☆武田淳志,野中大輔,今津裕太,福永津嵩,浜田道昭,REPrise:inexact seedを用いた散在反復配列検出,第46回日本分子生物学会年会,神戸国際展示場 1号館1階,2023年12月7日,(ポスター発表)
☆武田淳志,野中大輔,今津裕太,福永津嵩,浜田道昭,De novo repeat detection using inexact seed,生命情報科学若手の会 第15回研究会,料亭旅館 松濤軒,2023年10月7日-9日
酒井俊輔,武田淳志,今野直輝,大会企画セッション 「若手の会企画: 『研究室マネジメント』について話し合おう!」,2023年日本バイオインフォマティクス学会年会・第12回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2023),柏の葉カンファレンスセンター,2023年9月8日
☆武田淳志,福永津嵩,浜田道昭,グラフ表現による,構造変異を考慮した転移因子解析基盤の開発,第21回産総研・産技連LS-BT合同研究発表会,2023-6-14,オンライン開催, (ポスター発表)
武田 淳志, Transposable Element detection using sequence alignment, 早稲田大学早水研究室セミナー, 早稲田大学, 2023年5月10日 (invited talk)
武田 淳志, 野中 大輔, 今津 裕太, 福永 津嵩, 浜田 道昭, Inexact seedを用いた散在反復配列検出手法の開発, (ショートトーク), 情報処理学会 第72回バイオ情報学研究発表会(sigbio72), 東京工業大学大岡山キャンパス, 2022年11月29日
武田淳志 ,川崎 純菜,齋藤 裕,本野 千恵,倪 聖亮,Martin C Frith,浜田 道昭,Virus protein fossils in vertebrate genomes,(ショートトーク)第6回Tokyo Bioinformatics Meeting研究会,慶應義塾大学矢上キャンパス,2022年10月15日
Atsushi Takeda, Daisuke Nonaka, Yuta Imazu, Tsukasa Fukunaga and Michiaki Hamada, De novo repeat detection using inexact seed,114,第11回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2022), 2022/9/13~15, 千里ライフサイエンスセンター(ポスター発表)
武田 淳志,ゲノムの未知領域を探索する, 36, 生命情報科学若手の会 第14回研究会,オンライン開催,2022年9月10日~11日
武田 淳志, 野中 大輔, 今津 裕太, 福永 津嵩, 浜田 道昭, データベースを用いない高感度散在反復配列検出手法の開発, 2022/6/29, 第20回産総研・産技連LS-BT合同研究発表会, オンライン
武田淳志, De novo repeat detection using inexact seed, (ショートトーク)第5回Tokyo Bioinformatics Meeting研究会,オンライン開催,2021年11月13日
武田 淳志,inexact seedを用いた散在反復配列検出,生命情報科学若手の会 第13回研究会,オンライン開催,2021年10月22日〜24日
Atsushi Takeda, Yuta Imazu, Daisuke Nonaka, Tsukasa Fukunaga and Michiaki Hamada, De novo Repeat Detection using Inexact Seed, 第10回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2021), 2021/9/27~29, オンライン開催 (口頭発表)
武田淳志,De novo repeat detection using inexact seed,第4回Tokyo Bioinformatics Meeting研究会,オンライン開催,2020年10月24日(ライトニングトーク)
武田淳志, 今津裕太, 野中大輔, 福永津嵩, 浜田道昭, Ab initioな反復配列の検出法による未知の反復配列の発見, 生命情報科学若手の会 第12回研究会, オンライン開催, 2020年8月27日〜28日(ポスター発表)
☆Atsushi Takeda, Daisuke Nonaka, ☆Yuta Imazu, Tsukasa Fukunaga*, Michiaki Hamada*, REPrise: de novo interspersed repeat detection using inexact seeding, bioRxiv.org - the preprint server for Biology, 2024-01-21, https://doi.org/10.1101/2024.01.21.576581
Shohei Kojima, Satoshi Koyama, Mirei Ka, Yuka Saito, Erica H. Parrish, Mikiko Endo, Sadaaki Takata, Misaki Mizukoshi, Keiko Hikino, Atsushi Takeda, Asami F. Gelinas, Steven M. Heaton, Rie Koide, Anselmo J. Kamada, Michiya Noguchi, Michiaki Hamada, Biobank Japan Project Consortium, Yoichiro Kamatani, Yasuhiro Murakawa, Kazuyoshi Ishigaki, Yukio Nakamura, Kaoru Ito, Chikashi Terao, Yukihide Momozawa, Nicholas F. Parrish, Mobile element variation contributes to population-specific genome diversification, gene regulation and disease risk.(2023) ,Nature Genetics, https://doi.org/10.1038/s41588-023-01390-2
Zeng, C.*, Takeda, A., Sekine, K., Osato, N., Fukunaga, T., Hamada, M*. (2022). Bioinformatics Approaches for Determining the Functional Impact of Repetitive Elements on Non-coding RNAs, piRNA. Methods in Molecular Biology, vol 2509. https://doi.org/10.1007/978-1-0716-2380-0_19