[1] 과학재단 국가핵심연구센터 "오염물질의 고도처리기술 및 바이오모니터링 기술개발"(2004-2010)
[2] 농촌진흥청 바이오그린 21사업 "병원성세균의 Virulence factor 탐색"(2005-2007)
[3] 학술진흥재단 신진교수연구사업 "E. coli O157:H7 Biofilm 및 산화적 스트레스연구"(2007-2009)
[4] 과학재단 특정기초사업 "Pseudomonas pudia Fpr의 분자진화에 대한 연구"(2008-2010)
[5] SK건설 연구용역사업 "유류분해미생물의 속도증진 연구개발"(2008)
[6] 한국농촌공사 연구용역사업 "반환미군기지 환경정화사업"(2009)
[7] 국립환경과학원 연구용역사업 "환경정화용 LM미생물 환경안전성관리기법개발"(2009-2011)
[8] 연구재단 일반연구자지원-기본연구"산화적스트레스유도 환경세균 세포사멸연구"(2009-2012)
[9] 극지연구소 "기후변화에 따른 극지 육상 생태연구"(2010-2012)
[10] 연구재단 중견연구자지원-핵심연구 "환경유래 Acinetobacter 세균의 비돌연변이성 항생제 내성기작연구"(2011-2014)
[11] 농촌진흥청 차세대바이오그린사업 "차세대유전체연구사업 (국내 고유 농용미생물의 신규, 비교 및 기능 유전체 연구)" (2011-2014)
[12] 농림수산식품연구개발사업 IPET과제 "황토가공나노신소재의 토양미생물 생태 및 토양오염개선 최적화 기법 개발"(2012-2015)
[13] 연구재단 중견연구자지원 후속연구사업 "환경유래 신호물질에 의한 항생제 작용기전 조절 및 유전적 진화연구"(2014-2017)
[14] 식품의약안천처 연구용역사업 "항생제 대체물질의 어병감염세균 항균기능 평가 및 기작 구명"(2015)
[15] 국토교통과학기술진흥원 " 박테리아활용 균열 자기치유 콘크리트개발" (2016-2020)
[16] 현대자동차 용역과제 "복합생물막 형성 강화연구" (2017-2018)
[17] 연구재단 중견연구자지원 신규과제 " 세균 대사회로 및 스트레스반응 조절을 통한 항생제 작용기전 연구"(2017-2020)
[18] 삼성전자 용역과제(2018)
[19] 국립생물자원관 용역과제 "특수환경미생물 자원발굴 및 특성분석" (2020)
[20] 연구재단 중견연구자지원 신규과제 "실험실-진화 항생제 내성 세균 유전체 가소성 및 적응 진화 연구" (2019-2021)
[21] 국립생물자원관 용역과제 "자생생물을 이용한 조류생장조절 유용성 탐색연구 I-V" (2018 -2022)
[22] 국토교통과학기술진흥원 "박테리아 자기치유 소재 실용화 기술 개발" (2020-2022)
[23] 연구재단 바이오의료기술개발 "One Health기반 다제내성균의 내성 분자 메커니즘 규명" (2020-2023)
[24] 연구재단 공동연구"광합성미생물기반 0g 탄소발자국 생체 건축자재 개발기술" (2021-2025)
[25] 연구재단 기초연구실지원사업 (BRL) "세균 숙주상호작용의 리간드 수용체 연구단" (2022-2025)
[26] 연구재단 중견연구 "세포막 리모델링 기반 OMV 매개 세포성 물질수송 연구" (2023-2025)