พ.ศ. 2509 โดยมีพระราชกฤษฎีกาจัดแบ่งคณะในมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ เมื่อวันที่ 1 มีนาคม 2509 ได้เปลี่ยนชื่อเป็น คณะเกษตร พร้อมกับแบ่งส่วนราชการใหม่เป็น 8 แผนกวิชาและแผนกวิชาเกษตรศาสตร์ซึ่งเดิมรวมกับภาควิชาปฐพีวิทยา ได้แยกจากกันและเปลี่ยนชื่อเป็นแผนกวิชาพืชศาสตร์
พ.ศ. 2511 ได้เปลี่ยนหลักสูตรปริญญาตรีเป็น 4 ปี
พ.ศ. 2512 มีประกาศสำนักนายกรัฐมนตรี เรื่องการแบ่งส่วนราชการในมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ และแบ่งภาควิชา โดยเปลี่ยนจากแผนกวิชาเป็นภาควิชาในทุกคณะ
พ.ศ. 2518 มีประกาศสำนักนายกรัฐมนตรี เรื่องการแบ่งส่วนราชการในมหาวิทยาลัยเกษตรศาสตร์ ลงวันที่ 2 ตุลาคม 2518 ได้เพิ่มภาควิชาใหม่ในคณะเกษตร 4 ภาควิชา คือ 1) ภาควิชากีฏวิทยา 2) ภาควิชาโรคพืช 3)ภาควิชาพืชสวน และ 4) ภาควิชาพืชไร่นา โดยแผนกวิชาพืชศาสตร์ได้แยกจากกันเป็นภาควิชาพืชสวน และภาควิชาพืชไร่นา
พ.ศ. 2522 ได้เริ่มกิจกรรมการเรียนการสอนที่วิทยาเขตกำแพงแสน จ.นครปฐม เมื่อวันที่ 8 พฤศจิกายน 2522 ซึ่งเป็นวันเปิดภาคเรียนภาคปลายปีการศึกษา 2521 โดยเริ่มให้นิสิตปริญญาตรีชั้นปีที่ 3 และ 4 หลักสูตรวิทยาศาสตรบัณฑิต (เกษตรศาสตร์) ไปศึกษา ทำให้ภาควิชาพืชไร่นาแบ่งออกเป็น 2 วิทยาเขต คือ 1) วิทยาเขตกำแพงแสน และ 2) วิทยาเขตบางเขน ต่อมาในปีการศึกษา 2528 ได้เคลื่อนย้ายนิสิตชั้นปีที่ 1 ของหลักสูตรนี้ไปศึกษา ณ วิทยาเขตกำแพงแสนเป็นต้นมา
พ.ศ. 2546 ภาควิชาพืชไร่นา ได้สังกัดอยู่ในคณะเกษตร กำแพงแสน ซึ่งได้รับการสถาปนาเป็นคณะใหม่ เมื่อวันที่ 17 มีนาคม 2546 และปัจจุบันภาควิชาพืชไร่นาเปิดสอนระดับปริญญาตรี โท และเอก ที่วิทยาเขตกำแพงแสน โดยมีหลักสูตรดังนี้
🎓 วิทยาศาสตรบัณฑิต สาขาเกษตรศาสตร์
🎓 วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาพืชไร่
🎓 วิทยาศาสตรมหาบัณฑิต สาขาปรับปรุงพันธุ์พืช
🎓 ปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาพืชไร่
🎓 ปรัชญาดุษฎีบัณฑิต สาขาปรับปรุงพันธุ์พืช