Строительство церкви было закончено в 1384 году. Иоанн Богослов- один из двенадцати апостолов, единственный из них, умерший естественной смертью. Первоначально церковь являлась главным храмом небольшого Богословского женского монастыря. Монастырь был упразднен в 1764 году, после чего церковь функционировали как приходский храм.