Nesta etapa do processo pedagógico, dá-se início à sistematização do conhecimento. O ILEP está comprometido com a educação que promove a assimilação e a produção de conhecimento, o saber reflexivo e a cidadania. Assim, o Colégio proporciona ao aluno condições de aprendizagem, a partir das quais é instigado a pensar, duvidar, criticar, interpretar os fenômenos, construir hipóteses e produzir ideias.

De acordo com a atual legislação educacional brasileira, os estudantes devem iniciar o Ensino Fundamental aos seis anos e o curso deve ter, ao todo, nove etapas, que são divididas em Ensino Fundamental I e II.

Ensino Fundamental I

O Ensino Fundamental I abrange o ciclo que vai do 1º ao 5º ano. É neste momento que o aluno conclui o processo de alfabetização, iniciado de forma lúdica na Educação Infantil, e começa a sistematização dos conhecimentos acadêmicos. As aulas são conduzidas pela professora regente, que é responsável pela matriz comum (Língua Portuguesa, Matemática, Educação Financeira,  História, Geografia, Ciência, Ensino Religioso,  Arte, Educação Física  e Língua Inglesa).

Os alunos possuem ainda nesta etapa aulas de inteligência sócio emocional com o programa Escola da Inteligência.