1981年，國科會鑑於基因工程的潛力，籌劃利用基因工程技術生產B型肝炎疫苗，期望藉團隊合作有效抑制國內肝炎蔓延。陽明參與研究的老師包括醫技系劉武哲、丁令白；生化學科朱廣邦、吳研華與微免所羅時成，稱為陽明基因工程5人小組，也開啟跨科合作的新篇章。該研究之疫苗研發雖未成功，但仍是B型肝炎防治歷史脈絡中之重要環節。 

1980年代陽明同時進行著肝癌細胞基礎及臨床醫學的研究，成功建立三個肝癌細胞株，並發現肝癌細胞株上有致癌基因的表現。此成果除延續B型肝炎疫苗的研究，更找到了抑制肝癌細胞的生長因子，及肝癌病人的血清內，會與肝癌細胞株核抗原結合的自體抗體，有助臨床診斷與治療。參與本實驗學者多為微免所教師，有張仲明、丁令白、羅時成、陳宜民、朱明惠，兼任教師韓韶華、胡承波、周成功、蘇宗笙，以及榮總副院長彭芳谷和其他科科主任等。

融合瘤由免疫細胞和癌細胞結合而成，具備兩者的特性，既能製造抗體，又擁有無限增值的能力，能形成可量產的抗體（亦即單株抗體）。1980年代有兩大技術，一是基因工程，二是融合瘤，教育部為了發展新技術，委託大學舉辦基因工程與融合瘤的訓練班。融合瘤技術訓練班於1982年在陽明舉辦，由張仲明負責籌畫。

黃雪莉自2017年起為國際學生開設「微生物科技與新藥研發」暑期課程，內容涵蓋基礎課程、實驗室見習與業界參訪等，參與學生從越南大學，逐步拓展到新加坡、韓國、瑞典等9國15所大學，也促成5位學生於2020年入讀陽明大學碩士班。截至今年（2023年）該課程仍然持續舉辦中。 

本校活躍於微生物學的老師有蔡文城、胡小婷和許萬枝等，其中蔡文城不僅深耕微生物領域多年，擔任榮總檢驗部臨床微生物科主任，還創立食品安全檢驗中心、微生物檢驗產品公司與台灣檢驗及品保學會。

蔡文城開發之「細菌電腦密碼鑑定系統」是微生物診斷的一大創舉，結合電腦技術和微生物學知識，快速準確地鑑定細菌菌種。其著作《實用臨床微生物診斷學》，也結合「細菌電腦密碼鑑定系統」技術，持續加入新的檢測流程和病原種類。該書自1983年出版第一版以來，至2021年已出版第十二版，在微生物領域有著重要的貢獻。 

1998年成立陽明愛滋病防治及研究中心，首任主任為時任公共衛生研究所教授的陳宜民，1992年美國返臺後，致力於第三級病毒包括HIV、SARS冠狀病毒及禽流感病毒之研究。中心擁有生物安全第三級實驗室，大力推動愛滋病毒的預防，以及降低愛滋病毒感染對個人及社會所造成的影響。該中心延續陳宜民在肝癌與HIV的工作，了解臺灣HIV亞型的分布，更在SARS流行期間支援政府病毒篩檢，展現社會責任。