中心成立於1981年，地點位於教學大樓3樓，當時僅有一間教室與一張桌子，經費來源為訓導處。

 1990年中心搬遷至院長官邸(現韓偉故居)。原本空間僅為一樓車庫，後擴張到餐廳、客廳，最後整棟樓層皆為中心所用。它是一個承載許多記憶的空間，老師們花費許多心力規劃布置，尤其是一樓壁爐和韓偉院長搖椅，除了是諮商及視聽的區塊，對心理諮商更具重要的象徵意義；而院子外的園地有著韓韶華院長、師生、職工們貢獻種子、植栽及勞動成果。

 1995年中心擬向教育部申請經費整修官邸，教育部告知辦公空間不可使用院長官邸，中心不得不離開山腰，搬遷至活動中心6樓，但也因此得以進行符合中心需求之規劃，將家具選用溫暖的原木，打造中心成為陽明的心靈之家。遷移後，每位老師均有獨立的諮商室，門片也選用隔音材質及獨特無鎖門把設計，防止學生發生危險。

 2004年成立資源教室，主責身心障礙學生輔導業務。考量學生特性及空間規劃，兩年後從6樓遷移至4樓，並於2022年進行隔音工程，以提供更完善的輔導空間。