条件や位置関係を意識したベントス研究」．2012年度日本プランクトン・ベントス学会合同大会自由集会．世話人：和田 哲（北大・水産）・熊谷直喜（琉大・熱生研）．2012年10月5日．東邦大学理学部（習志野キャンパス）．講演要旨集 p.182．

32. Akira Iguchi. Genetic variation of reef benthic organisms along the Japan coastal area. IOC/WESTPAC Workshop on Coral Reef Restoration Techniques in the Western Pacific Region, 21th, September, 2012, Chulalongkorn University, Bangkok, Thailand.

33. Akira Iguchi. Central-peripheral hypothesis across reef organisms along the Japan coastal area. Pan-Pacific Advanced Studies Institute, 18th, July, 2012, Dumaguete, Philippine.

34. Akira Iguchi. Natural genetic variation of coral populations underlying adaptive potential to thermal stress. Pan-Pacific Advanced Studies Institute, 18th, July, 2012, Dumaguete, Philippine.

35. 井口亮（琉大・熱生研）．「黒潮流域における海洋底生生物の地理的分布と遺伝的多様性形成メカニズム」．「Seascape ecology：海の景観生態学への挑戦」．企画者：熊谷直喜，井口亮（琉大・熱生研），向草世香（JST さきがけ，長大水産，琉大熱生研）．第59回生態学会企画集会T06．2012年3月18日．龍谷大学．

36. 井口亮（琉大・熱生研）．「サンゴ-褐虫藻共生体の順応と適応」．「サンゴの環境変化に対する順応・適応機構について考えるーゲノム（遺伝子）から個体（群体），集団までー」．2011年度日本サンゴ礁学会大会自由集会3．企画者：井口亮（琉大・熱生研）．2011年11月4日．沖縄県男女共同参画センターてぃるる．講演要旨集 p.17．

37. 井口亮（琉大・熱生研）．「日本海における海洋ベントスの遺伝的集団構造とその成立要因」．「日本海は進化のゆりかご? :新生代後期の日本海における古環境変化と生物進化」．日本古生物学会シンポジウム．企画者：神谷隆宏・長谷川卓・北村晃寿．2011年7月1日．金沢市文化ホール．講演要旨集 p.7．

38. 井口亮（琉大・熱生研）．「北限サンゴ礁海域における海洋性ベントスの遺伝的集団構造」．「琉球の生物地理--今後の展開に向けて--」．企画者：戸田守（琉大・熱生研）・富永篤（琉大・教育）．沖縄生物学会・日本動物分類学会合同大会公開シンポジウム．2011年6月4日．琉球大学・大学会館3階ホール．

39. 井口亮（琉大・熱生研）．「環境変化がサンゴの石灰化に及ぼす影響」．東京大学大気海洋研究所共同利用研究集会「バイオミネラリゼーションと石灰化 -遺伝子から地球環境まで-」．コンビーナー：鈴木淳（産業技術総合研究所）．2011年2月10日．東京大学．

40. 井口亮（琉大・熱生研）．「酸性化海水がサンゴに及ぼす影響について」．「海洋酸性化による環境影響：現状と展望」．企画者：石田明生（JAMSTEC）・河宮未知生（JAMSTEC）・鈴村昌弘（産総研）．日本海洋学会2010年度春季大会シンポジウム．2010年3月26日．東京海洋大学．

41. 井口亮（琉大・熱生研）．「ゲノム情報を活用して造礁サンゴの地理的変異を探る」．「サンゴ礁生物の緯度傾斜に沿った変異：ゲノムから生態系まで」．企画者：酒井一彦（琉大・熱生研）・井口亮（琉大・熱生研）．第57回生態学会シンポジウムS09．2010年3月17日．東京大学．

