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・学術雑誌に発表した原著論文［査読有・査読中］*Corresponding author

・2017

1. Yoshioka Y, Tanabe T, Iguchi A*. The presence of genes encoding enzymes that digest carbohydrates in coral genomes and analysis of their activities. PeerJ 5:e4087. 2017. サンゴのゲノム情報を活用して、糖質加水分解酵素がサンゴのゲノムに複数存在していること、また、これら酵素の各生活史段階での発現パターンが明らかとなった。また、プレートアッセイにより、複数サンゴ種において、糖質加水分解酵素の活性が確認された。今後、サンゴ由来の糖質加水分解酵素の詳細な生理的役割の解明が望まれる。

2. Bell T, Nishida K, Ishikawa K, Suzuki A, Nakamura T, Sakai K, Ohno Y, Iguchi A, Yokoyama Y*. Temperature controlled culture experiment using primary polyps of Acropora digitifera: their growth rate variation and skeletal Sr/Ca, Mg/Ca and Na/Ca. Palaeogeography, Palaeoclimatology, Palaeoecology 484:129-135. 2017. コユビミドリイシの初期ポリプを作成し、複数段階の温度区を設定して、 初期ポリプの成長率及び骨格組成（Sr/Ca、Mg/Ca、Na/Ca）を調べた。その結果、骨格成長は各温度区で大きな変異が見られた。初期ポリプ骨格のSr/Caは温度と強い相関を示し、Mg/CaとNa/Caは弱い相関を示した。以上のことから、コユビミドリイシの初期ポリプのSr/Caはロバストな温度指標になることが示唆された。

3. Fujita J*, Drumm DT, Iguchi A, Ueda Y, Yamashita Y, Ito M, Tominaga O, Kai Y, Ueno M, Yamashita Y. Deep-sea phylogeographic structure shaped by paleoenvironmental changes and ongoing ocean currents around the Sea of Japan in a crangonid shrimp Argis lar. Zoological Science 34:406-413. 2017. 北太平洋の深海域に多く見られるクロザコエビを対象に、日本周辺及びオホーツク海、ベーリング海のサンプルを用いて、ミトコンドリアDNAの部分塩基配列を基に分子系統地理解析を行った。その結果、クロザコエビには大きく3つのグループが確認された。グループの一つは日本海に優先し、遺伝的多様性が比較的低かったことから、氷期の日本海の環境変動によって集団の縮小が生じたことが示唆された。また、現在の海流によって、グループ間で交流が部分的に生じていることも示唆された。

4. Sekizawa A, Uechi H, Iguchi A*, Nakamura T, Kumagai NH, Suzuki A, Sakai K, Nojiri Y. Intraspecific variations in responses to ocean acidification in two branching coral species. Marine Pollution Bulletin 122:282-287. 2017. A. Sekizawa, H. Uechi, and A. Iguchi contributed equally to this work. 沖縄島周辺でよく見られる枝状サンゴ2種を対象に、多群体を用いた共通環境実験系により、酸性化海水が石灰化と光合成効率に及ぼす影響評価を行った。その結果、種間・種内でその応答に明確な変異が見られた。本研究の成果は、今後の海洋酸性化進行によって、サンゴ群集がどのように変化 していくのかを予測することや、サンゴ群集修復技術として注目を集めているサンゴ移植技術の高度化への応用が期待される。沖縄高専からのプレスリリース記事はこちら。弘前大学からのプレスリリース記事はこちら。QAB琉球朝日放送・沖縄タイムス。academist Journalでも関連成果の解説を行っています（こちら）。

5. Kuraya E*, Yamashiro R, Touyama A, Nakada S, Watanabe K, Iguchi A, Itoh S. Aroma Profile and Antioxidant Activity of Essential Oil from Alpinia zerumbet. Natural Product Communications 12:1321-1325. 2017. 沖縄在来植物である月桃の精油成分を対象に、GC/MSによって得られた揮発性成分、精油収量、抗菌活性の関係を、個体別、地域別、季節別に分けて評価した。その結果、月桃精油成分の特徴的な化学成分が明らかとなり、その組成は個体差が見られたこと、精油収量と抗菌活性に負の相関関係が見られることが示された。沖縄高専ウェブサイトの記事はこちら。

6. Nakajima Y*, Nishikawa A, Iguchi A, Nagata T, Uyeno D, Sakai K, Mitarai S. Elucidating the multiple genetic lineages and population genetic structure of the brooding coral Seriatopora (Scleractinia: Pocilloporidae) in the Ryukyu Archipelago. Coral Reefs 36:415–426. 2017. 琉球列島のトゲサンゴ属サンゴを対象に、ミトコンドリアDNAマーカーによる系統地理学的解析とマイクロサテライトマーカーによる分子集団遺伝学的解析を行った。その結果、3つの遺伝的に大きく異なる系統群が確認された。また、各系統郡内での遺伝的分化は顕著で、琉球列島における集団間の遺伝的交流は大きく制限されている可能性が示唆された。

7. Nakamura T, Iguchi A*, Suzuki A, Sakai K, Nojiri Y. Effects of acidified seawater on calcification, photosynthetic efficiencies, and the recovery processes from strong light exposure in coral Stylophora pistillata. Marine Ecology 38:e12444. 2017. T. Nakamura and A. Iguchi contributed equally to this work. サンゴ飼育実験でよく用いられているショウガサンゴ複数群体を対象に、5段階の酸性化海水中での石灰化、光合成効率、強光ばく露後の回復パターンについて調べた。その結果、どの群体においても、酸性化海水による影響はあまり見られず、今後海洋酸性化が進行しても、本種は影響を受けにくい可能性が示唆された。弘前大学からのプレスリリース記事はこちら。NHK・QAB琉球朝日放送・沖縄タイムス。

8. Ikeuchi E*, Ohno Y, Iguchi A, Nakamura T. Non-bleached colonies of massive Porites may attract fishes for selective grazing during mass bleaching events. PeerJ 5:e3470. 2017. 2016年の大規模サンゴ白化時において、石西礁湖における塊状ハマサンゴ類の白化の割合と、魚類による齧り痕の割合を調べた。その結果、白化しにくいとされる塊状ハマサンゴ類においても、半数近くが白化していたこと、また、魚類による齧り痕は、白化していない群体に多く見られた。このことから、魚類は白化しにくい群体を選択的に齧っていることが示唆された。琉球大学のウェブサイトで紹介されました（こちら）。

