ศูนย์การศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยอำเภอบ่อทอง ตั้งอยู่เลขที่ 9/23 หมู่ที่ 1 ตำบลบ่อทอง อำเภอบ่อทอง จังหวัดชลบุรี สังกัดสำนักงานส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยจังหวัดชลบุรี จัดตั้งขึ้นตามประกาศของกระทรวงศึกษาธิการ เมื่อวันที่ 27 สิงหาคม พ.ศ. 2536 ซึ่งปัจจุบันใช้พื้นที่ของอาคารห้องสมุดประชาชนอำเภอบ่อทอง บางส่วนเป็นที่ทำการสำนักงาน

เดิมชื่อ ศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอบ่อทอง จังหวัดชลบุรี จัดตั้งขึ้นตามประกาศของกระทรวงศึกษาธิการ เมื่อวันที่ ๒๗ สิงหาคม พ.ศ. ๒๕๓๖ เป็นสถานศึกษาในสังกัดกรมการศึกษานอกโรงเรียน

ต่อมาเมื่อวันที่ 4 มีนาคม พ.ศ ๒๕๕๑ ได้ประกาศ จัดตั้งเป็นศูนย์การศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยอำเภอบ่อทอง สังกัดสำนักงานส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยจังหวัดชลบุรี สำนักงาน กศน. กระทรวงศึกษาธิการ