Las diferentes dependencias que conforman el Campus Yucatán de la UNAM son las encargadas de ofertar en la entidad diversos estudios de posgrado entre especializaciones, maestrías y doctorados, con la finalidad de formar profesionistas y académicos del más alto nivel, preparados para generar y aplicar conocimientos referentes a las áreas de las ciencias físico-matemáticas y de las ingenierías, ciencias biológicas químicas y de la salud, ciencias sociales, así como las humanísticas desde diversos enfoques.