9. Ohno Y*, Iguchi A, Shinzato C, Gushi M, Inoue M, Suzuki A, Sakai K, Nakamura T. Calcification process dynamics in coral primary polyps as observed using a calcein incubation method. Biochemistry and Biophysics Reports 9:289-294. 2017.サンゴの骨格形成の時空間動態を明らかにするために、褐虫藻を含まないサンゴポリプを用いて、カルセイン染色によって骨格形成を高解像度で経時的に観察した。その結果、造骨細胞間での骨格形成の可視化や、骨格形成時における石灰化母液の動態を把握することに成功した。

10. Ohno Y*, Iguchi A, Shinzato C, Inoue M, Suzuki A, Sakai K, Nakamura T. Aposymbiotic primary coral polyp counteracts acidification by active pH regulation. Scientific Reports 7:40324. 2017. サンゴが周辺の海水のpH変化にどのように応答しているのかを明らかにするために、褐虫藻を含まないサンゴポリプを用いたpHイメージングを高解像度で行った。その結果、サンゴが能動的に体内pHを変化させて、周辺海水のpH変化に応答していることが明らかとなった。産総研からのプレスリリース記事はこちら。日本の研究.com。産経ニュース・沖縄タイムス。academist Journalでも関連成果の解説を行っています（こちら）。

・2016

11. Fujita J*, Zenimoto K, Iguchi A, Kai Y, Ueno M, Yamashita Y. Comparative phylogeography to test for predictions of marine larval dispersal in three amphidromous shrimps. Marine Ecology Progress Series 560:105-120. 2016. 日本周辺に生息する両側回遊性ヌマエビ類が、どのように集団を維持・形成しているかを明らかにするために、Caridina属3種を対象に、ミトコンドリアCOI遺伝子配列を用いた比較集団解析を行った。その結果、日本周辺と琉球列島周辺で遺伝的に分化している種もいれば、広く交流が維持されている種も見られるなど、集団構造は種間で顕著に異なることが明らかとなり、各種の生態的特徴と関連している可能性が示唆された。

12. Iwasaki S*, Inoue M, Suzuki A, Sasaki O, Kano H, Iguchi A, Sakai K, Kawahata H. The role of symbiotic algae in formation of coral primary polyp skeleton: 3D morphological study based on X-ray micro-CT. Geochemistry, Geophysics, Geosystems 17:3629-3637. 2016. 地球温暖化と海洋酸性化が褐虫藻有り・無しのサンゴ初期ポリプに及ぼす影響の詳細を明らかにするために、X線マイクロCTを用いた形態評価を行った。その結果、褐虫藻を有するポリプでは、基部の石灰化が顕著に促進されていることが明らかとなった。また、酸性化海水でポリプの成長率は顕著に低下するが、骨格密度自体には変化が見られないことなども明らかとなった。

・2015

13. Iguchi A*, Suzuki A, Sakai K, Nojiri Y. Comparison of the effects of thermal stress and CO2-driven acidified seawater on fertilization in coral Acropora digitifera. Zygote 23:631-634. 2015. 地球温暖化と海洋酸性化がサンゴの受精に及ぼす影響を明らかにするために、100年後を想定した高温ストレスと酸性化海水を設定して、コユビミドリイシの受精率に及ぼす影響を調べた。その結果、酸性化海水中では受精率に変化は見られなかったが、高温ストレス下では受精率の低下が見られたことから、地球温暖化の方が、海洋酸性化よりも対象種の受精率に悪影響を及ぼしうることが示唆された。

・2014

14. Iguchi A*, Kumagai NH, Nakamura T, Suzuki A, Sakai K, Nojiri Y. Responses of calcification of massive and encrusting corals to past, present, and future ocean carbon dioxide concentrations. Marine Pollution Bulletin 89:348-355. 2014. A. Iguchi and N.H. Kumagai contributed equally to this work. 塊状及び被覆状のサンゴ種を用いて、海洋酸性化による成長速度への影響を調べる比較実験を行い、6種の海洋酸性化指標に対する応答パターンの違いを比較解析した。解析ではベイズ法の活用により炭酸系パラメータの変動を確率分布としてモデル化することで精度の高い影響推定を可能とした。解析の結果、サンゴの形状や炭酸系パラメータにより海洋酸性化に対する応答が異なることが示された。また酸性化に対し曲線的に成長速度が減少する応答パターンを評価する場合は、ベイズ法によるモデルが優れていることが明らかとなった。

15. Tanaka Y*, Iguchi A, Nishida K, Inoue M, Nakamura T, Suzuki A, Sakai K. Nutrient availability affects the response of juvenile corals and the endosymbionts to ocean acidification. Limnology and Oceanography 59:1468-1476. 2014. 富栄養化と酸性化海水が、着底直後のサンゴ初期ポリプの成長や骨格組成、サンゴ体内の褐虫藻に及ぼす影響について調べた。その結果、富栄養、酸性化海水によって、褐虫藻密度やクロロフィル量、そして成長に複合的に影響を引き起こすことが示唆された。

16. Nishida K, Ishikawa K, Iguchi A, Tanaka Y, Sato M, Inoue M, Nakamura T, Sakai K, Suzuki A*. Skeletal oxygen and carbon isotope compositions of Acropora coral primary polyps experimentally cultured at different temperatures. Geochemistry, Geophysics, Geosystems 15:2840-2849. 2014. 一斉産卵時に得られたコユビミドリイシの配偶子を用いてサンゴ初期ポリプを作成し、複数段階の温度区を設定して、初期ポリプの成長率及び骨格組成を調べた。その結果、初期ポリプの石灰化は温度に対して鋭敏に応答することが明らかとなった。また、初期ポリプの骨格組成を調べ、過去の研究成果とも合わせて、本研究で用いた骨格サンプルにおける温度復元の可能性についても検討を進めた。

17. Nishida K, Iguchi A, Ishimura T, Sakai K, Suzuki A*. The skeletal isotopic responses of the Scleractinian coral Isopora palifera to experimentally-controlled water temperatures. Geochemical Journal 48:e9 - e14. 2014. サンゴ礁域によく見られるニオウミドリイシを対象に、温度を複数段階設定した条件下での飼育実験を行った。その結果、ニオウミドリイシの石灰化は温度変化に対して鋭敏に応答すること、また温度変化と相関のある骨格プロキシの検討を行い、過去の温度復元に本種が適していることが示唆された。

・2013

18. Tanaka Y*, Iguchi A, Inoue M, Mori C, Sakai K, Suzuki A, Kawahata H, Nakamura T. Microscopic observation of symbiotic and aposymbiotic juvenile corals in nutrient-enriched seawater. Marine Pollution Bulletin 68:93-98. 2013. 着底後の幼サンゴの成長を顕微鏡下で観察し、栄養塩負荷や褐虫藻有無の効果を実験的に調べた。その結果、栄養塩によって活性化する底生藻類の被覆によってサンゴの成長が阻害されること、褐虫藻の獲得が底生藻類に対する抵抗力を高めることが示された。幼サンゴの生残や成長を高めるには、早く褐虫藻を獲得できるか、周囲の底生藻類に対する捕食圧は十分か、などの条件が重要になってくると考えられた。

