ศูนย์การศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยอำเภอเมืองชลบุรีเดิมชื่อ " ศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอ/กิ่งอำเภอ ลงวันที่ 27 สิงหาคม พ.ศ. 2536 สังกัดกรมการศึกษานอกโรงเรียน โดยอาศัยอำนาจตามความในมาตรา 25 แห่งพระราชบัญญัติปรับปรุงกระทรวง ทบวง กรม พ.ศ.2524 และระเบียบกระทรวงศึกษาธิการว่าด้วยการจัดการศึกษาในสถานศึกษาสังกัดกรมการศึกษานอกโรงเรียน พ.ศ.2531 ข้อ (6)

ปี พ.ศ.2542 ได้ปฏิรูปการศึกษา เปลี่ยนสังกัดเป็น สำนักงานการศึกษานอกโรงเรียน

ปี พ.ศ.2551 ได้มีมาตราพระราชบัญญัติว่าด้วยการส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัย เรียกพระราชบัญญัตินี้ว่า "พระราชบัญญัติส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัย พ.ศ.2551 ประกาศในราชกิจจานุเบกษา วันที่ 3 มีนาคม พ.ศ.2551 มีผลบังคับใช้ตั้งแต่วันที่ 4 มีนาคม พ.ศ.2551

วันที่ 10 มีนาคม พ.ศ.2551 กระทรวงศึกษาธิการประกาศรายชื่อสถานศึกษา ซึ่งประกาศในราชกิจจานุเบกษา เมื่อวันที่ 25 มีนาคม พ.ศ.2551 ให้เปลี่ยนชื่อสถานศึกษาเป็น " ศูนย์การศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยอำเภอเมืองชลบุรี เรียกโดยย่อว่า "กศน.อำเภอเมืองชลบุรี" สังกัดสำนักงานส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยจังหวัดชลบุรี สำนักงานปลัดกระทรวงศึกษาธิการกระทรวงศึกษาธิการ