AMF002/22

Análisis descriptivo y estadística básica en estudios biomédicos (R y Rmarkdown) (Edición 2022)


Del 8 de marzo al 14 de abril de 2022 (32 horas)


Plazo límite de preinscripción: 30 de enero de 2022

Online con:


2 Sesiones Webinar en directo : 14 de marzo y fecha por determinar 16:30h - 18:00h)


2 Sesiones presenciales (CIBA):


Subgrupo 1: 21 de marzo y 11 de abril de 16h a 19h

Subgrupo 2: 22 de marzo y 12 de abril de 9h a 12h

DIRIGIDO A:

Profesionales del Sistema Aragonés de Salud, y/o a personal investigador del IIS Aragón que desarrolla investigación dentro de un equipo de investigación, que precisen el manejo de este tipo de metodología para el desarrollo de su labor investigadora. (20 plazas)

Criterios de selección

Los criterios de selección serán:

  • Profesionales del SALUD que pertenezcan a un grupo de investigación.

  • Profesionales del SALUD que deseen iniciar labor investigadora.

  • Profesionales adscritos a grupos de investigación del IIS Aragón no incluidos en los dos grupos anteriores que desarrollen investigación clínica y con preferencia de los grupos emergentes.

  • Orden de Preinscripción.

En la selección, se intentará garantizar que los distintos sectores sanitarios de Aragón tengan representación en la actividad.

Para las sesiones presenciales, es imprescindible llevar ordenador portátil propio.

PRESENTACIÓN:

Hablamos de estadística, cuando pensamos en una relación de datos numéricos presentada de forma ordenada y sistemática y hablamos de bioestadística al referirnos a una rama de la estadística que se ocupa de los problemas planteados dentro de las ciencias de la vida, como la biología, la medicina, entre otros.

El conocimiento de la bioestadística puede ayudar al profesional de la salud a interpretar mejor los resultados de artículos originales que revise, permite comprender muchos de los tecnicismos que se encuentran en ellos y enjuiciarlos críticamente.

El análisis estadístico mediante el software R permite no sólo analizar estos datos con las técnicas estadísticas básicas, sino que también permite llevar a cabo análisis mediante modelos más complejos que no se encuentran disponibles en otros programas diseñados para el análisis de datos. La flexibilidad del entorno R también permite al usuario crear gráficos de alto nivel que permitan visualizar de forma eficiente la información que se está tratando. R también es un lenguaje de programación que permite al investigador crear sus propias funciones para facilitar, por ejemplo, el análisis masivo de datos.

Actualmente, muchas de las revistas científicas solicitan a los investigadores que sus trabajos sean reproducibles desde el punto de vista estadístico. R es el software más utilizado para esta tarea gracias a la posibilidad de integrar código de R en documentos de texto, LaTeX o incluso en páginas HTML. Dado que R sigue la filosofía de “código abierto”, numerosos investigadores ponen a disposición de la comunidad científica librerías, funciones y ejemplos que faciliten el análisis de todo tipo de datos biomédicos incluso para aquellos que no tienen un conocimiento avanzado ni estadístico ni de programación.

OBJETIVOS:

Objetivo general

Proporcionar las herramientas estadísticas básicas para la investigación en ciencias de la salud.

Iniciar al alumno en el lenguaje estadístico R mediante programación básica que le permita crear sus propias funciones para realizar tareas sencillas, así como realización de gráficos de alto nivel.

Objetivos específicos

  • Iniciar al alumno en el lenguaje estadístico R.

  • Enseñar al alumno cómo importar y manejar sus bases de datos en el entorno R.

  • Introducir al alumno en el análisis descriptivo univariado y bivariado mediante R.

  • Iniciar al alumno en la realización de gráficos de alto nivel mediante librerías específicas para dicha tarea.

  • Crear informes reproducibles usando R

PROFESORADO:


Juan Ramón González Ruiz Associate Research Professor en el Instituto de Salud Global Barcelona (ISGlobal). Bioinformatic group in genetic epidemiology (BRGE).

https://github.com/isglobal-brge/

https://orcid.org/0000-0003-3267-2146

METODOLOGÍA DOCENTE:

El curso, de modalidad mixta, se ha estructurado en 4 módulos con diferente carga horaria atendiendo a la secuencia de acciones en el transcurso de la realización y conceptualización de un plan de análisis estadístico.

