โดยสถานศึกษามีขั้นตอนการดำเนินงาน คือ การจัดตั้ง “คลินิกเสมารักษ์” เป็นสถานที่หนึ่ง ที่เกิดขึ้นในสถานศึกษาเป็นการย่อขนาดสถานที่ให้ง่าย และสะดวกต่อนักเรียนกลุ่มเสี่ยงที่จะสามารถเข้ามารับ การให้คำปรึกษาอย่างเต็มใจ และเพื่อให้การประสานงานและการขับเคลื่อนการทำงานส่งเสริมความประพฤติ นักเรียน มีประสิทธิภาพ และสนองเจตนารมณ์ตาม พ.ร.บ. คุ้มครองเด็ก พ.ศ. ๒๕๔๖ จึงจัดตั้งคลินิกเสมารักษ์ เป็นหน่วยงานภายในงานอนามัย โรงเรียนและกิจการนักเรียน เพื่อเป็นศูนย์กลางดูแลแก้ไขปัญหาความประพฤติ นักเรียนโดยให้มีอำนาจหน้าที่ ดังนี้ เฝ้าระวังสถานการณ์ปัญหาความประพฤตินักเรียน โดยรับแจ้งเหตุ และดำเนินการแก้ไข ส่งเสริม สนับสนุน และประสานงานสถานศึกษา ในการป้องกันแก้ไขปัญหาความประพฤติ และคุ้มครองสิทธิของนักเรียน ร่วมกับองค์กรหลักของกระทรวงศึกษาธิการ เครือข่ายองค์กรภาครัฐและเอกชน และหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้อง ประสานติดตาม จัดทำกรณีศึกษาและบริการให้คำปรึกษาแก่นักเรียนและนักศึกษา ประสานตรวจสอบดูแลช่วยเหลือ นักเรียน สถานศึกษาที่ประสบเหตุภัยพิบัติ ภัยธรรมชาติ และสถานการณ์ฉุกเฉิน รวมทั้งกำหนดให้มีศูนย์วิทยุสื่อสารเสมารักษ์ กระทรวงศึกษาธิการ รวมถึงจัดระบบและบริหารจัดการให้เป็น ศูนย์กลางเชื่อมโยงเครือข่ายการส่งเสริมความประพฤตินักเรียนทั้งในส่วนกลางและส่วนภูมิภาค โดยแต่งตั้งคณะกรรมการดำเนินงาน “คลินิกเสมารักษ์” และกำหนดขั้นตอนการดำเนินงาน “คลินิกเสมารักษ์” เพื่อการทำงานที่เป็นระบบ และมีประสิทธิภาพ ขั้นตอนสุดท้ายของการดำเนินงานบำบัดในสถานศึกษานั้น มีการรายงานผลการดำเนินงานอย่างชัดเจนและเป็นรูปธรรม ซึ่งการดำเนินการด้านจิตสังคมบำบัดในสถานศึกษา เพื่อเสริมสร้างพัฒนาการด้านต่าง ๆ ทั้งร่างกาย อารมณ์และสังคมให้แก่ผู้เรียน โดยมีกิจกรรมต่าง ๆ เป็นการปรับสภาพจิต ไม่ให้มีพฤติกรรมไปยุ่งเกี่ยวกับสารเสพติดและอบายมุข
1. ด้านสุขภาพอนามัย โรงเรียนได้จัดกิจกรรมเพื่อส่งเสริมสุขภาพอนามัย ได้แก่ จัดการแข่งขัน กีฬาภายในโรงเรียน จัดให้มีลานกีฬา ห้องซ้อมดนตรีส่งเสริมการใช้เวลาว่างให้เกิดประโยชน์ โดยการเล่น กีฬา ดนตรีตรวจสุขภาพนักเรียนโดยคณะกรรมการสภานักเรียนฝ่ายอนามัย จัดกิจกรรมตามโครงการ มาตรฐานต้านสิ่งเสพติด (TRC. VB. Harm Prevention) และครูร่วมดูแลทุกวันดำเนินการตามโครงการบริการ และส่งเสริมสุขภาพนักเรียนโดยโรงพยาบาลห้วยราช
2. ด้านจริยธรรม โรงเรียนได้จัดกิจกรรมเพื่อส่งเสริมคุณธรรมและจริยธรรมสำหรับนักเรียน ได้แก่ กิจกรรมเข้าค่ายคุณธรรม การสวดมนต์ทุกวันพุธ กิจกรรมนั่งสมาธิก่อนเข้าเรียน รวมถึงสอดแทรกจริยธรรม ในการเรียนทุกกลุ่มสาระวิชา
3. ด้านสังคม โรงเรียนได้จัดกิจกรรมที่ส่งเสริมการอยู่ร่วมกันในสังคม ได้แก่ กิจกรรมสภา นักเรียน เพื่อให้เห็นความสำคัญของวิถีประชาธิปไตย กิจกรรมผู้ใหญ่บ้านเป็นการฝึกให้นักเรียนรู้จักบทบาทหน้าที่ ของตนเองในการอยู่ร่วมกัน กิจกรรมจิตอาสาเพื่อให้รู้จักการเสียสละและช่วยเหลือสังคม
4. ฝึกอาชีพ โรงเรียนได้จัดกิจกรรมที่ส่งเสริมอาชีพ ได้แก่ การทำสบู่สมุนไพร การเลี้ยงไก่บ้าน การทำไม้กวาด การทำปลาส้ม การปลูกพืช การปลูกกล้วย ผักสวนครัว การทอผ้า การสานตะกร้า การไปศึกษาดู งานเกี่ยวกับการประกอบอาชีพต่าง ๆ การทำดอกไม้ เป็นต้น สถานศึกษาได้จัดกิจกรรมโดยจัดให้นักเรียนทุกคน ได้มีที่ปรึกษา ผ่านโครงการผู้ใหญ่บ้านของกิจกรรม สภานักเรียนเป็นลักษณะเพื่อนช่วยเพื่อนพี่ช่วยน้อง ร่วมสนับสนุนโครงการ To Be Number One โครงการมาตรฐานต้านสิ่งเสพติด (TRC. VB. HarmPrevention) โครงการโรงเรียนปลอดบุหรี่ เพื่อเป็นการปลูกฝังให้นักเรียนเห็นถึงพิษภัยของสารเสพติด การปฏิบัติตัวไม่ให้เสี่ยง ในเรื่องของสารเสพติด ตลอดจนข่าวสารต่าง ๆ ที่เกี่ยวข้องกับสารเสพติด จัดบริการแนะแนว กิจกรรมโฮมรูม