Fungsi-fungsi utama BHEA adalah seperti berikut: 

1) Pentadbiran Am

• Menguruskan dan mengemas kini pendaftaran kursus pelajar di SIMBIZ/ NBUCLMS.

• Menguruskan pengesahan pendaftaran kursus untuk pemerhatian Dekan, pensyarah dan pelajar.

• Menguruskan dan menyediakan jadual waktu pelajar bagi setiap semester baru.

• Merancang dan mengemaskini kalendar akdemik bagi setiap semester baru.

• Menguruskan dan menyemak permohonan pelajar untuk pengecualian kredit.

• Menguruskan permohonan pelajar untuk menukar program.

• Menguruskan permohonan pelajar untuk menukar status dari sepenuh masa hingga separuh masa.

• Menguruskan dan mengemas kini permohonan pelajar untuk cuti khas. (Penagguhan kuliah/ganti kelas)

• Mengendalikan mesyuarat Akademik dan mesyuarat peperiksaan di peringkat program dan Jawatankuasa Akademik, termasuk Senat.

• Memastikan Portal Pelajar (NBUCLMS) dan SIMBIZ dapat digunakan dengan baik oleh pensyarah dan pelajar.

• Menguruskan keperluan dan kemudahan bilik kuliah.

• Mengurus dan menilai cara pengajaran pensyarah kepada pelajar setiap semester.

2) Menguruskan Pembangunan Program

• Menjaga dan mengemas kini sukatan pelajaran dan struktur kursus / pengajian pelajar.

• Memastikan program yang ditawarkan mendapat akreditasi penuh daripada MQA

• Menjalankan penyelidikan berkaitan program yang berpotensi untuk dibangunkan.

• Membangunkan program baru yang bersesuaian dengan kehendak pasaran. 

3) Menguruskan Transkrip & Skrol

• Mencetak sijil rasmi bagi yang sudah bergraduasi.

• Menyimpan data dan salinan pelajar yang sudah bergraduasi.

4) Menguruskan Penilaian & Peperiksaan Akhir Pelajar

• Menyediakan jadual waktu peperiksaan dan memastikan kapasti dean/kelas yang digunakan mencukupi.

• Menguruskan slip peperiksaan pelajar.

• Menguruskan dan menyediakan salinan induk kertas soalan dan mencetak kertas soalan peperiksaan.

• Menguruskan dan menjalankan serta memantau peperiksaan akhir pelajar.

• Menguruskan dan menyemak markah peperiksaan di SIMBIZ.

• Menguruskan rayuan untuk memeriksa semula keputusan peperiksaan akhir termasuklah permohonan pelajar untuk melanjutkan pelajaran.

• Menguruskan pembetulan serta semakan keputusan peperiksaan akhir pelajar.

5) Lain-lain

• Urusan yang melibatkan dengan pelajar dan pensyarah fakulti.