42. 井口亮（琉大・熱生研）．「造礁性サンゴの石灰化の分子基盤に関する研究‐他分野との統合的アプローチの開拓を目指して‐」．「サンゴ礁生物源炭酸塩の形成メカニズムと応用に関するワークショップ」．企画者：藤田和彦（琉大・理）．2010年1月11日．琉球大学５０周年記念館１階多目的室．

43. 井口亮（琉大・熱生研）．「CO2シンポジウム開催の趣旨について」．2009年度日本サンゴ礁学会大会シンポジウム「二酸化炭素増加がサンゴ礁域の海洋生物に及す影響-分子から生理，生態まで-」．企画者：諏訪僚太（京大・フィールド研）・井口亮（琉大・熱生研）．2009年11月28日．本部町中央公民館大ホール．講演要旨集 p.186．

44. 井口亮（琉大・熱生研）．「日本周辺に生息する深海性エゾバイ・エゾボラ属の遺伝的な種内分化と種間関係に関する研究（日本海を中心に）」．2009年度日本プランクトン学会・ベントス学会合同大会．日本ベントス学会奨励賞受賞講演．2009年10月17日．北海道大学．

45. 井口亮（琉大・熱生研）・諏訪僚太（琉大・熱生研）・酒井一彦（琉大・熱生研）・鈴木淳（産総研・地質情報）．「サンゴ礁を中心とした海洋酸性化研究の動向について」．東京大学海洋研究所共同利用研究集会「バイオミネラリゼーションと石灰化 -遺伝子から地球環境まで-」．コンビーナー：鈴木淳（産業技術総合研究所）．2009年4月23日．東京大学．

・その他出版物

1. 櫛田優花・喜瀬浩輝・井口亮・藤原義弘・土田真二．「海洋保護区安永海山の岩場で新種の ウミエラ類を発見 ―北西太平洋から初報告―」．GSJ地質ニュース Vol. 13，p. 95-100，2024．

2. 大野良和・井口亮・飯島真理子・安元剛・鈴木 淳．「大量の軽石漂着が沿岸生物に与える影響―軽石漂着が始まった直後の記録―」．GSJ地質ニュース Vol. 12，p. 161-165，2023．

3. 井口亮．「第39回地質調査総合センターシンポジウム参加報告」．日本サンゴ礁学会ニュースレター No. 97，p.3，2023．

4. ISA. 2022.Regional Environmental Assessment for the Northwest Pacific Ocean. 26 October - 6 November, 2020. Online workshop. Publication Date: 19 July 2022.

5. ISA. 2022. Workshop on the Development of a Regional Environmental Management Plan for the Area of the Northwest Pacific. 26 October - 6 November, 2020. Online workshop. Publication Date: 18 July 2022.

6. 井口亮．「日本生態学会シンポジウム「海洋ベントス生態学のフロンティアー底質に着目してー」開催報告」．日本サンゴ礁学会ニュースレター No. 89，p.3，2021．

7. 頼末武史・井口亮・安田仁奈・藤田喜久．「琉球列島におけるヤシガニは人為的影響を受けているか？−集団解析によるアプローチから− 」．GSJ地質ニュース Vol. 10，p. 194-197，2021．

8. 青木伸行・井口亮・田村亨・町田功・山本聡・チョン千香子．「環境調和型産業技術研究ラボ　沿岸環境研究チームの紹介 」．GSJ地質ニュース Vol. 9，p. 343-349，2020．

9. 安田仁奈・井口亮・山北剛久・中村隆志．「和歌山以南の温帯域が準絶滅危惧種のサンゴの避難場所として機能する？温帯サンゴの遺伝的多様性評価の結果から 」．GSJ地質ニュース Vol. 10，p. 257-260，2019．

10. 井口亮．「新人紹介 」．GSJ地質ニュース Vol. 6，p. 164，2018．

11. 井口亮．「川口奨励賞を受賞して」．日本サンゴ礁学会ニュースレター No. 64，p.2，2015．

12. 井口亮．「12th ICRS特集・JCRSブースの紹介」．日本サンゴ礁学会ニュースレター No. 54，p. 6，2012．

13. 井口亮．「サンゴの環境変化に対する順応・適応機構について考えるーゲノム（遺伝子）から個体（群体）、集団までー自由集会開催報告」．日本サンゴ礁学会ニュースレター No. 52，p. 5，2012．

