Gastrointestinální helminti parazitující u ovcí a koz se vyskytují v různých částech jejich trávicího traktu. Motolice se nacházejí typicky v játrech (případně v bachoru), tasemnice v tenkém střevě a hlístice ve slezu, tenkém a tlustém střevě. Pastevně chovaní přežvýkavci jsou často parazitováni celou řadou druhů helmintů a běžná je přítomnost několika druhů helmintů současně. Pro některé druhy těchto parazitů neexistuje český název. Přehled nejběžnějších druhů gastrointestinálních helmintů je uveden níže.
Motolice
motolice jaterní (Fasciola hepatica)
motolice jelení (Paramphistomum cervi)
motolice kopinatá (Dicrocoelium dendriticum)
motolice velká (Fascioloides magna)
Tasemnice
Moniezia expansa
Hlístice
vlasovka slezová (Haemonchus contortus)
Teladorsagia circumcincta
Trichostrongylus axei, T. colubriformis, T. vitrinus
Nematodirus filicollis, N. battus
Cooperia curticei
Bunostomum trigonocephalum
hádě dobytčí (Strongyloides papillosus)
Oesophagostomum columbianum, O. venulosum
zubovka ovčí (Chabertia ovina)
Trichuris ovis, T. skrjabini, T. discolor