Es basa a estudiar les similituds i diferències de la fauna i flora segons la seva localització geogràfica. Així els organismes de dues regions seran més semblants com més a prop estiguin i més diferents quan més lluny.

Tenen una mateixa funció, encara que les seves estructures internes són diferents. Proven l’adaptació d’òrgans diferents d'una mateixa funció, com per exemple les ales dels aus i les dels insectes. A aquest fet s’anomena evolució convergent.

L’estudi dels fòssils i la comparació de les espècies extintes i les actuals ens permet veure les seves similituds i diferències. Demostrant que els éssers vius que han viscut a la Terra en el passat han canviat amb el temps i que unes espècies han estat substituïdes per altres.

Quan estudiem el desenvolupament embrionari dels animals ens adonem que els trets comuns a les fases inicials són més semblants com més propers són els animals, cosa que demostra que hi ha hagut un antecessor comú per tots ells.