微生物與免疫學是醫學重要基礎，以微觀視野探討生物體間的相互作用：前者聚焦細菌、病毒、黴菌等微生物的辨識與檢驗，後者探討免疫系統識別和對抗微生物所產生的反應。17世紀雷文霍克（Antoni van Leeuwenhoek）用顯微鏡觀察描述肉眼不可見的生物構造，開啟微生物的微觀世界。18世紀末詹納（Edward Jenner）落實接種牛痘的功效，指引免疫的具體應用。19世紀細菌學說（germ theory）興起，致病菌陸續發現，其免疫應用，如巴斯德殺菌法（Pasteurization）與疫苗研發，甚至血清抗體等也快速發展，為微生物與免疫學立下里程碑。

臺灣微生物學的發展可追溯至日治時期。統治初期因傳染病威脅甚鉅，細菌研究學者堀內次雄來臺進行檢測，配合防治政策，成功撲滅鼠疫。之後臺灣總督府於1909年成立「臺灣總督府研究所」，進行細菌、傳染病及家畜傳染病等研究，並陸續設置衛生學部、化學部與動物學部等，完善臺灣的防疫，惜因戰爭而中斷。戰後臺灣人員物資頻繁進出，疫情再起，社會動盪。當局仰賴美國援助，透過公衛基礎建設與衛生改進，重新將瘧疾、結核病等傳染病加以控制。隨著抗生素的興起與應用，1960年代免疫學快速進展，探討自體免疫等不同機制。與此同時，海外歸國學者韓韶華等人將現代免疫學帶入臨床，為學界開啟過敏病、腫瘤免疫等研究領域，讓免疫學與微生物學不論在基礎或治療上都相得益彰。