O Laboratório de Prototipagem do Oceantec é um espaço inovador voltado ao apoio de estudantes e projetos da Universidade, o ambiente conta com máquina de corte a laser, impressoras 3D, equipamentos para produção de placas eletrônicas entre outros recursos que permitem transformar ideias em protótipos funcionais. Além de fomentar a inovação, o laboratório dispõe de maquinários que estimulam a sustentabilidade, como o moinho de plástico, vaccum forming, e a injetora de plástico, que permite a produção de novas peças a partir de material reciclado e promove práticas alinhadas à economia circular, reduzindo desperdícios e incentivando o uso consciente dos recursos.