14. 井口亮．「 沖縄生物学会・日本動物分類学会合同大会公開シンポジウム参加報告」．日本サンゴ礁学会ニュースレター No. 50，p. 3，2011．

15. 井口亮．「サンゴ礁関連施設探訪・ジェームス・クック大学」．日本サンゴ礁学会ニュースレター No. 35，p. 7，2007．

16. 井口亮．「サンゴの移植シンポジウム参加報告」．日本サンゴ礁学会ニュースレター No. 33，p. 3，2007．

・謝辞に入った論文（サンプルの提供・解析・原稿へのアドバイス等）

1. Washburn, T. W., Simon-Lledó, E., Soong, G. Y., & Suzuki, A. (2023). Seamount mining test provides evidence of ecological impacts beyond deposition. Current Biology, 33(14), 3065-3071.

2. Seike, K., Sassa, S., Shirai, K., & Kubota, K. (2022). Sediment hardness and water temperature affect the burrowing of Echinocardium cordatum: Implications for mass mortality during the 2011 earthquake–liquefaction–tsunami disaster. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 267, 107763.

3. Kunishima, T., & Tachihara, K. (2021). Patterns in diversity and species composition in soft-sediment tidepool fishes across topographical types: implications for conservation with spatial nuances. Marine Environmental Research, 105442.

4. Kajita, H., Nakamura, H., Ohkouchi, N., Harada, N., Sato, M., Tokioka, S., & Kawahata, H. (2020). Genomic and geochemical identification of the long-chain alkenone producers in the estuarine Lake Takahoko, Japan: Implications for temperature reconstructions. Organic Geochemistry, 142, 103980.

5. Tanaka, M., Genin, A., Endo, Y., Ivey, G. N., & Yamazaki, H. (2021). The potential role of turbulence in modulating the migration of demersal zooplankton. Limnology and Oceanography, 66(3), 855-864.

6. Kunishima, T., & Tachihara, K. (2020). What ecological role do soft-substrate tide pools play for fishes? Difference in community structures between estuarine and coastal tidal flats in subtropical Japan. Marine and Freshwater Research, 71(7), 737-749.

7. Mizuyama, M., Masucci, G. D., & Reimer, J. D. (2018). Speciation among sympatric lineages in the genus Palythoa (Cnidaria: Anthozoa: Zoantharia) revealed by morphological comparison, phylogenetic analyses and investigation of spawning period. PeerJ, 6, e5132.

8. Takeuchi, T., Plasseraud, L., Ziegler-Devin, I., Brosse, N., Shinzato, C., Satoh, N., & Marin, F. (2018). Biochemical characterization of the skeletal matrix of the massive coral, Porites australiensis–The saccharide moieties and their localization. Journal of Structural Biology, 203(3), 219-229.

9. Kunishima, T., & Tachihara, K. (2018). Improved quadrat method for fish survey in tide-pools of tidal flats. Plankton and Benthos Research, 13(1), 21-24.

10. Inoue, M., Nakamura, T., Tanaka, Y., Suzuki, A., Yokoyama, Y., Kawahata, H., ... & Gussone, N. (2018). A simple role of coral-algal symbiosis in coral calcification based on multiple geochemical tracers. Geochimica et Cosmochimica Acta, 235, 76-88.

11. Wada, N., Kawamoto, T., Sato, Y., & Mano, N. (2016). A novel application of a cryosectioning technique to undecalcified coral specimens. Marine Biology, 163(5), 117.

12. Richards, Z. T., Berry, O., & van Oppen, M. J. (2016). Cryptic genetic divergence within threatened species of Acropora coral from the Indian and Pacific Oceans. Conservation Genetics, 17(3), 577-591.