19. Hayashi E, Suzuki A*, Nakamura T, Iwase A, Ishimura T, Iguchi A, Sakai K, Okai T, Inoue M, Araoka D, Murayama S, Kawahata H. Growth-rate influences on coral climate proxies tested by a multiple colony culture experiment. Earth and Planetary Science Letters 362:198-206. 2013. 複数のハマサンゴ群体を、約6年に及ぶ長期飼育実験を行い、骨格の成長速度、骨格の酸素同位体比、Sr/Ca比の変動と水槽で実測された水温等の環境パラメータとの精密対比を行った。同一環境下での飼育にも関わらず、成長率に顕著な群体差が見られた。これらの群体の成長軸に沿う酸素同位体比、Sr/Ca比には、明瞭な季節変化が認められた。群体間の大きな成長速度の差にも関わらず、酸素同位体比、Sr/Ca 比ともに群体間の変異は小さく、気候指標としての安定性が示唆された。

・2012

20. Nakajima Y*, Nishikawa A, Iguchi A, Sakai K. Regional genetic differentiation among northern high-latitude island populations of a broadcast-spawning coral. Coral Reefs 31:1125-1133. 2012. ミドリイシ属サンゴの1種、Acropora sp.1を対象に、マイクロサテライトマーカーを用いて、沖縄島と小笠原間の遺伝的交流関係を調べた。両地域間では、顕著ではないが、有意な遺伝的分化が観察された。遺伝的多様性に関しては、両海域間で差は見られなかった。また、有意なIsolation by distanceが観察されたことから、今回調べた地理的スケールは、対象種の分散範囲を網羅する範囲内で行えたことが示唆された。

21. Inoue M*, Shinmen K, Kawahata H, Nakamura T, Tanaka Y, Kato A, Shinzato C, Iguchi A, Kan H, Suzuki A, Sakai K. Estimate of calcification responses to thermal and freshening stresses based on culture experiments with symbiotic and aposymbiotic primary polyps of a coral, Acropora digitifera. Global and Planetary Change 92-93:1-7. 2012. 褐虫藻有り・無しのサンゴ初期ポリプを作成し、複数段階の温度・塩分濃度を設定して、初期ポリプの石灰化率及び白化率を調べた。全体として、褐虫藻有りの初期ポリプの成長が顕著に速かった。温度変化に対しては、褐虫藻有り無しで、異なる応答パターンが見られた。また、高温ストレス下では、顕著な白化、骨格の微細構造に異常が見られた。塩分濃度変化に対しては、褐虫藻有り無し間で応答パターンに差は見られなかった。

22. Nakajima Y*, Nishikawa A, Iguchi A, Sakai K. The population genetic approach delineates the species boundary of reproductively isolated corymbose acroporid corals. Molecular Phylogenetics and Evolution 63:527-531. 2012. 沖縄島周辺海域で同所的に生息するコユビミドリイシとその隠蔽種だったAcropora sp.1の2種において、系統解析用マーカーによる分子系統解析と、高感度のマイクロサテライトマーカーによる集団解析を行った。その結果、分子系統解析ではこれまでの研究と同様に種間の系統パターンは不明瞭だったが、集団解析においては種間で大きな遺伝的分化が見られ、同所においても生殖隔離が起こっている可能性が示唆された。

23. Iguchi A*, Ozaki S, Nakamura T, Inoue M, Tanaka Y, Suzuki A, Kawahata H, Sakai K. Effects of acidified seawater on coral calcification and symbiotic algae on the massive coral Porites australiensis. Marine Environmental Research 73:32-36. 2012. 海洋酸性化は、多くの石灰化生物に負の影響を及ぼすことが報告されている。本論文では、沖縄周辺のサンゴ礁域に普通に見られる、ハマサンゴを用いて、海洋酸性化が、ハマサンゴの石灰化と共生藻に及ぼす影響について、室内飼育実験によって調べた。その結果、これまでの報告と同様に、ハマサンゴの石灰化は、酸性化海水中では抑制された。ハマサンゴの光合成活性も、酸性化海水中では減少することも示された。また、石灰化及び光合成活性の減少傾向は、群体間で顕著に異なることが示された。

・2011

24. Kaneko N, Kudodera T*, Iguchi A. Taxonomic study of shallow-water octopuses (Cephalopoda: Octopodidae) in Japan and adjacent waters using mitochondrial genes with perspectives on octopus DNA barcoding. Malacologia 54:97-108. 2011. マダコ科に属する34種のタコ類を対象に、主に日本周辺から採集し、また、博物館に保管されている標本も含めて、形態観察及び分子系統解析を行った。基本的には、これまでの分類学的研究を支持する結果が見られた一方で、分類学的位置を再検討する必要性も示唆された。種内の遺伝的変異は、種間の遺伝的変異よりも明らかに小さく、隠蔽種の存在は確認されなかった。得られたデータは、今後タコ類のDNAバーコーディングにも活用されることが期待される。

25. Iguchi A*, Shinzato C, Forêt S, Miller DJ. Identification of fast-evolving genes in the scleractinian coral Acropora using comparative EST analysis. PLoS ONE 6:e20140. 2011. オーストラリアに多く見られるハイマツミドリイシと、カリブ海のAcropora palmataでは、比較的規模の大きい遺伝子データベースが作成されている。これらのデータベースを活用して、加速進化遺伝子がサンゴのゲノムにどの程度存在するのかを調べた。その結果、加速進化遺伝子を複数発見することに成功した。今後これらの候補遺伝子をマーカーとして、サンゴがどのように適応・進化してきたのか、明らかになることが期待される。

・2010

26. Nakajima Y*, Nishikawa A, Iguchi A, Sakai K. Gene flow and genetic diversity of a broadcast-spawning coral in northern peripheral populations. PLoS ONE 5:e11149. 2010. ミドリイシ属サンゴの1種、コユビミドリイシを対象に、マイクロサテライトマーカーを用いて、琉球列島全域の遺伝的交流関係及び遺伝的多様性を調べた。少数の地域間で、有意な遺伝的分化が見られたが、基本的には琉球列島全域で遺伝的交流が見られた。遺伝的多様性の変化に関しては、緯度との相関は見られず、分布の最縁辺でも、高い遺伝的多様性が観察され、高い遺伝子流動が縁辺部でも起こっていることが示唆された。琉球大学からプレスリリースを実施。

27. Morita M, Suwa R*, Iguchi A, Nakamura M, Shimada K, Sakai K, Suzuki A. Ocean acidification reduces sperm flagellar motility in broadcast spawning reef invertebrates. Zygote 18:103-107. 2010. M. Morita, R. Suwa, and A. Iguchi contributed equally to this work. 海洋酸性化が海産無脊椎動物の受精に及ぼす影響を明らかにするために、コユビミドリイシとナマコの1種から精子を採集し、複数段階の酸性化海水下での精子鞭毛運動を顕微鏡下で観察した。実験に用いた2種の精子において、酸性化海水中では明らかな精子鞭毛運動の低下が観察された。海水の二酸化炭素濃度の増加に伴い、精子鞭毛運動の低下が生じた。これらの結果から、将来、海洋酸性化がサンゴの受精能を低下させる可能性があることが示唆された。Top 10 most-read articles (January, 2010). 

