我們的研究主要探討表觀遺傳學(epigenetics)與 DNA 甲基化,了解 DNA 上的化學變化如何影響基因的活性,以及這些變化如何與感染、免疫反應與人類疾病相關。我們特別關心在病毒感染與器官移植等情況下,人體表觀基因體如何改變。研究發現,DNA 甲基化模式可以預測器官移植病人的感染風險,並追蹤疾病在感染過程中的變化,例如 COVID-19。這些成果顯示表觀遺傳訊息具有成為疾病預測與健康監測生物標記的潛力,未來有機會應用於精準醫療與疾病早期診斷。
本實驗室的一大特色是結合生物資訊、計算生物學與基因體研究。我們發展新的計算方法與分析工具,來解析大規模的基因體與表觀基因體資料,例如利用 DNA 甲基化資料推估不同細胞種類的組成、分析全基因體甲基化變化,以及建立完整的資料分析流程。我們的研究也揭示表觀遺傳調控因子 TET1 在早期人類生殖細胞形成中的重要角色,幫助理解人類發育與生殖相關疾病的分子機制。相關研究成果已發表於 Nature Communications、Nature Cell Biology、PNAS、iScience 等國際期刊。
我們也積極將資料科學與人工智慧方法應用於生物醫學研究,例如利用機器學習與統計模型分析複雜的基因體資料,發展新的分析工具與疾病預測方法。本實驗室重視學生的跨領域研究訓練,培養在基因體研究、生物資訊分析與 AI 應用方面的能力。我們希望透過結合生物學與資料科學的方法,培養能夠解決未來生物醫學問題的新一代研究人才,也歡迎對生物資訊、人類疾病研究與 AI 方法有興趣的學生加入或合作。