自九年國教實施後，南湖地方熱心教育人士湯桂霖先生等全力爭取設立國中便利子弟入學，幾費周折始於民國五十九（西元一九七○）年八月一日成立，初隸苗栗縣立大湖國民中學南湖分部，由政府收購義和村蔗部坪（現校址）土地兩公頃，鳩起庇建校舍，招入新生五班，同年九月正式開學。
民國六十三（西元一九七四）年八月一日奉准獨立并派顧海濱先生(63年-69年)為首任校長，歷經余次琦校長(69年-77年)、張崇廉校長(77年-79年)之精心擘畫增建校舍及附屬工程添購各科教具，規模奐衍具備。本校學區範圍遼闊，學生分佈於南湖、栗林、東興、武榮及卓蘭之景山、坪林等六所國小，多為農家勤奮子弟。
民國八十一（西元一九九二）年四月黃立偉先生奉調接長本校，提出勤讀書、守秩序、愛整潔、有禮貌，為辦學方針，八十二(西元一九九二)年八月林乾福先生接長本校加速革新，加強學生學業成績及品德陶冶。在全校師生之努力下本校發皇當計日可待矣。
民國八十五(西元一九九六)年九月黃德治先生接掌本校，加強學生安全教育，提倡教學正常化，提倡「德育為重，五育並進」之教育政策，並加強人文主義及道德教育之推展，努力培育「勤學習」、「有禮貌」、「愛整潔」、「守秩序」、「講誠信」、「尚倫理」之學習。
民國八十九年(西元二○○○年)二月莊秀蓮校長接掌本校，提出六大治學理念：
一、 千禧心、教育情，營造溫馨校園。
二、 秉持教育政策，精進誠樸辦學。
三、 恢宏師道尊嚴，提升專業素養。
四、 重視受教權益，落實有教無類。
五、 行動研究發展，迎接教改挑戰。
六、 結合社區特色，共創「南湖」願景。
民國九十年八月一日謝義鄉校長接掌本校，提出四大願景及治校策略：(新設階梯式禮堂、溫室花房、風雨教室、綠美化校園環境)
一、 教育四大願景：勤勞、健康、智慧、才華
二、 成長方案：推手專案、缺口專案
三、 管理策略：管理化、差異化
四、 行動準則：用心、徹底、合理、創新
民國九十四年八月一日胡瑞蓉校長接掌本校，提出三新六好新願景：(操場配合南湖溪整治，於
一、 新校園運動：社區營造、環保、生態、綠美化。
二、 三新六好新願景：新世紀、新願景、新觀念、好師資、好教學、好設備、好環境、好品質、好安心。
三、 設計多樣化的學習管道：升學、藝能、秩序、禮貌樣樣均佳。
四、 以學生學力能力提昇、教師專業能力精進為總目標，培養勤勞、健康、智慧、才華的學生。
民國九十八年傅天養校長接掌本校，同年十二月因病住院，九十九年一月病逝。
民國九十九年二月一日余海青校長奉命代理校長，提倡電子化效率管理，實施線上公文簽辦。
民國九十九年八月一日賴志良校長接掌本校，堅持發揮教育愛，不放棄任一孩子；提升關照能，成就每一孩子；以學生為核心，營造精緻卓越的學校。自103學年度至105學年度起增班(7、8、9班)，提出八大教育理念：
一、 發揮教育大愛，引導全人發展
二、 啟迪多元智慧，追求卓越教育
三、 引領專業發展，提升學習成效
四、 適才適性啟發，激發學生潛能
五、 創造教學空間，活化學習型態
六、 充分掌握資源，積極有效運用
七、 結合社區力量，共創學校風華
八、 擴展前瞻遠見，追求精緻卓越
民國105年八月一日徐曉雲校長接掌本校，其教育理念與經營策略為：
一、我的教育理念-學生未必出類拔萃， 但一定是獨一無二的(盧梭)
二、我的教育願景-以全人教育為目標， 培養每位學生擁有「真、善、美」 的人格特質
三、我的辦學理念及抱負-
(一) 讓家長放心
(二) 讓老師敬業樂業
(三) 讓每一位學生活活潑潑進而樂於學習
(四) 建立一所「傳承、創新、優質、安全」的學校
四、經營策略
(一)學生第一、快樂成長
(二)教學為先、提升品質
(三)專業成長、自我充實
(四)結合家長、廣納資源
(五)僕人領導、注重和諧
(六)友善環境、安全至上
(七)行政運作、注重效率