28. Morimoto N*, Furushima Y, Nagao M, Irie T, Iguchi A, Suzuki A, Sakai K. Water quality variables across Sekisei reef, a large reef complex in Southwestern Japan. Pacific Science 64:113-123. 2010. サンゴ礁における気候の季節性と地形が水質に及ぼす影響を調べるため、石西礁湖の半閉鎖的な礁湖と開放的な場所とで、濁度とchl・NOx-N・NH4-N濃度を通年で測定した。その結果、濁度とchl濃度の時間変動は礁湖内外で異なり、閉鎖的な礁湖の地形が気候の変化に伴う堆積物の再懸濁などの影響を強めたと推測された。一方、NOx-N・NH4-N濃度の不明瞭な季節性は、礁湖でのその放出と損失の均衡によるものと考えられた。

29. Suwa R, Nakamura M*, Morita M, Shimada K, Iguchi A, Sakai K, Suzuki A. Effects of acidified seawater on early life stages of scleractinian corals (Genus Acropora). Fisheries Science 76:93-99. 2010. 海洋酸性化がサンゴに及ぼす影響を明らかにするために、二酸化炭素濃度を制御した水槽実験系を用い、ミドリイシ属サンゴの初期生活史の酸性化海水への耐性を調べた。その結果、幼生の生存期間への影響は見られなかったが、変態した一次ポリプの成長率と共生藻の取り込み率は酸性化海水中で有意な低下がみられた。これらの結果から、将来、海洋酸性化がサンゴの一次ポリプの成長と共生成立を遅らせる可能性が示唆された。平成25年度日本水産学会論文賞受賞．

・2009

30. Iguchi A, Morita M, Nakajima Y, Nishikawa A, Miller DJ*. In vitro fertilization efficiency in coral Acropora digitifera. Zygote 17:225-227. 2009. これまでのサンゴの受精実験は、高濃度の精子に長時間（4-8時間）卵を曝露しているのが普通であるため、受精率を過剰に見積もっている可能性があった。そこでコユビミドリイシを対象に、卵を精子に曝露する時間を割り振って受精率を調べたところ、30分以上の曝露時間で、受精率が飽和に達することが分かった。今後のサンゴの受精実験では、卵を精子に曝露するのは1時間程度にするのが望ましいことが示唆された。

31. Nakajima Y*, Nishikawa A, Iguchi A, Sakai K. Novel and cross-species amplifiable microsatellite markers in two Acropora species. Plankton and Benthos Research 4:38-41. 2009. ミドリイシ属サンゴ2種（コユビミドリイシ、Acropora sp. 1）を対象に、異種間で適用可能なマイクロサテライトマーカーの開発及び探索を行った。コユビミドリイシから開発された新規マーカー1種類及び、他のミドリイシ属サンゴから開発された既存のマーカー5種類、計6種類のマーカーが、上記2種に適用可能であることが示された。ミドリイシ属サンゴにおいては、新規のマーカー開発だけでなく、既存のマーカーを利用することも考慮すべきであることが示された。

32. Nakajima Y*, Nishikawa A, Isomura N, Iguchi A, Sakai K. Genetic connectivity of the broadcast-spawning coral Acropora digitifera analyzed by microsatellite markers in the Sekisei Reef, southwestern Japan. Zoological Science 26:209-215. 2009. 表層海流によるシミュレーションによって、石西礁湖内の南北両地域間で幼生の交流が隔てられている可能性を検証するために、コユビミドリイシを対象に、マイクロサテライトマーカーを用いて石西礁湖内での遺伝的交流関係の把握を試みた。解析の結果、コユビミドリイシでは、南北両地域間では明瞭な遺伝的分化は見られず、石西礁湖全体では遺伝的交流が保たれていることが示唆された。

33. Morita M*, Iguchi A, Takemura A. Roles of calmodulin and Calcium/calmodulin-dependent protein kinase in flagellar motility regulation in the coral Acropora digitifera. Marine Biotechnology 11:118-123. 2009. サンゴの精子鞭毛運動の分子基盤について調べ、免疫染色、Ca2+オーバーレイアッセイにより、精子にはカルモジュリン（CaM）とカルシウム／カルモジュリン依存性タンパクキナーゼ（CaMK）の存在が確認された。また、CaMとCaMKの阻害剤によって、活性化された精子鞭毛運動が阻害された。サンゴは動物の進化系統樹の基底に位置することから、CaMとCaMKはサンゴを含む動物全般の精子鞭毛運動において重要な役割を果たしていることが示唆された。

・2008

34. Shinzato C, Iguchi A, Hayward DC, Technau U, Ball EE*, Miller DJ*. Sox genes in the coral Acropora millepora: divergent expression patterns reflect differences in developmental mechanisms within the Anthozoa. BMC Evolutionary Biology 8:311. 2008. 動物の進化系統樹の基底に位置し、単純な体制を示すサンゴの1種、ハイマツミドリイシを対象に、Sox遺伝子群の構造解析及び発現解析を行い、サンゴとイソギンチャクとの間で比較を行った。その結果、Soxは、サンゴの神経分化などの役割を担っていることが分かった。また、サンゴとイソギンチャクの間で、Soxの発現パターンが著しく異なるものも見られ、刺胞動物の系統内でも発生過程に大きな変化が生じた可能性が示唆された。Featured article, highly accessed article. 

