Este plantel inició operaciones en el año 2001 en una sede alterna ubicada en la calle San Lorenzo no. 290, col. Del Valle, en condiciones poco favorables. La primera generación estuvo integrada por 150 estudiantes.

Fue el 12 de agosto de 2002 cuando los entonces jefe de Gobierno del Distrito Federal, licenciado Manuel Andrés López Obrador; la directora general del IEMS, matemática María Guadalupe Lucio Gómez Maqueo, y la delegada en Coyoacán, María de Lourdes Rojo e Incháustegui, inauguraron oficialmente las nuevas instalaciones.