โรงเรียนบ้านแฮดศึกษาเป็นโรงเรียนมัธยมประจำอำเภอบ้านแฮด จังหวัดขอนแก่น สังกัดสำนักงานเขตพื้นที่การศึกษามัธยมศึกษาขอนแก่น กระทรวงศึกษาธิการ ตั้งอยู่เลขที่ 108 หมู่ที่ 1 ตำบลบ้านแฮด อำเภอบ้านแฮด จังหวัดขอนแก่น โดยได้รับการบริจาคที่ดินจากนางศิริกานต์ ทองไทย จำนวน 31 ไร่ 2 งาน 40 ตารางวา เปิดทำการสอนครั้งแรกเมื่อวันที่ 16 พฤษภาคม 2528 โดยเป็นหน่วยการเรียนเคลื่อนที่โรงเรียนชุมชนบ้านแฮด (คำพรบำรุง) ซึ่งมีโรงเรียนบ้านไผ่เป็นโรงเรียนพี่เลี้ยง ในปีการศึกษา 2529 เปลี่ยนเป็นโรงเรียนสาขาโรงเรียนบ้านไผ่ และในวันที่ 21 พฤษภาคม พ.ศ. 2530 กระทรวงศึกษาธิการได้ประกาศตั้งโรงเรียนบ้านแฮดศึกษาเป็นโรงเรียนมัธยมประจำตำบลสังกัดกรมสามัญศึกษาแต่ยังอาศัยอาคารเรียนของโรงเรียนชุมชนบ้านแฮด (คำพรบำรุง) อยู่ ในวันที่ 15 มิถุนายน พ.ศ. 2530 กรมสามัญศึกษาได้แต่ตั้งนายรังสรรค์ เถื่อนนาดี มาดำรงตำแหน่งครูใหญ่โรงเรียนบ้านแฮดศึกษา
โรงเรียนได้มีการปรับปรุงระบบการบริหาร การจัดการเรียนการสอน ตลอดจนกิจกรรมต่าง ๆ ที่เป็นการเสริมหลักสูตรและพัฒนาการเรียนการสอน ให้เหมาะสมและสอดคล้องกับพระราชบัญญัติการศึกษาแห่งชาติ แผนการศึกษาแห่งชาติ นโยบายกระทรวงศึกษาธิการ นโยบายสำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน สภาพภูมิประเทศ และสิ่งแวดล้อมของโรงเรียน มีกลไกในการจัดการเรียนการสอนให้นักเรียนจบหลักสูตรอย่างมีคุณภาพและสอดคล้องกับวิสัยทัศน์ พันธกิจ และค่านิยมของโรงเรียน วิสัยทัศน์ (VISION) คือ โรงเรียนบ้านแฮดศึกษา มุ่งพัฒนาผู้เรียนให้มีคุณภาพตามมาตรฐานการศึกษา ชุมชนมีส่วนร่วม การบริหารอย่างมีระบบ บนพื้นฐานหลักปรัชญาของเศรษฐกิจพอเพียง พันธกิจ (MISSION) คือ ๑) พัฒนาผู้เรียนให้สามารถเรียนรู้ได้ตามมาตรฐานการศึกษาเต็มตามศักยภาพและมี๒) พัฒนาส่งเสริมครูและบุคลากรทางการศึกษาสู่ความเป็นมืออาชีพ ๓) พัฒนาผู้เรียนให้มีคุณลักษณะอันพึงประสงค์ตามหลักสูตร ๔) พัฒนาสภาพแวดล้อมและแหล่งเรียนรู้ทั้งภายในและภายนอกสถานศึกษาโดยการมีส่วนร่วมของชุมชน
๕) พัฒนาระบบบริหารจัดการให้มีประสิทธิภาพโดยยึดหลักปรัชญาของเศรษฐกิจพอเพียงส่งผลให้การบริหารของโรงเรียนบ้านแฮดศึกษามีคุณภาพ ทำให้โรงเรียนประสบผลสำเร็จทั้งในด้านการบริหาร การดำเนินงานด้านการจัดการเรียนการสอน และได้รับรางวัลเชิงประจักษ์