ΕΡΕΥΝΑ

ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΕΣ ΔΡΑΣΤΗΡΙΟΤΕΣ

1. Γενετική ταυτοποίηση φυτικών και ζωικών οργανισμών

2. Μελέτες φυτικών και ζωικών οργανισμών για τον γενετικό χαρακτηρισμό ποικιλιών φυτικών ειδών, φυλών αγροτικών ζώων, φυσικών και εκτρεφόμενων πληθυσμών ιχθύων κ.α.   

3. Γενετική ταυτοποίηση και μελέτη της ποικιλότητας μικροοργανισμών σε φυτικούς και ζωικούς οργανισμούς

4. Μελέτες Ποσοτικής Γενετικής και γενετική χαρτογράφηση ειδών ιχθύων και αγροτικών ζώων

5. Μελέτη της γενετικής αρχιτεκτονικής ποσοτικών χαρακτήρων, QTL (Quantitative Trait Loci) ανάλυση και GWAS (Genome-Wide Association Analysis) ανάλυση σε εκτρεφόμενα είδη ιχθύων και αγροτικών ζώων 

6. Μελέτες της γενεαλογίας και των συγγενικών σχέσεων ατόμων ζωικών οργανισμών   

7. Μελέτη και αξιολόγηση Προγραμμάτων Επιλογής για την γενετική βελτίωση ιδιοτήτων οικονομικής σημασίας σε εκτρεφόμενα είδη ιχθύων και αγροτικών ζώων

 ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΑ ΕΡΓΑ (ενδεικτικά)

1/3/2007 - 1/3/2008: ‘Δημιουργία φιλικού προς τον χρήστη λογισμικού για την ανίχνευση γονιδίων που ελέγχουν ποσοτικές ιδιότητες (QTL). Εφαρμογή του λογισμικού σε πραγματικά δεδομένα.’ Φορέας χρηματοδότησης: Επιτροπή Ερευνών (Ειδικός Λογαριασμός Κονδυλίων & Έρευνας) του Αλεξάνδρειου Τεχνολογικού Εκπαιδευτικού Ιδρύματος (ΑΤΕΙ) Θεσσαλονίκης 

14/3/2007 - 1/6/2007: ‘Γονοτύπηση Γεννητόρων Τσιπούρας και Λαβρακιού.’ Φορέας χρηματοδότητσης: Ανώνυμος Εταιρεία Ιχθυοτροφεία ΣΕΛΟΝΤΑ Α.Ε.Γ.Ε. 

20/10/2010 - 15/7/2011: ‘DNA fingerprinting γονέων και απογόνων, αναδρομική αναγνώριση της γονικής προέλευσης των απογόνων και μελέτη της αλληλεπίδρασης γονοτύπου-περιβάλλοντος ως προς την αύξηση ’. Φορέας χρηματοδότησης: ΑΝΔΡΟΜΕΔΑ Α.Ε. ιχθυοκαλλιέργειες (ανάθεση ερευνητικού έργου από την Επιτροπή Ερευνών του Τεχνολογικού Εκπαιδευτικού Ιδρύματος Μεσολογγίου).

1/7/2011 – 31/10/2012: ‘Ανάπτυξη καινοτόμων μεθόδων και μοριακών εργαλείων για τον έλεγχο και τη βελτίωση της ποιότητας των εκτρεφόμενων πληθυσμών τσιπούρας και λαβρακιού - ΜΕΠΟΙΟΤΗΤΑ’. Φορέας χρηματοδότησης: Ε.Π. Ανταγωνιστικότητα και Επιχειρηματικότητα (ΕΠΑΝ ΙΙ), ΕΣΠΑ 2007-2013, Δράση Εθνικής Εμβέλειας ‘ΣΥΝΕΡΓΑΣΙΑ’, ΠΡΑΞΗ Ι: ‘Συνεργατικά Έργα Μικρής και Μεσαίας Κλίμακας’ (ανάθεση ερευνητικού έργου από την Επιτροπή Ερευνών του Τεχνολογικού Εκπαιδευτικού Ιδρύματος Μεσολογγίου).

1/8/2012 – 30/9/2015: ‘ΘΑΛΗΣ - Η δυναμική του συστήματος μετακινούμενης αιγοπροβατοτροφίας στην Ελλάδα. Επιδράσεις στην βιοποικιλότητα’. Φορέας χρηματοδότησης: Ευρωπαϊκό Κοινωνικό Ταμείο (ΕΚΤ) (ανάθεση ερευνητικού έργου από την Επιτροπή Ερευνών του Αλεξάνδρειου Τεχνολογικού Εκπαιδευτικού Ιδρύματος Θεσσαλονίκης).

