Прапор школи містить елементи державної символіки України - синьо - жовті барви державного прапора, що символізує любов до рідної землі, її процвітання, мирну працю. Шкільний прапор виграє розмаїттям  кольорів.

   Червоний колір підкреслює козацьку традицію, волелюбність, символізує повноту життя, урочистість і енергію. Це знак величі школи.

   Жовтий - то символ тепла, безмежного щастя, сонячної радості, домашнього затишку для кожного у великій шкільній родині.

   Зелений - ознака дитинства, юності, мрій, надії.

   Синій - асоціюється з морем знань, на хвилях якого пливе шкільний корабель, щоб безперервно відкривати вічні істини. Це знак довір'я і благородних помислів.

   На фоні веселкових барв білий голуб. Це символ духовності, ніжності, щирої любові, злагоди і миру. Це також знак творчої сили, що здатна врятувати світ.

 Автор  прапора  учитель  образотворчого  мистецтва  Сова  Анатолій    Миколайович    та    випускник 2003 року  Сова Олександр.

Герб Чорнухинської ЗОШ І-ІІІ ступенів згідно з правилами сучасного українського місцевого герботворення вписано у декоративний картум жовтого кольору, як і герб сотенного містечка Чорнухи XVII - XVIII століття.

Цей колір асоціюється з повагою до історії рідного краю, до сонячного світла, енергії і радості. які наче випромінює школа. Небесно-синій фон щита символізує доброчесність, славу школи, вірність традиціям.

Портрет мандрівного поета, музиканта, просвітителя, філософа Г.С.Сковороди вказує на те, що Чорнухинщина була його батьківщиною, а школа з гордістю носить його ім'я.

У центрі герба - елемент приміщення школи, побудованої в 1903 році, що своїм напрямком вгору вказує на прагнення до вдосконалення, на  вічний рух вперед до нових висот.

Розкрита книга є символом життєвої мудрості  і таїни знань, які пізнаються поступово, сторінка за сторінкою, крок за кроком.

Автор герба випускник 1998 року     Анатолій Хоменко.