35. Iguchi A, Ueno M, Maeda T, Minami T, Toyohara H*, Hayashi I. Molecular-based method to distinguish sympatric deep-sea whelks, Buccinum striatissimum and Buccinum tenuissimum in the Sea of Japan. Plankton and Benthos Research 3:101-103. 2008. 日本海の代表的な水産重要種であるエッチュウバイ、オオエッチュウバイは、形態からの識別が困難である場合が多い。これら2種が、ミトコンドリアの16SrRNA遺伝子配列では明らかに異なることに注目して、PCR-RFLP法によって、簡便に識別できる手法を開発した。また、同所的に2種が採集される地点のサンプルを用いた遺伝子解析も行い、これら2種が同所的に生息して生殖隔離されている可能性があることも示した。

36. Knack B, Iguchi A, Shinzato C, Hayward DC, Ball EE, Miller DJ*. Unexpected diversity of cnidarian integrins: expression during coral gastrulation. BMC Evolutionary Biology 8:136. 2008. B. Knack and A. Iguchi contributed equally to this work. 動物の進化系統樹の基底に位置し、単純な体制を示すサンゴの1種、ハイマツミドリイシを対象に、integrin遺伝子群の構造解析及び発現解析を行った。その結果、サンゴには予想以上に多くの種類のintegrinが存在し、また、いくつかのintegrinは、原腸陥入に関わるような発現パターンを示すことも分かった。これらの結果から、多様化したintegrin遺伝子群が、刺胞動物において重要な機能を担っていることが示唆された。

・2007

37. Iguchi A, Márquez LM, Knack B, Shinzato C, van Oppen MJH, Willis BL, Hardie K, Catmull J, Miller DJ*. Apparent involvement of a β1-type integrin in coral fertilization. Marine Biotechnology 9:760-765. 2007. A. Iguchi and L.M. Marquez contributed equally to this work. 哺乳類の受精において、精子と卵の膜の結合と融合に関わるとされるintegrinが、サンゴの受精にも関わっているかどうかを調べた。ハイマツミドリイシから同定され、卵での発現が確認されたintegrin α、integrin βのうち、integrin βの抗体を用いて、受精時にintegrin βの機能を阻害させると、受精現象は正常に進行せず、integrin βがサンゴの受精に関わっていることが分かり、integrinの受精への役割は、多くの動物で保存されている可能性が示唆された。ミドリイシの産卵写真がMarine Biotechnology誌の表紙として掲載。

38. Iguchi A*, Ito H, Ueno M, Maeda T, Minami T, Hayashi I. Molecular phylogeny of the deep-sea Buccinum species (Gastropoda: Buccinidae) around Japan; inter- and intraspecific relationships inferred from mitochondrial 16SrRNA sequences. Molecular Phylogenetics and Evolution 44:1342-1345. 2007. 日本海の代表的な深海生物であるエゾバイ属腹足類の種分化過程を明らかにするために、日本周辺で採集されたエゾバイ属8種を対象に、ミトコンドリアDNAの部分塩基配列を基に分子系統解析を行った。その結果、それらが4つのグループに分かれ、グループ内では亜種程度の分化である一方で、グループ間では明らかに種レベルで分かれていることを示し、そのグループが殻の形態と陰茎の形態で特徴づけられることを明らかにした。"Deep-Sea Biodiversity: Pattern and Scale" (Michael A. Rex and Ron J. Etter eds. Harvard University Press)で紹介された。

39. Iguchi A*, Takai S, Ueno M, Maeda T, Minami T, Hayashi I. Comparative analysis on the genetic population structures of the deep-sea whelks Buccinum tsubai and Neptunea constricta in the Sea of Japan. Marine Biology 151:31-39. 2007. 日本海に優占するツバイとチヂミエゾボラ両種の遺伝的集団構造の比較解析を行った。その結果、ツバイとチヂミエゾボラとで日本海への侵入と分布拡大のタイミングが異なることで、両種の間に集団構造の差異が生じたことが示唆された。また、ツバイの地域集団の分岐年代を推定した結果、42万年以上前と推定され、これまで氷期の環境変動によって何度も環境悪化を受けた日本海において、ツバイが生き延びた可能性が示された。"Deep-Sea Biodiversity: Pattern and Scale" (Michael A. Rex and Ron J. Etter eds. Harvard University Press)で紹介された。

・2006

40. Morita M*, Nishikawa A, Nakajima A, Iguchi A, Sakai K, Takemura A, Okuno M. Eggs regulate sperm flagellar motility initiation, chemotaxis, and inhibition in the coral, Acropora digitifera, A. gemmifera, and A. tenuis. Journal of Experimental Biology 209:4574-4579. 2006. ミドリイシ属サンゴ3種を対象に、精子鞭毛運動の観察を行った。今回用いた3種の精子は、海水中では静止していたが、それぞれの種の卵の近くでは精子鞭毛運動の開始が見られた。一方で、異なる種の卵では精子鞭毛運動は生じず、種特異性があることが確認された。また、精子が卵に大量に付くと、卵から精子鞭毛運動を停止する物質が放出されることも分かり、一斉産卵を行うサンゴの繁殖様式に適応していると考えられた。

・2005

41. Iguchi A, Ito H, Ueno M*, Maeda T, Minami T, Hayashi I. Morphological analysis of a deep-sea whelk Buccinum tsubai in the Sea of Japan. Fisheries Science 71:823-828. 2005. 日本海に広く生息するエゾバイ科エゾバイ属腹足類の一種、ツバイを対象に、計測形質を基にして、雌雄間並びに、ミトコンドリアDNAの部分塩基配列によって区別される4地域集団間で形態比較を行った。その結果、ツバイには雌雄二型があることが示された。また、4地域間で見られた形態的差異は、遺伝的なものか、あるいは4地域間の環境の差異による表現型の可塑性が関与していることが示唆された。

・2004

42. Iguchi A*, Ueno M, Maeda T, Minami T, Hayashi I. Genetic population structure of the deep-sea whelk Buccinum tsubai in the Japan Sea. Fisheries Science 70:569-572. 2004. 日本海に広く生息するエゾバイ科エゾバイ属腹足類の一種、ツバイの遺伝的集団構造を調べるために、日本海の各地点から採集された個体を用いて、ミトコンドリアDNAの部分塩基配列を基に比較した。分子系統樹は4つのクラスターからなり、4つの地域集団が確認された。ツバイの主要生息水深は200mから1000mの間であるが、4つの地域集団は主要生息水深の水平的な幅が狭まる、あるいは欠如している場所で分かれていることが示唆された。本研究で示された地域集団の明瞭な遺伝的分化は、本種の資源管理の指針作りにおける基礎情報となることが期待される。

・学術雑誌に発表した総説［査読有］*Corresponding author

1. Iguchi A*. Unveiling molecular basis of fertilisation in scleractinian corals using extensive genomic information. Current Bioinformatics 9:182-187. 2014. 本総説では、現在拡大が進んでいるサンゴのゲノム情報を活用して、サンゴの受精の分子基盤をどのように明らかにしうるかについて述べた。これまで哺乳類などで分かっている受精に関与する遺伝子群に着目して行う候補遺伝子アプローチ、あるいは、受精に関わる遺伝子が加速進化しやすいことに着目して、網羅的に近縁種間での相同遺伝子を比較する手法について概説し、今後の方向性について述べた。

