A ETEC - Sinop é vinculada e administrada diretamente pela SECITECI – Secretaria de Estado de Ciência, Tecnologia e Inovação, localizada em Cuiabá. 

Há dez Escolas Técnicas Estaduais: Alta Floresta, Barra do Garças, Cáceres, Cuiabá, Diamantino, Lucas do Rio Verde, Poxoréu, Sinop, Rondonópolis, Tangará da Serra, as quais fazem atendimento em unidades remotas na região onde está localizada, vinculadas – superintendência profissional e superior da SECITECI.