4/6/2014 – 30/6/2015: ‘Ανάπτυξη και εισαγωγή βιοτεχνολογικών καινοτομιών, που αξιοποιούν μοριακούς γενετικούς δείκτες, στην γενετική βελτίωση της καλλιεργούμενης τσιπούρας (Sparus aurata)’ - Πρόγραμμα Ανάπτυξης Βιομηχανικής Έρευνας & Τεχνολογίας (ΠΑΒΕΤ) 2013. Φορέας χρηματοδότησης: ΕΠ ‘Ανταγωνιστικότητα και Επιχειρηματικότητα’ (ΕΠΑΝ-ΙΙ) και ένταξη στο Π.Ε.Π Μακεδονία-Θράκη, ΑΠ: ‘04–Ψηφιακή Σύγκλιση και Επιχειρηματικότητα στην ΠΚΜ’ (ανάθεση ερευνητικού έργου από την Επιτροπή Ερευνών του Αλεξάνδρειου Τεχνολογικού Εκπαιδευτικού Ιδρύματος Θεσσαλονίκης).

2/2/2015 – 30/11/2015: ‘Γενετική βελτίωση της γαλακτοπαραγωγής στο πρόβατο της φυλής Χίου μέσω της χρησιμοποίησης σημειακού πολυμορφισμού ενός νουκλεοτιδίου στο γονίδιο ACAA2’ - Πράξη «Εκπόνηση σχεδίων Ερευνητικών & Τεχνολογικών Αναπτυξιακών έργων Καινοτομίας (ΑγροΕΤΑΚ)». Φορέας χρηματοδότησης: Ελληνικός Γεωργικός Οργανισμός «ΔΗΜΗΤΡΑ».

20/3/2015 – 25/9/2015: ‘Συγκριτική μεταγραφωματική σε τέσσερα είδη της οικογένειας Sparidae με τη χρήση μεθόδων αλληλούχισης νέας γενιάς και συγκριτική χαρτογράφηση βασιζόμενη σε ήδη διαθέσιμες γενετικές πληροφορίες από μοντέλα-είδη ιχθύων - SparComp, Αριστεία Ι’.  Φορέας χρηματοδότησης: Ευρωπαϊκό Κοινωνικό Ταμείο (ΕΚΤ) (ανάθεση ερευνητικού έργου από το Ελληνικό Κέντρο Θαλασσίων Ερευνών).

08/09/2016 - 08/01/2017: ‘Ανάλυση γονιδιώματος Γεννητόρων Φαγκριού για την αποτύπωση πιθανών συγγενικών σχέσεων και τον σχεδιασμό επιτρεπόμενων – προτιμητέων συζεύξεων’. Φορέας χρηματοδότησης: ΝΗΡΕΥΣ ΙΧΘΥΟΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΕΣ Α.Ε.

5/3/2018 – 31/12/2018: ‘Επιλεκτική αναπαραγωγή για την ευρωστία και την ανθεκτικότητα στο στρες και σε ασθένειες στο λαβράκι (Dicentrarchus Labrax) μέσω της χρήσης των τεχνικών αλληλούχησης νέας γενιάς για τη γενετική βελτίωση’. Φορέας χρηματοδότησης: ΕΠ ‘Ανταγωνιστικότητα, Επιχειρηματικότητα και Καινοτομία (ΕΠΑνΕΚ)’ του ΕΣΠΑ 2014 –2020 (ανάθεση ερευνητικού έργου από την Επιτροπή Ερευνών του Αλεξάνδρειου Τεχνολογικού Εκπαιδευτικού Ιδρύματος Θεσσαλονίκης).

29/08/2018 - 14/05/2020: ‘Σχεδίαση, συμμετοχή και εκπόνηση ενός προγράμματος γενετικής επιλογής φαγκριού για ιχθυοκαλλιέργεια’. Φορέας χρηματοδότησης: ΝΗΡΕΥΣ ΙΧΘΥΟΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΕΣ Α.Ε.

03/09/2019 – 31/08/2020: ‘Future growth in sustainable, resilient and climate friendly organic and conventional European aquaculture - FutureEUAqua’. Φορέας χρηματοδότησης: Horizon 2020 (ανάθεση ερευνητικού έργου από το Ελληνικό Κέντρο Θαλασσίων Ερευνών).

