La comunidad educativa Fernando Baquedano, tiene por misión educar en la diversidad y afectividad a todos los y las estudiantes, a través de metodologías activo participativas, innovadoras y con un carácter creativo, contextualizado e identitario, que dé cuenta de una educación de calidad con una mirada sistemática de la realidad y la proyección de un mundo enconstante cambio, asumiendo un compromiso de hacer suyos los desafíos del cuidado y preservación ecológica y sustentable del medio ambiente.
La comunidad educativa Fernando Baquedano, es una institución comprometida con la formación integral de todos los y las estudiantes, lo que les permite un desarrollo armónico con una macro visión del mundo, donde la ecología se reconoce como medio sustentable de una educación del siglo XXI y la innovación sea la respuesta a los constantes cambios que la sociedad experimenta.