2. 井口亮*・磯村尚子．造礁サンゴの環境変化に対する順応機構と適応の可能性．海の研究 21:175-186. 2012. サンゴの環境変化に対する応答を調べた研究や総説は多く存在する一方で、サンゴの順応的応答に関する解説は限られている。本総説では、環境変化に対するサンゴの順応的応答及びその機構について、種々の環境要因毎に分けて、これまで行われてきた室内実験の結果や、応募者らの研究成果も合わせて概説した。また、環境の変化に応じて、集団内の遺伝子型の変化が生じてストレス耐性の閾値が変化する、適応の可能性についても触れた。

3. Iguchi A*. A review of genetic intra- and interspecific relationships of deep-sea Buccinum and Neptunea species around Japan (with special reference to the Sea of Japan). Plankton and Benthos Research 5:83-89. 2010.  本総説は、応募者が日本周辺、特に日本海を中心に、DNAマーカーを用いてこれまで明らかにしてきた深海性エゾバイ・エゾボラ属腹足類の遺伝的な種内分化と種間関係についてレビューしたものである。基本的な内容は、応募者がこれまで出した5本の原著論文の研究成果をまとめたものであり、今後の同分野での研究の方向性について述べた。本総説は、応募者が受賞した、2009年度日本ベントス学会奨励賞の総説論文である。

4. 諏訪僚太・中村崇・井口亮・中村雅子・守田昌哉・加藤亜記・藤田和彦・井上麻夕里・酒井一彦・鈴木淳*・小池勲夫・白山義久・野尻幸宏．海洋酸性化がサンゴ礁域の石灰化生物に及ぼす影響．海の研究 19:21-40. 2010. R. Suwa, T. Nakamura, and A. Iguchi contributed equally to this work. 海洋酸性化が海洋酸性化が起こる仕組みと共に、海洋酸性化がサンゴ礁域の石灰化生物に与える影響に関するこれまでの知見を概説した。サンゴ礁の主要な石灰化生物である造礁サンゴや紅藻サンゴモ、有孔虫に関しては、その石灰化機構を解説し、海洋酸性化が及ぼす影響について調べた様々な研究例を取り上げた。また、これまでの研究から見えてきた海洋酸性化の生物への影響評価実験を行う上で注意すべき事項、そして今後必要となる研究の方向性についても述べた。

5. 諏訪僚太*・井口亮. 造礁性サンゴに共生する褐虫藻の分子系統学的研究に関するレビュー（北西太平洋を中心に）．日本サンゴ礁学会誌 2008年12月号．10:1-11. 2008. R. Suwa and A. Iguchi contributed equally to this work. 本総説では、造礁サンゴに共生する褐虫藻を対象とした、分子系統学的手法による北西太平洋でのこれまでの研究成果を基に、他の地域と比較した場合の同海域の褐虫藻の遺伝子型の分布パターンなどについて概説した。また、これまで褐虫藻の遺伝子型決定に用いられてきた分子生物学的手法の問題点にも触れ、今後の同分野での研究の方向性について述べた。

6. Forêt S, Kassahn K, Grasso LC, Hayward DC, Iguchi A, Ball EE, Miller DJ*. Genomic and microarray approaches to coral reef conservation biology. Coral Reefs 26:475-486. 2007. 本総説では、これまでサンゴを含む刺胞動物で得られている遺伝子データベースやゲノム配列などのゲノム情報について概説し、サンゴ礁生物を対象としたマイクロアレイ解析及び比較ゲノミクス的アプローチの応用可能性について述べた。また、加速遺伝子探索を含む、サンゴのストレス応答機構の解明にはこれらのアプローチが非常に有効であり、生命現象の理解に根差したサンゴ礁保全の指針作りにも重要であることについても触れた。

・学術雑誌に発表した総説［査読無］*Corresponding author

1. 井口亮*・中島祐一・藤田純太・鈴木淳・酒井一彦．サンゴの分布境界と石灰化応答との関連を探る．月刊地球．39:31-37．2017年1月．我が国周辺で見られるサンゴ類は、分布北限域に生息しているが、分布の制限要因については不明な点が多い。本総説では、サンゴ類を含む日本の沿岸性海洋生物の集団解析とサンゴ類の石灰化応答を中心に、分布縁辺域でのサンゴ類の生活史の維持に関する知見について概説し、今後の研究の展望と課題について述べた。

2. 井口亮*・伊藤寛治・高井晋平・上野正博・前田経雄・南卓志・豊原治彦・林勇夫．日本周辺に生息する深海性腹足類エゾバイ・エゾボラ属の遺伝的な種内分化と種間関係に関する研究（日本海を中心に）．海洋と生物．30:676-684．2008年10月．本総説では、筆者らが日本周辺、特に日本海を中心に、DNAマーカーを用いてこれまで明らかにしてきた深海性エゾバイ・エゾボラ属巻貝の遺伝的な種内分化と種間関係について、氷河期の海水面低下時には近隣海域から隔離されて何度も環境悪化を受けた日本海の古環境変動と関連づけて概説し、今後の同分野での研究の方向性について述べた。

・シンポジウム・ワークショップ・招待講演等

1. 井口亮（沖縄高専・生物資源）．「スーパーコーラルを特徴づける生物要因の解明」．研究集会「データサイエンスの発展と実社会への応用」．開催責任者：太田佐栄子・西井龍映（九大IMI）．2017年12月14日．沖縄工業高等専門学校．

2. Akira Iguchi. Abundant Center Hypothesis: reef organisms along the Japan coastal area. KIKAI international symposium for coral reef sciences 2015, 23th, August, 2015, Central community centre, Kikai Island, Japan.

