在Church Era中,一共有九個教團可供玩家遊玩,分別是皇家直屬教團、莊園地主同盟、深山修道院、外國傳教士聯盟、冥神教、無神論者、民間婦女團體、蓬萊府和巫醫旅團,每個教團都有自己獨特的觀點,以及屬於該教團獨有的教士和神蹟。