MINISTRANTE: Mariana Simões Ferreira

EMENTA:  Neste minicurso, o objetivo é explorarmos o método computacional de simulação de Dinâmica Molecular e como ele nos permite estudarmos as estruturas de biomoléculas, como as proteínas, computacionalmente. Nas partes téorica e prática serão discutidas a importância de definirmos os parâmetros biofísicos adequados para que os resultados obtidos pelas simulações sejam biologicamente confiáveis: como escolher o sistema de estudo, prepará-lo e, posteriormente, analisá-lo.

MINISTRANTES: Marlon Lemos Dias

Cibele Ferreira Pimentel

Raphaela Pires Ferreira

EMENTA: O minicurso de cultivo de células será ministrado no formato teórico-prático. Na parte teórica serão abordados os principais princípios e técnicas experimentais do cultivo celular em 2D e 3D. Na parte prática, os alunos executarão os procedimentos experimentais comumente realizados no cultivo 2D. Além disso, o cultivo 3D de esferoides também será realizado.

MINISTRANTES: Matheus Luchetta

Moara Lemos 

                         José de Anchieta

EMENTA: O curso aborda TEM, cryo-EM e métodos de reconstrução em três turnos. No primeiro, são apresentados princípios básicos de TEM e cryo-EM, preparação de amostras e conceitos de tomografia crioeletrônica (cryo-ET). No segundo turno, são discutidos os passos de processamento em cryo-ET: pré-processamento, alinhamento com fiduciárias e reconstrução volumétrica por WBP com métodos iterativos. No terceiro turno, é introduzida a análise de partícula única (SPA), com prática no Relion 5, apresentando o pipeline de processamento da beta-galactosidase, incluindo classificação, refinamento e validação estrutural.

MINISTRANTE: Igor Camilo Ferreira

EMENTA: Resumo:

O minicurso tem como objetivo oferecer uma introdução abrangente sobre pangenômica: o estudo da variação genômica e do conjunto completo de genes encontrados em todos os representantes de um grupo taxonômico. O curso explora a ecologia e evolução dos pangenomas, mecanismos que moldam a diversidade genética de populações procarióticas e como a fluidez e plasticidade do genoma influenciam a adaptação populacional aos mais diversos ambientes, finalizando com a exposição prática de pipelines em bioinformática para a reconstrução e análise de pangenomas bacterianos.

Ementa prevista:

Parte 1: Introdução à pangenômica:

Origem do conceito de “pangenoma”;

Histórico e fundamentos da pangenômica: do genoma de referência à era das (meta)(pan)ômicas;

Organização de pangenomas procarióticos: níveis de classificação (core, acessório, único), tamanho do pangenoma, composição e diversidade funcional;

O conceito de espécie procariótica na abordagem pangenômica;

Parte 2: Ecologia e evolução dos pangenomas:

Mecanismos evolutivos que moldam pangenomas procarióticos (transferência gênica horizontal, deriva genética, mutação e seleção);

Fluidez, plasticidade e dinâmica gênica em populações procarióticas;

Seleção gênica a nível populacional em pangenomas;

Parte 3: Aplicações da pangenômica bacteriana e pipelines em bioinformática:

Pangenômica aplicada à microbiologia médica e biotecnologia;

Perspectivas para a pesquisa em pangenômica;

Exposição: reconstruindo o pangenoma de espécies bacterianas na prática.