3. 井口亮（沖縄高専・生物資源）．「沖縄周辺域のサンゴとサンゴ礁の最近の変動と気候要因」．気候変動に関する政府間パネル（IPCC）公開シンポジウム「地球温暖化問題について考えよう！最新の科学と温室効果ガス排出量監視の取りくみ」．主催：気候変動に関する政府間パネル（IPCC）、公益財団法人地球環境戦略研究機関（IGES）、共催：琉球大学．2015年3月16日．ANAクラウンプラザホテル沖縄ハーバービュー．

4. 井口亮（沖縄高専・生物資源）．「サンゴの遺伝的多様性と海洋酸性化影響」．環境省環境研究総合推進費一般向け研究成果報告会「海洋酸性化がわが国周辺の生物に与える影響を評価する」．主催：環境研究総合推進費2A-1203課題、共催：環境省、独立行政法人国立環境研究所．2015年2月21日．TKP市ヶ谷カンファレンスセンター６A．

5. 井口亮（沖縄高専・生物資源）．「サンゴの分布境界と石灰化応答との関連を探る」．東京大学大気海洋研究所共同利用研究集会「バイオミネラリゼーションと石灰化 -遺伝子から地球環境まで-」．コンビーナー：遠藤一佳（東京大学）．2014年12月13日．東京大学大気海洋研究所．

6. 井口亮（沖縄高専・生物資源）．「変動環境下における造礁サンゴの多様性の進化」．2014年度日本サンゴ礁学会大会．2014年度日本サンゴ礁学会川口奨励賞受賞講演．2014年11月29日．高知城ホール．

7. 井口亮（沖縄高専・生物資源）．「変動環境下でのサンゴ集団内の遺伝的変異ー物質循環との関連ー」．「B-BG21 熱帯ー亜熱帯沿岸生態系における物質循環」．2014年度日本地球惑星連合大会．コンビーナ：渡邉敦・藤田和彦・本郷宙軌．2014年5月1日．横浜パシフィコ．

8. 井口亮（沖縄高専・生物資源）．「はじめにー固着生物の遺伝的多型情報から熱帯性生物の分布境界を考えるー」．「分布境界のサンゴ礁生態学」．2013年度日本サンゴ礁学会大会自由集会②．企画者：井口亮（沖縄高専・生物資源）・本郷宙軌（琉大・理）．2013年12月12日．沖縄科学技術大学院大学．講演要旨集 p.4．

9. 井口亮（沖縄高専・生物資源）．「水環境の変化はサンゴの成長を阻害するかー室内飼育実験からの検証ー」．第16回日本水環境学会シンポジウム「熱帯・亜熱帯地域の水環境その3:海域環境」．2013年11月10日．琉球大学．要旨集p.49．

10. 井口亮（琉大・熱生研）．「造礁サンゴの分子生態学的アプローチ：植物研究との比較」．「サンゴ礁生態学：植物生態学とのアナロジー」．企画者：熊谷直喜，井口亮（琉大・熱生研），向草世香（JST さきがけ，長大水産，琉大熱生研）．第60回生態学会企画集会T08．2013年3月6日．グランシップ静岡．

11. Akira Iguchi. A test of the abundant-centre model: reef organisms in northern peripheral area. Joint International Seminar: Past and present changes in marine ecosystems and biodiversity in the Asia-Pacific region, Oral presentation, 18th, March, 2013, University of the Ryukyus, Okinawa, Japan. 

12. 井口亮（琉大・熱生研）．「北限海域における造礁サンゴ-褐虫藻共生体の環境変化に対する適応の可能性」．第15回日本サンゴ礁学会大会サンゴ礁学シンポジウム「サンゴ礁学の成果と展望」．オーガナイザー：酒井一彦，山野博哉，茅根 創．2012年11月25日．東京大学．

13. 井口亮・熊谷直喜（琉大・熱生研）．「サンゴ礁生態系ネットワークについて考える」．「~若手の異分野連携を考える~日本サンゴ礁学会若手会」．第15回日本サンゴ礁学会大会自由集会．オーガナイザー：井上志保里（東京大学），高橋麻美（琉球大学）．2012年11月23日．東京大学．

14. Akira Iguchi. Natural genetic variation of coral populations underlying adaptive potential to global warming. LIPI - JSPS Asian Core Program Joint International Seminar on Coastal Ecosystems in Southeast Asia, 13th, November, 2012, Jakarta, Indonesia. p.101.

15. 井口亮（琉大・熱生研）．「サンゴの石灰化に見られる種内変異と今後の環境変化に対する適応の可能性」．東京大学大気海洋研究所共同利用研究集会「バイオミネラリゼーションと石灰化 -遺伝子から地球環境まで-」．コンビーナー：中島礼（産業技術総合研究所）．2012年11月9日．東京大学．

16. 井口亮（琉大・熱生研）．「造礁サンゴ-褐虫藻共生体の環境変化に対する適応の可能性-北限海域のサンゴ群集の事例から-」．「空間・場所がもつ条件や位置関係を意識したベントス研究」．2012年度日本プランクトン・ベントス学会合同大会自由集会．世話人：和田 哲（北大・水産）・熊谷直喜（琉大・熱生研）．2012年10月5日．東邦大学理学部（習志野キャンパス）．講演要旨集 p.182．

17. Akira Iguchi. Genetic variation of reef benthic organisms along the Japan coastal area. IOC/WESTPAC Workshop on Coral Reef Restoration Techniques in the Western Pacific Region, 21th, September, 2012, Chulalongkorn University, Bangkok, Thailand.

18. Akira Iguchi. Central-peripheral hypothesis across reef organisms along the Japan coastal area. Pan-Pacific Advanced Studies Institute, 18th, July, 2012, Dumaguete, Philippine.

19. Akira Iguchi. Natural genetic variation of coral populations underlying adaptive potential to thermal stress. Pan-Pacific Advanced Studies Institute, 18th, July, 2012, Dumaguete, Philippine.

20. 井口亮（琉大・熱生研）．「黒潮流域における海洋底生生物の地理的分布と遺伝的多様性形成メカニズム」．「Seascape ecology：海の景観生態学への挑戦」．企画者：熊谷直喜，井口亮（琉大・熱生研），向草世香（JST さきがけ，長大水産，琉大熱生研）．第59回生態学会企画集会T06．2012年3月18日．龍谷大学．

21. 井口亮（琉大・熱生研）．「サンゴ-褐虫藻共生体の順応と適応」．「サンゴの環境変化に対する順応・適応機構について考えるーゲノム（遺伝子）から個体（群体），集団までー」．2011年度日本サンゴ礁学会大会自由集会3．企画者：井口亮（琉大・熱生研）．2011年11月4日．沖縄県男女共同参画センターてぃるる．講演要旨集 p.17．

22. 井口亮（琉大・熱生研）．「日本海における海洋ベントスの遺伝的集団構造とその成立要因」．「日本海は進化のゆりかご? :新生代後期の日本海における古環境変化と生物進化」．日本古生物学会シンポジウム．企画者：神谷隆宏・長谷川卓・北村晃寿．2011年7月1日．金沢市文化ホール．講演要旨集 p.7．

23. 井口亮（琉大・熱生研）．「北限サンゴ礁海域における海洋性ベントスの遺伝的集団構造」．「琉球の生物地理--今後の展開に向けて--」．企画者：戸田守（琉大・熱生研）・富永篤（琉大・教育）．沖縄生物学会・日本動物分類学会合同大会公開シンポジウム．2011年6月4日．琉球大学・大学会館3階ホール．

