Las actividades en el plantel "Vasco de Quiroga" iniciaron en septiembre de 2011 en el predio denominado La Cuesta (con una superficie de 3 mil 254 metros cuadrados), que en un inicio estaba destinado para una escuela secundaria. Después de diversas gestiones de los habitantes de la comunidad, el Gobierno de la Ciudad de México y la Secretaría de Educación local determinaron que el Instituto de Educación Media Superior (IEMS) se hiciera cargo de estas instalaciones.
Aunque ya había sido inaugurado por las autoridades delegacionales, a mediados de octubre de 2011 se realizó una nueva ceremonia de apertura del plantel presidida por el entonces jefe de Gobierno del Distrito Federal, licenciado Marcelo Luis Ebrard Casaubón, con la asistencia del director general del IEMS, doctor José de Jesús Bazán Levy, y el subdirector de Coordinación del plantel, licenciado Andrés Armando Márquez Mardones, entre otros invitados.
No se tiene referencia documental de cuándo se iniciaron oficialmente las actividades del plantel, sólo se ubica la bitácora de registro de visitantes, que hace alusión al primer registro el día 10 de septiembre de 2011.
El plantel "Vasco de Quiroga" corresponde al número 19 de este modelo educativo, que contó con una matrícula inicial de 189 estudiantes.
A mediados de noviembre de 2013 se iniciaron los trabajos de construcción, ampliación y modificación de sus instalaciones, consistentes principalmente en la construcción del Edificio "A", conformado por las áreas de sala de usos múltiples, laboratorio de ciencias, biblioteca, cubículos de profesores y cubículos para estudiantes, y del tercer nivel del Edificio "C", así como de las cisternas, entre otras.
Para finales de 2014 se recibió el mobiliario y equipo informático.
Para marzo de 2018 se aperturó el servicio de comedor comunitario.
