โรงเรียนบ้านจ่ากองตั้งอยู่หมู่ที่ 6 ตำบลปะเสยะวอ อำเภอสายบุรี จังหวัดปัตตานี เปิดทำการสอนเมื่อ พ.ศ. 2508 บนที่ดินบริจาคเนื้อที่ 1 ไร่ 
2 งาน 45 ตารางวา ในที่ดินของนายมะแซ  อาแว  โดยมีนายแถบ  เงินราษฎร์  เป็นครูใหญ่คนแรก ต่อมาได้ย้ายมาสร้างโรงเรียนในที่ดินแปลงใหม่เนื่องจากที่เดิมนั้นเป็นพื้นที่อยู่ห่างจากชุมชนและอยู่ในพื้นที่ล่อแหลมยากในการเดินทาง ที่ดินแปลงใหม่ได้รับความร่วมมือจากชาวบ้าน ผู้ใหญ่บ้านและนายกสม  อุทัยพันธ์ ร่วมกันบริจาคเงิน จำนวน  10,000 บาท  ซื้อที่ดินแปลงใหม่ เนื้อที่ 6 ไร่ 3  งาน  47  ตารางวา และได้มอบที่ดินแปลงนี้ให้องค์การบริหารส่วนจังหวัดและได้สร้างโรงเรียนบ้านจ่ากองขึ้นใหม่

สภาพชุมชนรอบบริเวณโรงเรียน เป็นชุมชนใกล้ฝั่งทะเลอ่าวไทย ระหว่างทะเล มีลำคลองที่ออกสู่ทะเลได้  มีเขตบริการ 1 หมู่บ้าน ประชากรในเขตบริการ คือ หมู่บ้านจ่ากองหมู่ที่ 6 ซึ่งเป็นที่ตั้งของโรงเรียนประชากรนับถือศาสนาอิสลาม 100 % ภาษาที่ใช้ในการสื่อสารในชีวิตประจำวันใช้ 2 ภาษา แต่จะใช้ภาษามลายูท้องถิ่นเป็นส่วนใหญ่ อาชีพของประชากรในชุมชนส่วนใหญ่จะเป็นอาชีพทำสวนยาง สวนมะพร้าว รับจ้างทั่วไป ค้าขาย และรับราชการ

ปัจจุบันโรงเรียนบ้านจ่ากอง  สังกัด  สำนักงานเขตพื้นที่การศึกษาประถมศึกษาปัตตานี  เขต 3  สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน  กระทรวงศึกษาธิการ  สถานที่ตั้ง  หมู่ที่ 6 (บ้านจ่ากอง)  ตำบลปะเสยะวอ  อำเภอสายบุรี จังหวัดปัตตานี  จำนวนข้าราชารและบุคลากรทางการศึกษา  ทั้งหมด 12 คน  จำนวนนักเรียนระดับชั้นอนุบาล  18 คน  และระดับประถมศึกษา  53 คน  รวมนักเรียนทั้งหมด  71 คน  นักเรียนนับถือศาสนาอิสลาม  คิดเป็นร้อยละ 100