ศูนย์การศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยอำเภอบางปะหัน เดิมเป็นอาคารเอนกประสงค์ (อาคารพัฒนาการเกษตร)  ตั้งอยู่หมู่ที่  1 ตำบลขวัญเมือง  อำเภอบางปะหัน  สร้างจากเงินงบประมาณ   ที่ได้รับรางวัลจากการประกวดกลุ่มเกษตรกรดีเด่น  จำนวน  500,000  บาท  เมื่อปีพุทธศักราช  2522

     ต่อมาเมื่อวันที่ 16 พฤศจิกายน พุทธศักราช 2531 นายอำเภอบางปะหัน(รอ.บุญธรรม สุรเชษฐ์พงษ์)และสภาตำบลขวัญเมือง ได้ประชุมปรึกษาหารือกันเห็นว่า อาคารดังกล่าวสร้างมานานแล้วแต่ยังไม่ได้ใช้ประโยชน์เท่าที่ควร  ประกอบกับทางอำเภอบางปะหันยังขาดห้องสมุดประชาชนอำเภอ สภาตำบลจึงมีมติมอบอาคารหลังนี้ให้กับกรมการศึกษานอกโรงเรียน   เพื่อจัดตั้งเป็นห้องสมุดประชาชนอำเภอบางปะหัน

        ในปีงบประมาณ 2531  กรมการศึกษานอกโรงเรียนได้จัดสรรงบประมาณให้จำนวน 371,300 บาท  เพื่อปรับปรุงซ่อมแซมอาคารให้มีสภาพดีขึ้น  พร้อมทั้งบริการแก่ประชาชน  ต่อมาศูนย์การศึกษานอกโรงเรียนจังหวัดพระนครศรีอยุธยา  ได้ดำเนินการปรับปรุง  ซ่อมแซมอีกครั้งแล้วเสร็จสมบูรณ์ ในวันที่ 4 ธันวาคม พุทธศักราช 2534  และเปิดให้บริการตั้งแต่วันที่ 17 มกราคม  พุทธศักราช 2535  จนกระทั่งในวันที่ 1 พฤษภาคม พุทธศักราช 2550 ศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอบางปะหัน ได้ย้ายสำนักงานไปอยู่ที่อาคารโรงเรียนวัดทอง(เดิม)  เลขที่ 1/1 หมู่ที่ 2 ตำบลขวัญเมือง อำเภอบางปะหัน จังหวัดพระนครศรีอยุธยา และต่อมาเมื่อวันที่ 4 กุมภาพันธ์ พุทธศักราช 2551 ศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอบางปะหันได้ย้ายกลับมาใช้ชั้นสองของอาคารห้องสมุดประชาชนอำเภอบางปะหันเป็นสำนักงาน จนถึงปัจจุบัน

    และตามที่ สำนักบริหารงานการศึกษานอกโรงเรียน ได้ปรับเปลี่ยนภารกิจหน่วยงานใหม่ให้เป็นสำนักงานส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัย  ตามพระราชบัญญัติส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัย  พุทธศักราช 2551 ซึ่งประกาศในราชกิจานุเบกษา เล่มที่ 125 ตอนที่ 41 เมื่อวันที่ 3 มีนาคม พุทธศักราช 2551  และมีผลบังคับใช้ ตั้งแต่วันที่ 4 มีนาคม พุทธศักราช 2551 เป็นต้นไปนั้น  ศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอบางปะหัน(เดิม)  ได้เปลี่ยนชื่อใหม่เป็น 

 “ศูนย์การศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยอำเภอบางปะหัน” สังกัด สำนักงานส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัย (กศน.) สำนักงานปลัดกระทรวงศึกษาธิการ เป็นต้นมา

ส่งเสริมและจัดการศึกษาเพิ่มคุณค่าประชาชน

ภายในปี 2564 กศน.อำเภอบางปะหัน เป็นสถานศึกษามุ่งพัฒนาประชาชน ให้มีความรู้  คุณธรรม น้อมนำหลักปรัชญาเศรษฐกิจพอเพียง

1.จัดการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัย

2.พัฒนาบุคลากรให้สามารถจัดการศึกษาอย่างมีประสิทธิภาพ

3.ส่งเสริมให้เครือข่ายมีส่วนร่วมในการจัดการศึกษานอกระบบ

4.สนับสนุนนโยบายหน่วยงานต้นสังกัด