01/11/2019 – 30/06/2021: ‘Ανάπτυξη Καινοτόμου Μεθόδου Γενετικής Επιλογής Ιχθύων με στόχο την αποτελεσματικότερη μετατρεψιμότητα τροφής’ - ΕΠ «ΑΛΙΕΙΑ ΚΑΙ ΘΑΛΑΣΣΑ 2014-2020». Φορέας χρηματοδότησης: ΕΣΠΑ 2014-2020 (ανάθεση ερευνητικού έργου από την Επιτροπή Ερευνών του Διεθνούς Πανεπιστημίου Ελλάδος).

01/10/2021 - 30/09/2022: 'Ανάλυση δειγμάτων DNA στα άλογα της φυλής Πίνδου'. Φορέας χρηματοδότησης: Ιππικός Όμιλος Κιλκίς.

15/12/2021 - 15/10/2022: 'Ανάλυση δειγμάτων DNA σε βοοειδή της Ελληνικής κόκκινης φυλής'. Φορέας χρηματοδότησης: ΠΑΝΣΕΡΡΑΙΚΟΣ ΚΤΗΝΟΤΡΟΦΙΚΟΣ ΣΥΛΛΟΓΟΣ. 

01/05/2022 - 01/10/2022: 'Γονοτύπηση δειγμάτων DNA σε βοοειδή της Ελληνικής κόκκινης φυλής'. Φορέας χρηματοδότησης: ΑΓΡΟΤΙΚΗ ΕΤΑΙΡΙΚΗ ΣΥΜΠΡΑΞΗ ΘΕΣΣΑΛΟΝΙΚΗΣ Α.Ε.. 

01/7/2022 - 15/2/2023: ‘Σύνταξη έκθεσης αποτελεσματικότητας της γενωμικής επιλογής.’ Φορέας χρηματοδότησης: AVRAMAR ΙΧΘΥΟΚΑΛΛΙΕΡΓΕΙΕΣ Α.Ε.  

25/05/2023 - 31/12/2023: 'Ανάλυση δειγμάτων DNA σε βοοειδή της Ελληνικής Κόκκινης Φυλής'. Φορέας χρηματοδότησης: ΠΑΝΣΕΡΡΑΙΚΟΣ ΚΤΗΝΟΤΡΟΦΙΚΟΣ ΣΥΛΛΟΓΟΣ. 

25/05/2023 - 31/12/2023: 'Ανάλυση δειγμάτων DNA στα άλογα της φυλής Πίνδου'. Φορέας χρηματοδότησης: Ιππικός Όμιλος Κιλκίς.

25/05/2023 - 22/02/2028: 'ΣΧΕΔΙΑΣΜΟΣ ΚΑΙ ΥΛΟΠΟΙΗΣΗ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΟΣ ΓΕΝΕΤΙΚΗΣ ΒΕΛΤΙΩΣΗΣ ΓΙΑ ΤΣΙΠΟΥΡΑ ΚΑΙ ΛΑΥΡΑΚΙ'. Φορέας χρηματοδότησης:  OP Avannotteria Siciliana (Acqua Azzurra and L'avannotteria aquaculture companies)

10/11/2023 - 31/12/2025: 'ΒΕΛΤΙΩΣΗ ΤΗΣ ΥΦΙΣΤΑΜΕΝΗΣ ΚΑΤΑΣΤΑΣΗΣ ΔΙΑΤΗΡΗΣΗΣ ΕΙΔΩΝ ΚΑΡΧΑΡΙΩΝ ΚΑΙ ΣΑΛΑΧΙΩΝ ΜΕΣΩ ΤΗΣ ΕΦΑΡΜΟΓΗΣ ΠΡΟΣΑΝΑΤΟΛΙΣΜΕΝΗΣ ΕΡΕΥΝΑΣ ΣΤΗΝ ΕΛΛΗΝΙΚΗ ΒΙΟΠΟΙΚΙΛΟΤΗΤΑ'. Φορέας χρηματοδότησης: Αστική Μη Κερδοσκοπική Εταιρία για την Προστασία των Υδάτινων Οικοσυστημάτων - 'iSea'.

ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΕΣ ΔΗΜΟΣΙΕΥΣΕΙΣ (ενδεικτικές)

1. Loukovitis D, Sarropoulou E, Tsigenopoulos CS, Batargias C, Magoulas A, Apostolidis AP, Chatziplis D, Kotoulas G (2011) ‘Quantitative Trait Loci Involved in Sex Determination and Body Growth in the Gilthead Sea Bream (Sparus aurata L.) through Targeted Genome Scan’. PLoS ONE 6(1): e16599. doi:10.1371/journal.pone.0016599

2. Dimitrios Loukovitis, Elena Sarropoulou, Emmanouela Vogiatzi, Costas S. Tsigenopoulos, Georgios Kotoulas, Antonios Magoulas, Dimitrios Chatziplis (2012) ‘Genetic variation in farmed populations of the gilthead sea bream Sparus aurata in Greece using microsatellite DNA markers’. Aquaculture Research 43: 239-246. 

3. Sotiris Kiparissis, Dimitris Loukovitis and Costas Batargias (2012) ‘First record of the Bermuda sea chub Kyphosus saltatrix (Pisces: Kyphosidae) in Greek waters’. Marine Biodiversity Records 5: e11. doi:10.1017/S1755267211001199 

4. D. Loukovitis, E. Sarropoulou, C. Batargias, A. P. Apostolidis, G. Kotoulas, C.S. Tsigenopoulos and D. Chatziplis (2012) ‘Quantitative trait loci for body growth and sex determination in the hermaphrodite teleost fish Sparus aurata L.’. Animal Genetics 43: 753-759. 

5. Costas S. Tsigenopoulos, Bruno Louro, Dimitrios Chatziplis, Jacques Lagnel, Emmanouella Vogiatzi, Dimitrios Loukovitis, Rafaella Franch, Elena Sarropoulou, Deborah M. Power, Tomaso Patarnello, Constantinos C. Mylonas, Antonios Magoulas, Luca Bargelloni, Adelino Canario, Georgios Kotoulas (2014) ‘Second generation genetic linkage map for the gilthead sea bream Sparus aurata L.’. Marine Genomics 18: 77-82.

6. D. LOUKOVITIS, B. IOANNIDI, D. CHATZIPLIS, G. KOTOULAS, A. MAGOULAS, C. S. TSIGENOPOULOS (2015) ‘Loss of genetic variation in Greek hatchery populations of the European sea bass (Dicentrarchus labrax L.) as revealed by microsatellite DNA analysis’. Mediterranean Marine Science  16/1: 197-200. 

7. D. Loukovitis, A. Siasiou, I. Mitsopoulos, A.G. Lymberopoulos, V. Laga, D. Chatziplis (2016) ‘Genetic diversity of Greek sheep breeds and transhumant populations utilizing microsatellite markers’. Small Ruminant Research 136: 238-242. 

8. T. Pazartzi, S. Siaperopoulou, C. Gubili, S. Maradidou, D. Loukovitis, A. Chatzispyrou, A.M. Griffiths, G. Minos, A. Imsiridou (2019) ‘High levels of mislabeling in shark meat – Investigating patterns of species utilization with DNA barcoding in Greek retailers’. Food Control 98: 179–186. 

9. Imsiridou A, Papapetrou M, Tilikidis A, Loukovitis D, Minos G, Gouva E, Chatzopoulos A, Skoufos I, Paschos I (2019) ‘Can the Population Structure of Three Greek Marine Species (Sardina pilchardus, Penaeus kerathurus, Mullus barbatus) Become a Tool for their Future Characterization as PGI Products?’. Journal of Nutrition, Food and Lipid Science 1: 54-83. 

10. Dimitrios Chatziplis, Stavroula Oikonomou, Dimitrios Loukovitis, Dimitrios Tsiokos, Athanasios Samaras, Arkadios Dimitroglou, Lefteris Kottaras, Kantham Papanna, Leonidas Papaharisis, Costas Tsigenopoulos and Michail Pavlidis (2020) ‘QTL for Stress and Disease Resistance in European Sea Bass, Dicentrarhus labrax L.’. MDPI Animals 10: 1668; doi:10.3390/ani10091668 

11. I. Giovos, R.N. Aga Spyridopoulou, N. Doumpas, K. Glaus, P. Kleitou, Z. Kazlari, D. Katsada, D. Loukovitis, I. Mantzouni, M. Papapetrou, Y.P. Papastamatiou, D.K. Moutopoulos (2021) ‘Approaching the “real” state of elasmobranch fisheries and trade: A case study from the Mediterranean’. Ocean and Coastal Management 211: 105743; https://doi.org/10.1016/j.ocecoaman.2021.105743

