Dmol3 : (影片 40min)
1. 到 chemspider 查 aspirin, export 3D mol as aspirin.mol
2. 畫出 aspirin 分子結構
3. 計算 結構與特徵 與 chemspider 上的結果比對
4. 計算選項不同, 結果不同; 你要的精密度 ⇄ 可以付出的代價(時間+電腦)
結果檢視 :
電荷分佈, MO, 鍵長鍵角兩面角, IR UV/Vis , H-bond
Charge : DMol3 > Dialogs in DMol3 > DMol3 Analysis dialog > Population analysis selection (配合Label)
Orbitals : DMol3 > Dialogs in DMol3 > DMol3 Analysis dialog > Orbitals selection
Measure : 工具列 measure 小圖示
IR : Visualizer Tools > Vibrational analysis
UV/Vis : DMol3 > Dialogs in DMol3 > DMol3 Analysis dialog > Optics selection
(TDDFT 計算 可能要手動於input file中加入 TDDFT_Crit 1.d-5 1.d-7 1.d-5 1.d-5 100)
free-electron model 共軛染料之吸收光譜