1977年韓偉院長邀請榮總牙科主任惠慶元擔任牙醫學系系主任。惠主任依其國防牙醫學系執教的經驗，及運用榮總牙科資源，規劃陽明牙醫的教學雛形，並商請宗邁建築師事務所設計牙醫系館。1979年詹兆祥接任牙醫學系系主任，解決建設系館經費不足之困境，牙醫系館終於1981年順利完工。教育層面，在詹主任的帶領下，榮總牙科部傾力支援陽明牙醫教學工作，聘任海外進修歸國的榮總醫師，並提供學生充足的臨床訓練場域。此外，詹主任栽培後進亦不遺餘力，積極安排畢業生出國進修。且為推動牙醫學院的籌設，1990年代先後設立牙醫科學研究所及口腔生物研究所，1994年成立牙醫學院籌備處，踏出成立牙醫學院的第一步。

1997年詹兆祥主任退休，由林子淮主任接棒，從撰寫計畫書開始，推動牙醫學院申請成立的工作。在林子淮、楊世芳、許明倫等人積極爭取下，2000年成立全臺首間國立牙醫學院，林子淮擔任代理院長。2001年張哲壽教授出任牙醫學院首任院長。任內成功爭取頂尖大學計畫經費，改建實驗室、e化教室等，提升牙醫館的教研能量與空間舒適度。

隨著醫學教育觀念逐漸轉向，鼓勵學生以問題為導向建立主動討論的學習態度 (Problem-Based Learning, PBL)，張哲壽院長參考國外院校的教學經驗，推展醫牙基礎整合課程，將PBL精神落實在陽明牙醫教育，成為國內牙醫學教育改革先驅。