Embedded Files
Co nás zajímá?
Co nás zajímá?
Fascinuje nás svět hormonální regulace rostlin, především role toku auxinu rostlinou, který se při své pouti od vrcholku ke kořenům podílí na řízení většiny vývojových událostí v rostlině.
Jsme propojeni s Laboratoří hormonálních regulací u rostlin AV ČR.
Používáme kompletní paletu molekulárně-biologických přístupů (lokalizace proteinů prostřednictvím fluorescenčních markerů, CRISPR/Cas9 mutageneze, NGS transkriptomika), klasickou konfokální a light-sheet mikroskopii, super-rezoluční mikroskopii a bioinformatické fylogenetické přístupy (automatizované zpracování obřích dat s využitím výpočetního klastru METACENTRUM)
Zkoumáme vnitrobuněčnou lokalizaci auxinových přenašečů nejrůznějšími mikroskopickými metodami, včetně super-rezolučních.
Snažíme se rekonstruovat evoluci auxinové signalizace prostřednictvím studia auxinové signalizace u řasových příbuzných vyšších rostlin.
Zabýváme se komplexními vývojovými regulace u rostlin, kterými rostlina řídí otevírání prašníků s ohledem na počasí.
Témata prací
Témata prací
Uvítáme uchazeče o bakalářské, diplomové i doktorské práce. Nabízíme témata prací z těchto okruhů:
Lokalizace auxinových přenašečů a jejich interakce s cytoskeletem
Evoluce auxinové signalizace, role auxinu (a jiných fytohormonů) u řasových předchůdců rostlin
Regulace otevírání prašníků
Konkrétní téma rádi přizpůsobíme Vašim představám, neváhejte se na nás obrátit s vlastním nápadem!
Odkaz na práce vypsané v SIS vedoucí Jan Petrášek Stanislav Vosolsobě
Co se u nás můžete naučit?
Co se u nás můžete naučit?
Práci rostlinami i buněčnými kulturami ⚫Klonování genů a přípravu fluorescenčně značených proteinů ⚫ Transformaci rostlin ⚫ Konfokální fluorescenční mikroskopii ⚫ Elektronovou skenovací mikroskopii ⚫ Proteomickou analýzu ⚫ Práci se sekvenčními databázemi ⚫ Fylogenetickou analýzu ⚫ Zpracování dat v prostředí R ⚫ Práci s výpočetním klastrem METACENTRUM ⚫ Skriptování v jazyce BASH
Lidé
Lidé
RNDr. Jan Petrášek, Ph.D.
RNDr. Jan Petrášek, Ph.D.
Vedoucí týmu Pod vedením Evy Zažímalové a Zdeňka Opatrného absolvoval PřF UK prací na téma hormonální regulace dělení a prodlužování rostlinných buněk (2007). Od té doby se věnuje zejména studiu regulace a lokalizace auxinových transportérů prostřednictvím pokročilých mikroskopických technik, dále i evoluci auxinové signalizace u rostlin.
Výuka Praktické základy vědecké práce (MB130P16), praktikum Růst a vývoj rostlin (MB130C78)
Publikace Google Scholar
Kontakt petrasek@ueb.cas.cz
Konzultační hodiny v úterý a v pátek po předchozí domluvě
Mgr. Stanislav Vosolsobě, Ph.D.
Mgr. Stanislav Vosolsobě, Ph.D.
Postdok PřF UK absolvoval pod vedením Kateřiny Schwarzerové a Jana Petráška s prací zabývající se evolučním studiem membránových proteinů (2019), věnuje se evolučně-vývojové biologii, zejména zkoumání evoluce auxinové signalizace bioinformatickými přístupy.
Výuka Příběhy z evoluce rostlinné signalisace (MB130P89)
Publikace Google Scholar
Kontakt vosolsob@natur.cuni.cz
Konzultační hodiny distanční působení, konzultace na jakémkoliv místě světa po předchozí domluvě
Metodické texty
Metodické texty
Manuál Výpočetní metody experimentální biologie (pracovní, nedokončená verze)
Metoda kvantifikace membránové lokalizace periferního proteinu
Kontakt
Kontakt
Laboratoř 002 v přízemí vlevo od hlavního vchodu, použijte zvonek na dveřích
Telefon
+420 22 195 1695
Adresa
Katedra experimentální biologie rostlin
Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta
Viničná 5
128 44 Praha 2
Page updated
Report abuse