24. 井口亮（琉大・熱生研）．「環境変化がサンゴの石灰化に及ぼす影響」．東京大学大気海洋研究所共同利用研究集会「バイオミネラリゼーションと石灰化 -遺伝子から地球環境まで-」．コンビーナー：鈴木淳（産業技術総合研究所）．2011年2月10日．東京大学．

25. 井口亮（琉大・熱生研）．「酸性化海水がサンゴに及ぼす影響について」．「海洋酸性化による環境影響：現状と展望」．企画者：石田明生（JAMSTEC）・河宮未知生（JAMSTEC）・鈴村昌弘（産総研）．日本海洋学会2010年度春季大会シンポジウム．2010年3月26日．東京海洋大学．

26. 井口亮（琉大・熱生研）．「ゲノム情報を活用して造礁サンゴの地理的変異を探る」．「サンゴ礁生物の緯度傾斜に沿った変異：ゲノムから生態系まで」．企画者：酒井一彦（琉大・熱生研）・井口亮（琉大・熱生研）．第57回生態学会シンポジウムS09．2010年3月17日．東京大学．

27. 井口亮（琉大・熱生研）．「造礁性サンゴの石灰化の分子基盤に関する研究‐他分野との統合的アプローチの開拓を目指して‐」．「サンゴ礁生物源炭酸塩の形成メカニズムと応用に関するワークショップ」．企画者：藤田和彦（琉大・理）．2010年1月11日．琉球大学５０周年記念館１階多目的室．

28. 井口亮（琉大・熱生研）．「CO2シンポジウム開催の趣旨について」．2009年度日本サンゴ礁学会大会シンポジウム「二酸化炭素増加がサンゴ礁域の海洋生物に及す影響-分子から生理，生態まで-」．企画者：諏訪僚太（京大・フィールド研）・井口亮（琉大・熱生研）．2009年11月28日．本部町中央公民館大ホール．講演要旨集 p.186．

29. 井口亮（琉大・熱生研）．「日本周辺に生息する深海性エゾバイ・エゾボラ属の遺伝的な種内分化と種間関係に関する研究（日本海を中心に）」．2009年度日本プランクトン学会・ベントス学会合同大会．日本ベントス学会奨励賞受賞講演．2009年10月17日．北海道大学．

30. 井口亮（琉大・熱生研）・諏訪僚太（琉大・熱生研）・酒井一彦（琉大・熱生研）・鈴木淳（産総研・地質情報）．「サンゴ礁を中心とした海洋酸性化研究の動向について」．東京大学海洋研究所共同利用研究集会「バイオミネラリゼーションと石灰化 -遺伝子から地球環境まで-」．コンビーナー：鈴木淳（産業技術総合研究所）．2009年4月23日．東京大学．

・その他出版物

1. 井口亮．「川口奨励賞を受賞して」．日本サンゴ礁学会ニュースレター No. 64，p.2，2015．

2. 井口亮．「12th ICRS特集・JCRSブースの紹介」．日本サンゴ礁学会ニュースレター No. 54，p. 6，2012．

3. 井口亮．「サンゴの環境変化に対する順応・適応機構について考えるーゲノム（遺伝子）から個体（群体）、集団までー自由集会開催報告」．日本サンゴ礁学会ニュースレター No. 52，p. 5，2012．

4. 井口亮．「 沖縄生物学会・日本動物分類学会合同大会公開シンポジウム参加報告」．日本サンゴ礁学会ニュースレター No. 50，p. 3，2011．

5. 井口亮．「サンゴ礁関連施設探訪・ジェームス・クック大学」．日本サンゴ礁学会ニュースレター No. 35，p. 7，2007．

6. 井口亮．「サンゴの移植シンポジウム参加報告」．日本サンゴ礁学会ニュースレター No. 33，p. 3，2007．

・謝辞に入った論文（サンプルの提供・解析・原稿へのアドバイス等）

1. Washburn, T. W., Simon-Lledó, E., Soong, G. Y., & Suzuki, A. (2023). Seamount mining test provides evidence of ecological impacts beyond deposition. Current Biology, 33(14), 3065-3071.

2. Seike, K., Sassa, S., Shirai, K., & Kubota, K. (2022). Sediment hardness and water temperature affect the burrowing of Echinocardium cordatum: Implications for mass mortality during the 2011 earthquake–liquefaction–tsunami disaster. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 267, 107763.

3. Kunishima, T., & Tachihara, K. (2021). Patterns in diversity and species composition in soft-sediment tidepool fishes across topographical types: implications for conservation with spatial nuances. Marine Environmental Research, 105442.

4. Kajita, H., Nakamura, H., Ohkouchi, N., Harada, N., Sato, M., Tokioka, S., & Kawahata, H. (2020). Genomic and geochemical identification of the long-chain alkenone producers in the estuarine Lake Takahoko, Japan: Implications for temperature reconstructions. Organic Geochemistry, 142, 103980.

5. Tanaka, M., Genin, A., Endo, Y., Ivey, G. N., & Yamazaki, H. (2021). The potential role of turbulence in modulating the migration of demersal zooplankton. Limnology and Oceanography, 66(3), 855-864.

6. Kunishima, T., & Tachihara, K. (2020). What ecological role do soft-substrate tide pools play for fishes? Difference in community structures between estuarine and coastal tidal flats in subtropical Japan. Marine and Freshwater Research, 71(7), 737-749.

7. Mizuyama, M., Masucci, G. D., & Reimer, J. D. (2018). Speciation among sympatric lineages in the genus Palythoa (Cnidaria: Anthozoa: Zoantharia) revealed by morphological comparison, phylogenetic analyses and investigation of spawning period. PeerJ, 6, e5132.

8. Takeuchi, T., Plasseraud, L., Ziegler-Devin, I., Brosse, N., Shinzato, C., Satoh, N., & Marin, F. (2018). Biochemical characterization of the skeletal matrix of the massive coral, Porites australiensis–The saccharide moieties and their localization. Journal of Structural Biology, 203(3), 219-229.

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10. Inoue, M., Nakamura, T., Tanaka, Y., Suzuki, A., Yokoyama, Y., Kawahata, H., ... & Gussone, N. (2018). A simple role of coral-algal symbiosis in coral calcification based on multiple geochemical tracers. Geochimica et Cosmochimica Acta, 235, 76-88.

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15. Shinzato, C., Inoue, M., & Kusakabe, M. (2014). A snapshot of a coral “holobiont”: a transcriptome assembly of the scleractinian coral, Porites, captures a wide variety of genes from both the host and symbiotic zooxanthellae. PloS One, 9(1), e85182.

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