IMARIS Workshop 2026
日程： 2026.7.1（水）〜7.3（金）
申込〆切： 2026.5.31（日）
ライフサイエンス用の多次元画像解析ソフトウェアの一つである「IMARIS」について、その使い方や解析方法の理解を目的として、講義と実習を行います。
※IMARISはOxford Instruments社の有償の商用ソフトウェアです。本ワークショップでは最新のデモ版（試用ライセンス）を使用します。
基礎編と応用編に分けて、それぞれ１日半ずつ行います。（会場1からオンライン配信で講義・実習を行い、各サテライト会場にもスタッフが付いてサポートする形式）。日本語で行われます。
・基礎編の内容：3D/4D画像の取扱い、基本操作（データの表現方法、SurfaceやSpotといった二値化処理）、動画やスナップショットの作成、数や体積・輝度などの計測方法、機械学習の基礎（セグメンテーション、分類）、共局在解析
・応用編の内容：基礎編の内容をベースに、より複雑な機械学習、タイムラプスデータのトラッキング、神経など線維状構造の3D解析や計測、細胞単位での小胞の解析、また、解析結果の表現方法についても学びます
ポスターはこちら
基礎編：2026年7月1日（水）〜 7月2日（木）午前 プログラムはこちら
応用編：2026年7月2日（木）午後 〜 7月3日（金） プログラムはこちら
基礎編・応用編の違い（目安）
・基礎編：これまでIMARISをほとんど使用したことが無い、あるいは、すでに利用しているが操作・機能を基本から学びたい方。
・応用編：IMARISユーザーであり、基礎編の内容はすでに理解しており、より高度な機能を知りたい方。
プログラム内容をご覧頂き、どちらか一方、あるいは、両方をご選択下さい。
1: 岡崎会場：基礎生物学研究所 【明大寺キャンパス 会議室（〒444-8585 岡崎市明大寺町字西郷中38番地）】
2: 京都会場：京都大学・医学部【京都大学医学部先端科学研究棟（Map内16番建物） 1階 小セミナー室（〒606-8303 京都府京都市左京区吉田近衛町）】京都駅からは医学部附属病院への循環路線バス（hoop）のご利用が便利です。
3: 九州会場：九州大学・医学部【九州大学医学部・基礎研究A棟（Map内①）2階セミナー室（〒812-8582 福岡県福岡市東区馬出3-1-1 ）】
エクストラ：オンライン（大学等研究機関でImarisを含む機器管理や研究者支援をされている技術職員や支援職員の方）募集は別途→詳細
基礎編：
講義：画像解析のための顕微鏡画像取得の基本（亀井）
講義： Imarisの概要説明（以下山口）
実習： Imarisの基本操作（Converter/ Volume/ Cutting/ Snapshot/ Movie）
実習： Spot / 粒状構造モデルの作成
実習：測定機能（Classification含む）
実習：Surface / 3D表面モデルの作成 （2つの閾値設定方法、Classification含む）
実習：Machine learning（Segmentation, Classification）
実習：Coloc / 2チャンネル間のシグナル共局在性の測定
応用編：
講義：画像解析に関する講義（加藤）
実習：Machine learningとSpot/Surfaceの編集（以下山口）
実習：Cell / 測定対象を細胞・核・小胞に分類し、それぞれの個数や位置関係などの関係性を解析
実習：Filament Tracer / 神経など線維状構造の自動検出とモデリング
実習：Tracking / タイムラプスデータにおける物体の動態追跡
実習：Vantage / 計測データの可視化とグラフ化
大学または研究機関等に属し、生物画像を取り扱う方（学生・院生を含む研究者、研究支援に携わる方）
日本語が十分理解できる方。
（各編で全ての講義・実習を受講すること。部分参加は認めません。）
無料
基礎編・応用編ともに20名程度
（各会場の定員の目安：基生研7名、京大7名、九大7名）
各編の全日程の参加を原則とし、部分的な参加は不可とします。
下記フォームから必要事項を入力し、送信してください（基礎編、応用編共通です）（技術支援者向けオンライン受講枠あり：詳しくはこちら）
申し込み多数の場合には受講の必要性を考慮して選考させて頂きます。
申込み締め切り：2026年5月31日（日）
＊採択通知は2026年6月10日（水）までにお送りします。10日までに届かない場合は、ご連絡ください。
山口 雅子（オックスフォード・インストゥルメンツ株式会社）（岡崎）
加藤 輝（基礎生物学研究所 超階層生物学センター バイオイメージング解析室）（岡崎）加藤ABiS
亀井 保博（基礎生物学研究所 超階層生物学センター バイオイメージング解析室/共同利用推進室）（岡崎）亀井ABiS
高倉 加奈子（京都大学大学院 医学研究支援センター/生命科学研究科 蛍光生体イメージング室）（吉田ホスト）
富沢 瑶子（京都大学大学院生命科学研究科）（吉田）
寺尾 由里 （大阪大学大学院 医学系研究科 附属共同研究実習センター）（吉田）
甲本 真也（沖縄科学技術大学院大学 イメージングセクション/基礎生物学研究所 超階層生物学センター バイオイメージング解析室）（吉田）甲本ABiS
清田 恵美（九州大学 医学研究院附属 ヒト疾患モデル研究センター 教育・研究支援センター）（馬出ホスト）
高見 重美（九州大学 医学研究院附属 ヒト疾患モデル研究センター 教育・研究支援センター）（馬出）
奥川 友紀（九州大学 農学部教育研究基盤技術部 コアファシリティ部門 バイオイメージング技術班）（馬出）
田宮 僚祐（九州大学 農学部教育研究基盤技術部 コアファシリティ部門 バイオイメージング技術班）（馬出）
森 加奈恵（佐賀大学 総合分析実験センター）（馬出）
浅尾 桃子（基礎生物学研究所 超階層生物学センター バイオイメージング解析室/共同利用推進室）（岡崎）
斎田 美佐子（基礎生物学研究所 超階層生物学センター バイオイメージング解析室）（岡崎）
高木 知世（基礎生物学研究所 超階層生物学センター バイオイメージング解析室）（岡崎）
餘家 博（基礎生物学研究所 時空間制御研究室）（岡崎） 野中ABiS
＜スーパーバイザー＞
青木 一洋（京都大学大学院生命科学研究科）青木ABiS
基礎生物学研究所 超階層生物学センター バイオイメージング解析室
オックスフォード・インストゥルメンツ株式会社
学術変革領域研究（学術研究支援基盤形成）「先端バイオイメージング支援プラットフォーム（ABiS）」
京都大学大学院 医学研究科 医学研究支援センター 蛍光生体イメージング室/京都大学大学院生命科学研究科
九州大学 医学研究院附属 ヒト疾患モデル研究センター 教育・研究支援センター
九州大学 農学部教育研究基盤技術部 コアファシリティ部門
こちらからご一読ください。
基礎生物学研究所 超階層生物学センター バイオイメージング解析室
Email: img [at] nibb.ac.jp