Date de publication : Mar 15, 2013 2:11:29 PM
Projet SELFADAPT
Trois questions principales seront adressées :
1. Peut-on détecter une évolution adaptative à l’échelle populationnelle chez Medicago truncatula sur une période de 25 ans ? Cette évolution est-elle le résultat d’une adaptation au changement climatique ?
2. Quel est le rôle des mécanismes évolutifs tels que la migration et la recombinaison dans cette évolution ?
3. Quels sont les gènes/allèles impliqués et quelles sont les spécificités pour détecter une signature moléculaire de la sélection dans une population autogame à l’aide de données temporelles ?
WP1 – Etude expérimentale de l’adaptation chez Medicago truncatula en lien avec le changement climatique
L’objectif est de tester si l’évolution phénotypique suggérée par l’expérience conduite en 2012 est adaptative, en utilisant des transplantations « temporelles » dans l’environnement actuel et en mesurant la phénologie et la valeur sélective. L’influence de la migration et de la recombinaison sera testée en incorporant des génotypes de migrants potentiels et de recombinants produits artificiellement dans l’expérience de transplantation temporelle avec les génotypes anciens et modernes.
WP2 – Détection de processus sélectifs récents ou en cours dans des populations locales d’organismes auto-fécondants
Chez les espèces majoritairement auto-fécondantes, la totalité du génome est influencée par la démographie et la sélection. Les questions suivantes seront adressées : (1) quel est le seuil d’auto-fécondation à partir duquel les méthodes classiques (par exemple FST outliers) ne peuvent plus être appliquées ? (2) Au-delà de ce seuil, d’autres méthodes peuvent-elles être développées (adaptation de la méthode de Li (2011) basée sur le déséquilibre des généalogies de gènes) ?