Il fiume Mincio, che è un emissario del lago di Garda ed è un affluente del Po, forma tre laghi artificiali. Essi sono tre ma in origine erano quattro: il quarto lago si chiamava Paiolo e si trovava a sud-ovest . Di esso rimane un canale che si chiama come quest'ultimo. Mantova era una specie di isola e all'interno del lago Paiolo si trovava un'isola chiamata Teieto ( Te), forse per la presenza di molti tigli oppure per i mattoni (tezze). Essa fu collegata con un ponte alle mura meridionali della città; inoltre  ci venne costruita una residenza dei Gonzaga che nel '500 diventò una residenza di lusso. 

I tre laghi sono divisi da dei ponti, tra cui vediamo Il ponte dei mulini: un ponte diga creato con lo scopo di regolare le acque del fiume Mincio che circondavano la città di Mantova, causa frequente di alluvioni. Tale grandioso progetto, iniziato nel 1188, fu concluso nel 1199. L'opera fu affidata all'ingegnere bergamasco Alberto Pitentino. Il ponte venne distrutto nella Seconda Guerra Mondiale da dei bombamenti aerei; venne successivamente ricostruito perdendo i mulini e il passaggio coperto.

A Mantova risiede una grande riserva naturale, il parco del Mincio. Il Parco del Mincio è un'area protetta, che si estende in provincia di Mantova lungo il fiume Mincio. E' uno dei primi parchi creati in Lombardia. Salvaguarda e valorizza il territorio e comprende sei Riserve Naturali.

La flora del Parco del Mincio è varia, perché il fiume attraversa vari ambienti nella sua corsa dal Garda al Po. Il tratto di fiume dove si registra la più alta concentrazione di varietà vegetali e floristiche corrisponde alla Riserva Naturale Ansa e Valli del Mincio e alla Riserva Naturale Vallazza, tra le più vaste e importanti zone umide dell'Italia settentrionale: qui si trovano Vallisneria, Millefoglio d'acqua, lamineti di Ninfea bianca, Nannufero e Castagna d'acqua, Ibisco e Iris palustri, praterie di Carice, Genziana di palude e ampie isole galleggianti di Fior di Loto, presenti nei laghi di Mantova, che sono uno dei simboli della città anche se non sono specie indigene.