Se desarrolla en la plataforma de formación Moodle y cuenta con 4 sesiones sesiones presenciales, dos de ellas mediante formato webinar en directo, otras dos, en formato presencial físicamente en instalaciones del CIBA.

En total el curso se articula en 32 horas, 23 de estudio teórico combinando trabajo individual tutorizado y 9 horas en formato presencial (2 sesiones en directo en formato webinar de 1,5 horas de duración cada una, 2 sesiones tipo taller en formato presencial físicamente en instalaciones del CIBA).

Durante la fase asíncrona al alumno dispondrá de contenidos de varios tipos:

  • Contenido del temario en formato multimedia y en formato “pdf” descargable.

  • Presentaciones en formato digital con el contenido de cada tema.

  • Actividades de autoevaluación para afianzar los contenidos.

  • Tarea a realizar por el alumno, el alumno aplicará los conocimientos adquiridos para completar la tarea que enviará mediante la plataforma.

  • Foro de debate y resolución de dudas en los que se solicitará a los alumnos que aporten reflexiones sobre el tema tratado o pongan en común sus dudas sobre la materia

  • Material de lectura complementaria, apartado “para saber más”.

Se seguirá una metodología que favorezca una interacción continuada entre docente y alumno. El docente actuará como guía para facilitar la transferencia de conceptos por parte de los alumnos. Para ello, los ejercicios prácticos se corregirán en un contexto interactivo, facilitando la discusión y el diálogo en lugar de la corrección unidireccional por parte del profesor. El profesor tiene amplia experiencia en formación online, conoce la plataforma moodle y los recursos que dispone dicha plataforma.

PROGRAMA

Modulo I

Tema 1: Introducción al R - Rstudio i. Introducción, ii. Directorio de trabajo, iii. Importar datos

Tema 2: Manejo de datos i. Visualización de datos, ii. Creación de variables, iii. Recodificación de variables, iv. Filtrado de datos

Tema 3: Análisis descriptivo

Webinar en directo Dudas y revisión bloque I (1,5 horas) Lunes 14 de marzo (16:30h)


Modulo II

Tema 4: Análisis inferencial i. Contrastes de hipótesis

a. Parametric tests: t-test, ANOVA, Chi-squared

b. Non-parametric tests: Fisher, Wilcoxon, Kruskall-Wallis

Tema 5 Modelos de regresión ii. Modelos estadísticos

a. Regresión lineal

b. Regresión logística

Sesión presencial: Dudas y revisión bloque II (3 horas)

Subgrupo 1: Lunes 21 de marzo 16h

Subgrupo 2: Martes 22 de marzo 9h


Modulo III

Tema 6 Gráficos i. Funciones Básicas de R ii. ggplot2

Webinar en directo Dudas y revisión bloque I (1,5 horas) Lunes 28 de marzo (16:30h)


Módulo IV Investigación reproducible

Tema 7 R Mardown

Tema 8 Creando reports usando librerías R

Sesión presencial: Dudas y revisión bloque IV (3 horas)

Subgrupo 1: Lunes 4 de abril 16h

Subgrupo 2: Martes 5 de abril 9h

EVALUACIÓN:

Para la obtención del certificado con la acreditación es necesario asistir al menos a 3 de las 4 sesiones presenciales y realizar todas las preguntas de autoevaluación y los ejercicios propuestos por el docente en cada módulo.

ACREDITACIÓN:

Actividad acreditada con 6,9 créditos por la Comisión de Formación Continuada de la Profesiones Sanitarias de Aragón.


DIRECCIÓN Y COORDINACIÓN CIENTÍFICA:

Daniel Bordonaba Bosque. Estadístico del Servicio de Apoyo Metodológico y Estadístico del IACS.

Anselmo López Cabañas. Metodólogo del Servicio de Apoyo Metodológico y Estadístico del IACS.

976 71 35 34 | 976 71 42 20

same.iacs@aragon.es


SECRETARÍA:

Tel. 976 71 58 99 Fax. 976 71 46 70

E-mail: formacion.iacs@aragon.es


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