โรงเรียนชุมชนบ้านหนองฝ้าย ก่อตั้งเมื่อปีพุทธศักราช 2510 บนเนื้อที่ 32 ไร่ 2 งาน โดยนายเคลือบ วารีรักษาราษฎร์

ได้บริจาคที่ดินก่อตั้งโรงเรียน ในระยะเริ่มแรกโรงเรียนชุมชนบ้านหนองฝ้ายเปิดทำการสอนในนามโรงเรียนสาขาของโรงเรียนบ้านหนองโสน เมื่อวันที่ 17 กรกฎาคม พุทธศักราช 2510 ต่อมาวันที่ 1 พฤษภาคม 2511 ได้รับอนุญาตอย่างเป็นทางโดยใช้ชื่อว่า โรงเรียนบ้านหนองฝ้าย เปิดสอนในระดับชั้นประถมศึกษาปีที่ 1-4 ในวันที่ 1 พฤษภาคม พุทธศักราช 2518 ได้ทำการสอนตั้งแต่ชั้นประถมศึกษาปีที่ 1-7 และพุทธศักราช 2519 ทางราชการได้เห็นความสำคัญของชุมชนกับโรงเรียนจึงเปลี่ยนชื่อเป็น โรงเรียนชุมชนบ้านหนองฝ้ายจนถึงปัจจุบัน ต่อมาในปีการศึกษา 2526 ทางราชการได้ปรับปรุงการศึกษาภาคบังคับใหม่ โดยให้โรงเรียนจัดการศึกษาตั้งแต่ชั้นประถมศึกษาปีที่ 1-6 ในปีพุทธศักราช 2553 ได้เป็นโรงเรียนขยายโอกาสทางการศึกษาได้เปิดสอนในระดับชั้นมัธยมศึกษาตอนต้น และต่อมาปี พุทธศักราช 2551 ได้จัดการศึกษาในระดับชั้นมัธยมศึกษาตอนปลาย ปัจจุบัน นายมณเฑียร ภู่ศรีพันธ์ วิทยฐานะเชี่ยวชาญ ดำรงตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนชุมชนบ้านหนองฝ้าย