12. Maria Papapetrou, Zoi Kazlari, Kantham Papanna, Leonidas Papaharisis, Stavroula Oikonomou, Tereza Manousaki, Dimitrios Loukovitis, Lefteris Kottaras, Arkadios Dimitroglou, Evgenia Gourzioti, Charalampos Pagonis, Andreas Kostandis, Costas S. Tsigenopoulos, Dimitrios Chatziplis (2021) ‘On the trail of detecting genetic (co)variation between resistance to parasite infections (Diplectanum aequans and Lernanthropus kroyeri) and growth in European seabass (Dicentrarchus labrax)’. Aquaculture Reports 20: 100767; https://doi.org/10.1016/j.aqrep.2021.100767

13. Oikonomou, S.; Samaras, A.; Tekeoglou, M.; Loukovitis, D.; Dimitroglou, A.; Kottaras, L.; Papanna, K.; Papaharisis, L.; Tsigenopoulos, C.S.; Pavlidis, M.; Chatziplis, D. (2022) ‘Genomic Selection and Genome-Wide Association Analysis for Stress Response, Disease Resistance and Body Weight in European Seabass’. MDPI Animals 12: 277. https://doi.org/10.3390/ani12030277

14. Dimitrios Loukovitis, Mária Szabó, Dimitrios Chatziplis, István Monori & Szilvia Kusza (2022) ‘Genetic diversity and substructuring of the Hungarian merino sheep breed using microsatellite markers’. Animal Biotechnology. DOI: 10.1080/10495398.2022.2042307

15. Stavroula Oikonomou, Zoi Kazlari, Maria Papapetrou, Kantham Papanna, Leonidas Papaharisis, Tereza Manousaki, Dimitrios Loukovitis, Arkadios Dimitroglou, Lefteris Kottaras, Evgenia Gourzioti, Charalampos Pagonis, Andreas Kostandis, Costas S. Tsigenopoulos, Dimitiros Chatziplis (2022) ‘Genome Wide Association (GWAS) Analysis and genomic heritability for parasite resistance and growth in European seabass.’ Aquaculture Reports 24: 101178; https://doi.org/10.1016/j.aqrep.2022.101178 

16. Ioannis Giovos, Maria Violetta Brundo, Nikolaos Doumpas, Zoi Kazlari, Dimitrios Loukovitis, Dimitrios K. Moutopoulos, Roxani Naasan Aga Spyridopoulou, Athina Papadopoulou, Maria Papapetrou, Francesco Tiralongo, Margherita Ferrante, Chiara Copat (2022) ‘Trace elements in edible tissues of elasmobranchs from the North Aegean Sea (Eastern Mediterranean) and potential risks from consumption’. Marine Pollution Bulletin 184: 114129; https://doi.org/10.1016/j.marpolbul.2022.114129 

17. Stavroula Oikonomou, Zoi Kazlari, Dimitrios Loukovitis, Arkadios Dimitroglou, Lefteris Kottaras, Konstantinos Tzokas, Dimitrios Barkas, Nikolaos Katribouzas, Leonidas Papaharisis and Dimitrios Chatziplis (2023) ‘Genetic Parameters and Genotype x Diet Interaction for Body Weight Performance and Fat in Gilthead Seabream’. MDPI Animals 13: 180. https://doi.org/10.3390/ani13010180 

18. Christodoulou C., Mavrommatis A., Loukovitis D., Symeon G., Dotas V., Kotsampasi B., Tsiplakou E. (2023) ‘Inclusion of Camelina sativa Seeds in Ewes Diet Modifies Rumen Microbiota’. Animals 13: 377. https://doi.org/10.3390/ani13030377

19. Christodoulou C., Mavrommatis A., Loukovitis D., Symeon G., Dotas V., Kotsampasi B., Tsiplakou E. (2023) ‘Effect of Spirulina Dietary Supplementation in Modifying the Rumen Microbiota of Ewes’. Animals 13: 740. https://doi.org/10.3390/ani13040740 

20. Schoinas, K.; Konstantou, V.; Bompou, E.; Floros, G.; Chatziplis, D.; Imsiridou, A.; Loukovitis, D. (2023) ‘Microbiome Profile of the Mediterranean Mussel (Mytilus galloprovincialis) from Northern Aegean Sea (Greece) Culture Areas, Based on a 16S rRNA Next Generation Sequencing Approach’. Diversity 15: 463. https://doi.org/10.3390/d15030463