ศูนย์ส่งเสริมการเรียนรู้ระดับอำเภอดอนตูม ประกาศจัดตั้งตามประกาศกระทรวงศึกษาธิการ เมื่อวันที่ 27 สิงหาคม พ.ศ.2536 โดยอาศัยอำนาจตามความในมาตรา 25 แห่งพระราชบัญญัติปรับปรุงกระทรวง ทบวง กรม พ.ศ.2534 ประกอบกับระเบียบกระทรวงศึกษาธิการว่าด้วยการจัดการศึกษาในสถานศึกษาสังกัดกรมการศึกษานอกโรงเรียน พ.ศ.2536 เป็นสถานศึกษาในราชการบริหารส่วนกลาง สังกัดกรมการศึกษานอกโรงเรียน พ.ศ.2536 ข้อ 6 ใช้ชื่อว่า “ศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอดอนตูม” สังกัดศูนย์การศึกษานอกโรงเรียนจังหวัดนครปฐม โดยมีที่ทำการตั้งอยู่ในห้องสมุดประชาชนอำเภอดอนตูม

        ต่อมาในปี พ.ศ.2537 นางปราณี  มหาชน ทำหน้าที่หัวหน้าศูนย์ ได้ขอใช้ที่ดินของอำเภอดอนตูม บริเวณด้านหลังห้องสมุดประชาชนอำเภอดอนตูม  ก่อสร้างที่เป็นทำการศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอดอนตูม และได้ย้ายที่ทำการออกจากห้องสมุดประชาชนอำเภอ มาอยู่ด้านหลังห้องสมุดประชาชนอำเภอ

        ในปี พ.ศ. 2555 นางรัชนี  จันทรอัมพร ผู้บริหารในขณะนั้น ได้ดำเนินการขอใช้ที่ดินบริเวณด้านหลังห้องสมุดประชาชนอำเภอดอนตูม จากเทศบาลอำเภอดอนตูม เพื่อทำการก่อสร้างอาคารที่ทำการ  โดยศูนย์ส่งเสริมการเรียนรู้อำเภอดอนตูม  ได้รับการสนับสนุนการก่อสร้างจากนายมนู  สร้อยพลอย นายอำเภอดอนตูม คุณพ่อบุญสม คุณแม่ตั้งบ๊วย  ชมภูพงศ์ คหบดีอำเภอดอนตูม  และจากการร่วมบริจาคของภาคีเครือข่าย องค์กรนักศึกษาและประชาชนอำเภอดอนตูม  ในการสนับสนุนงบประมาณก่อสร้างอาคาร  ได้ทำพิธีเปิดอาคารสถานศึกษาเมื่อวันที่ 4 ตุลาคม พ.ศ.2555 เปิดให้บริการทางการศึกษาของนักศึกษาและประชาชนตั้งแต่นั้นเป็นต้นมา

        อำเภอดอนตูม เป็นอำเภอหนึ่งในจังหวัดนครปฐม ตั้งอยู่ทางตอนกลางค่อนไปทางเหนือของจังหวัด มีพื้นที่รวมทั้งหมด 171.354 ตารางกิโลเมตร อยู่ห่างจากกรุงเทพมหานคร ประมาณ 61.7 กิโลเมตร คำว่า "ตูม" คำว่า "ดอน" มาจากทำเลที่ตั้งมีพื้นที่อยู่ในที่สูงไม่เคยมีประวัติถูกน้ำท่วมใหญ่เลย ซึ่งอดีตเรียกบริเวณนี้ว่า "เมืองตูม" สันนิษฐานว่า เป็นชื่อเมืองเก่าแก่ในสมัยศรีวิชัยเป็นราชธานี ต่อมาทางราชการจึงจัดตั้งเป็นอำเภอชื่อแรก คือ อำเภอสามแก้ว ต่อมาเปลี่ยนเป็นอำเภอกำแพงแสน แล้วแยกออกมาเป็นกิ่งอำเภอดอนตูม เมื่อวันที่ 4 มกราคม 2509 ยกฐานะเป็นอำเภอ เมื่อวันที่ 12 มีนาคม 2512

        ในช่วงปีงบประมาณ พ.ศ.2544 – 2565 โดยนางจิดาภา  บัวทอง ผู้อำนวยการ กศน.อำเภอดอนตูม ได้พัฒนาปรับปรุงสถานศึกษาให้มีสภาพแวดล้อมที่เหมาะสม มีสิ่งก่อสร้างเพิ่มขึ้น ได้แก่ อาคารเอนกประสงค์ จำนวน 1 หลัง  ตั้งอยู่ด้านข้างห้องสมุดประชาชนอำเภอดอนตูมติดกับสถานศึกษา และได้ปรับปรุงเสาธงใหม่ให้มีความสวยงาม เทพื้นคอนกรีต และปูกระเบื้องบริเวรหน้าห้องสมุดประชาชน ทำให้สถานศึกษา มีสถานที่ในการจัดกิจกรรมเกิดประโยชน์แก่นักศึกษาและประชาชน ทั้งนี้ได้รับการสนับสนุน ทั้งกำลังแรงงานจากครูและนักศึกษา และการสนับสนุน จาก คุณบุญสม - คุณตังบ๊วย  ชมภูพงศ์  ภาคีเครือข่ายหลักคนสำคัญของศูนย์ส่งเสริมการเรียนรู้ระดับอำเภอดอนตูม