FRENCH (English Below)
PROGRAMME DE LA SESSION 2025 – 24 - 28 mars 2025
Lundi – Amphi Rouelle
- 09h00 : Accueil
- 09h30 à 10h00 : Sarah SAMADI – Introduction
- 10h00 à 12h00 : Sarah SAMADI – Les concepts et méthodes de la taxonomie intégrative au 21ème siècle.
- 12h00 : Pot de bienvenue
- 14h00 à 15h45 : Rodolphe ROUGERIE – Introduction au DNA Barcoding et metabarcoding ; initiatives internationales et applications.
- 16h00 à 17h30 : Nicolas PUILLANDRE – DNA Barcoding et taxonomie intégrative.
Mardi matin – Amphi Rouelle
- 9h00 à 11h00 : Guillaume ACHAZ – Modèles évolutifs en taxonomie intégrative.
- 11h15 à 12h30 : Claire LAGUIONIE / Valentin DETTLING – La taxonomie intégrative en action : étude de la dynamique de pollution par les plastiques.
Mardi am – Salles info
- 14h00 à 17h00 : Rodolphe ROUGERIE / Nicolas PUILLANDRE– TP : Des données brutes aux premières analyses.
Mercredi matin – Amphi Rouelle
- 9h00 à 10h00 : Philippe BOUCHET –De Nagoya à la nomenclature : l'exploration des espèces coincée entre le droit et les codes ?
- 10h15 à 12h30 : Sarah FARHAT – Technologies NGS et Méthodes d’analyses de données NGS
Mercredi am – Salles info
- 14h00 à 17h0 : Sarah FARHAT/Paul ZAHARIAS / Brice MORHAIN – TP : Introduction aux données NGS et reconstruction d’un mitogénome (1ère partie)
Jeudi matin – Amphi Rouelle
- 9h00 à 10h00 : Guillaume ACHAZ – Méthodes de délimitations d’espèces.
- 10h15 à 12h30 : Paul ZAHARIAS – Introduction aux concepts et méthodes de la phylogenomique.
Jeudi am – Salles info
- 14h00 à 15h30 : Sarah FARHAT / Nicolas PUILLANDRE – TP : Délimitation d’espèces
- 15h30 à 17h00 : Sarah FARHAT / Brice MORHAIN– TP : Reconstruction d’un mitogénome (2è3e partie)
Vendredi – Amphi Rouelle
- 9h00 à 10h15 : Didier AURELLE – Apport de la génomique en systématique – exemple des cnidaires
- 10h30 à 12h00 : Anouk BARBEROUSSE – Projet exploratoire et idées nouvelles en science : cas du séquençage des génomes complets.
- 13h30 à 14h30 : Line LEGALL / Sébastien SOUBZMAIGNE : visite herbier/zoothèque.
- 14h30 à 16h00 : Sarah SAMADI – Paradoxes et limites des concepts et pratiques de la taxonomie intégrative.
- 16h00 : Discussion
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ENGLISH
PROGRAM OF THE 2025 SESSION – 24 – 28 March 2025
Monday – Amphi Rouelle
- 09h00: Welcome
- 09h30 - 10h00: Sarah SAMADI – Introduction
- 10h00 - 12h00: Sarah SAMADI – Concepts and methods of integrative taxonomy in the 21st century.
- 12h00: Ice breaker
- 14h00 - 15h45: Rodolphe ROUGERIE – Introduction to DNA Barcoding and Metabarcoding; international initiatives and applications.
- 16h00 - 17h30: Nicolas PUILLANDRE – DNA Barcoding and integrative taxonomy.
Tuesday morning – Amphi Rouelle
- 9h00 - 11h00: Guillaume ACHAZ – Evolutionary models in integrative taxonomy.
- 11h15 - 12h30: Claire LAGUIONIE / Valentin DETTLING –
Integrative taxonomy in action: study of plastic pollution dynamics
Tuesday afternoon – Salles info
- 14h00 - 17h00: Rodolphe ROUGERIE / Claudia RATTI / Nicolas PUILLANDRE / Brice MORHAIN – Practical course: From raw data to preliminary analyses.
Wednesday morning – Amphi Rouelle
- 9h00 - 10h00: Philippe BOUCHET – From Nagoya to nomenclature: the exploration of species stuck between law and codes?
- 10h15 - 12h30: Sarah FARHAT – NGS technologies & Methods of analyses of NGS data.
Wednesday afternoon – Salles info
- 14h00 - 15h30: Magalie CASTELIN / Nicolas PUILLANDRE – Practical course: Species delimitation and phylogeny.
- 15h30 - 17h00: Sarah FARHAT / Brice MORHAIN / Claudia RATTI – Practical course: Introduction to the analysis of NGS data.
Thursday morning – Amphi Rouelle
- 9h00 - 10h00: Guillaume ACHAZ – Species delimitation methods.
- 10h15 - 12h30: Paul ZAHARIAS – A brief introduction to concepts and methods in phylogenomics.
Thursday afternoon – Salles info
- 14h00 à 17h00: Sarah FARHAT / Brice MORHAIN / Claudia RATTI – Practical course: Reconstructing a mitogenome with NGS data.
Friday – Amphi Rouelle
- 9h00 - 10h15: Didier AURELLE – Contribution of genomics to systematics – the example of the cnidarians
- 10h30 - 12h00: Anouk BARBEROUSSE – Big data, exploration and scientific hypotheses.
- 13h30 - 14h30: Line LEGALL / Sébastien SOUBZMAIGNE: visit of the herbarium or zoothèque.
- 14h30 - 16h00: Sarah SAMADI – Paradoxes and limits of the concepts and practices of integrative taxonomy.
- 16h00: Discussion