El CIP ETI no organiza el servicio de transporte escolar; la organización del servicio se regula mediante O.F. 35/2022, de 11 de mayo, del Consejero de Educación para el alumnado residente en la Comunidad Foral de Navarra.

Las rutas de las distintas localidades llegan a CIP ETI Central. El alumnado que reciba clase otras ubicaciones como Polígono Industrial, CIP ETI San Juan  hacer transbordo a los vehículos lanzadera que les trasladan a dichos edificios.