種子島中学校には１５の部活動があります。
入部率は、男子７７.６％、女子７８.９％です。
陸上部
野球部
サッカー部
男子ソフトテニス部
女子ソフトテニス部
男子バレーボール部
女子バレーボール部
バスケットボール部
卓球部
バドミントン部
剣道部
柔道部
弓道部
吹奏楽部
美術部
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