P3. Análisis de expresión

En esta práctica van a hacer uso de el análisis de componentes principales.

Los datos del microarreglo se encuentran aquí mismo y la función de PCA se calcula de la siguiente manera

Para quedarte con las primeras k filas o últimas k filas de un archivo de texto se usan los comandos head y tail respectivamente:

$ head archivo -n k

$ tail archivo -n k

Pero esto lo exhibiría en la pantalla únicamente, si lo que desean es volcarlo a otro archivo tienen que usar el operdor > . Por ejmplo para redirigir la salida anterior al archivo salida_out.txt lo que tienen que hacer es

$ head archivo -n k > salida_out.txt

$ tail archivo -n k > salida_out.txt

Si desean cambiar los tabuladores por comas en un archivo de texto y dejar la salida en otro archivo, pueden ocupar el comando sed que recibe una expresión regular y luego el archivo donde va a operar

$ sed 's/\t/,/g' GSE20011_series_matrix.txt > GSE20011_series.csv

Otro programa para hacer esto es awk