13. Watanabe, K., & Sugawara, T. (2015). Is heterostyly rare on oceanic islands?. AoB Plants, 7.

14. Kato, A., Hikami, M., Kumagai, N. H., Suzuki, A., Nojiri, Y., & Sakai, K. (2014). Negative effects of ocean acidification on two crustose coralline species using genetically homogeneous samples. Marine Environmental Research, 94, 1-6.

15. Shinzato, C., Inoue, M., & Kusakabe, M. (2014). A snapshot of a coral “holobiont”: a transcriptome assembly of the scleractinian coral, Porites, captures a wide variety of genes from both the host and symbiotic zooxanthellae. PloS One, 9(1), e85182.

16. Richards, Z. T., Miller, D. J., & Wallace, C. C. (2013). Molecular phylogenetics of geographically restricted Acropora species: implications for threatened species conservation. Molecular Phylogenetics and Evolution, 69(3), 837-851.

17. Yasuda, N., Abe, M., Takino, T., Kimura, M., Lian, C., Nagai, S., ... & Nadaoka, K. (2012). Large-scale mono-clonal structure in the north peripheral population of blue coral, Heliopora coerulea. Marine genomics, 7, 33-35.

18. Hikami, M., Ushie, H., Irie, T., Fujita, K., Kuroyanagi, A., Sakai, K., et al. (2011). Contrasting calcification responses to ocean acidification between two reef foraminifers harboring different algal symbionts. Geophysical Research Letters, 38(19).

19. Fujita, K., Hikami, M., Suzuki, A., Kuroyanagi, A., Sakai, K., Kawahata, H., & Nojiri, Y. (2011). Effects of ocean acidification on calcification of symbiont-bearing reef foraminifers. Biogeosciences, 8(8), 2089-2098.

20. Shinzato, C., Shoguchi, E., Kawashima, T., Hamada, M., Hisata, K., Tanaka, M., et al. (2011). Using the Acropora digitifera genome to understand coral responses to environmental change. Nature, 476(7360), 320.

21. Iwai, N., Sugiura, S., & Chiba, S. (2010). Prey-tracking behavior in the invasive terrestrial planarian Platydemus manokwari (Platyhelminthes, Tricladida). Naturwissenschaften, 97(11), 997-1002.

22. Iwai, N., Sugiura, S., & Chiba, S. (2010). Predation impacts of the invasive flatworm Platydemus manokwari on eggs and hatchlings of land snails. Journal of Molluscan Studies, 76(3), 275-278.

23. Shirai, S. M., Hirose, T., Goto, T., Kogure, Y., & Yosho, I. (2010). Three predominant species groups of deep-sea whelks (Gastropoda: Buccinidae) in the Sea of Japan: their molecular taxonomy and geographic distribution. Plankton and Benthos Research, 5(1), 17-30.

24. Ojimi, M. C., Isomura, N., & Hidaka, M. (2009). Telomerase activity is not related to life history stage in the jellyfish Cassiopea sp. Comparative Biochemistry and Physiology Part A: Molecular & Integrative Physiology, 152(2), 240-244.

25. Harii, S., Yasuda, N., Rodriguez-Lanetty, M., Irie, T., & Hidaka, M. (2009). Onset of symbiosis and distribution patterns of symbiotic dinoflagellates in the larvae of scleractinian corals. Marine Biology, 156(6), 1203.

26. Nishikawa, A. (2008). Degree and Pattern of Gene Flow in Several Scleractinian Corals in the Ryukyu Archipelago, Southern Japan1. Pacific Science, 62(3), 413-421.

27. Suzuki, G., & Hayashibara, T. (2006). Inhibition of settlement and metamorphosis in Acropora (Anthozoa, Scleractinia) larvae by high-intensity light. In Proc 10th Int Coral Reef Symp (Vol. 4, pp. 1627-1630).