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¿Por qué PHYLOPYR?
Inmersos como estamos en una crisis de pérdida de biodiversidad, es más necesario que nunca compatibilizar el desarrollo social y económico con la conservación para revertir esta tendencia.
Inmersos como estamos en una crisis de pérdida de biodiversidad, es más necesario que nunca compatibilizar el desarrollo social y económico con la conservación para revertir esta tendencia.
PERO NO SE PUEDE CONSERVAR AQUELLO QUE SE DESCONOCE
PERO NO SE PUEDE CONSERVAR AQUELLO QUE SE DESCONOCE
Las plantas, que sustentan la cadena alimenticia además proporcionan de manera gratuita oxígeno, combustible y materiales entre otros muchos servicios. En el Pirineo crecen unas 4.000 especies diferentes de plantas.
Las plantas, que sustentan la cadena alimenticia además proporcionan de manera gratuita oxígeno, combustible y materiales entre otros muchos servicios. En el Pirineo crecen unas 4.000 especies diferentes de plantas.
En qué consiste
PHYLOPYR pretende describir la diversidad filogenómica de las plantas del Pirineo para uso en abierto por la comunidad científica y la sociedad en general.
PHYLOPYR pretende describir la diversidad filogenómica de las plantas del Pirineo para uso en abierto por la comunidad científica y la sociedad en general.
PHYLOPYR se centra en las plantas con flores, la mayoría de las plantas pirenaicas
PHYLOPYR se centra en las plantas con flores, la mayoría de las plantas pirenaicas
La reproducibilidad y trazabilidad de los datos es una aspecto fundamental de la ciencia que no siempre se cumple de manera rigurosa. PHYLOPYR asegura los mayores estándares en este sentido pues ha sido diseñado desde sus cimientos para asegurar ambos requerimientos. La existencia de pliegos de herbario catalogados como tipos moleculares garantiza que se puede volver al mismo individuo (no a al misma especie o población) si fuera necesario confirmar la determinación de la especie o proseguir con otros análisis diferentes. En su defecto, se proporcionan duplicados de la población, que a falta de poder usar el tipo molecular, son la referencia más fiable con la que trabajar. Sin duda, proyectos como PHYLOPYR ayudan a visibilizar y ensalzar la labor imprescindibla que los herbarios tienen para la ciencia.
La reproducibilidad y trazabilidad de los datos es una aspecto fundamental de la ciencia que no siempre se cumple de manera rigurosa. PHYLOPYR asegura los mayores estándares en este sentido pues ha sido diseñado desde sus cimientos para asegurar ambos requerimientos. La existencia de pliegos de herbario catalogados como tipos moleculares garantiza que se puede volver al mismo individuo (no a al misma especie o población) si fuera necesario confirmar la determinación de la especie o proseguir con otros análisis diferentes. En su defecto, se proporcionan duplicados de la población, que a falta de poder usar el tipo molecular, son la referencia más fiable con la que trabajar. Sin duda, proyectos como PHYLOPYR ayudan a visibilizar y ensalzar la labor imprescindibla que los herbarios tienen para la ciencia.
Los Herbarios y el resto de colecciones garantizan la trazabilidad y reproducibilidad
Los Herbarios y el resto de colecciones garantizan la trazabilidad y reproducibilidad
Además, depositando las secuencias generadas en repositorios de acceso libre con celeridad, garantizan su uso en futuras investigaciones, devolviendo así a la sociedad y particularmente a la comunidad científica, el apoyo económico recibido.
Además, depositando las secuencias generadas en repositorios de acceso libre con celeridad, garantizan su uso en futuras investigaciones, devolviendo así a la sociedad y particularmente a la comunidad científica, el apoyo económico recibido.
Metodología
Resultados esperados
En PHYLOPYR esperamos proporcionar a la comunidad científica los siguientes recursos, velando por la trazabilidad y la reproducibilidad:
En PHYLOPYR esperamos proporcionar a la comunidad científica los siguientes recursos, velando por la trazabilidad y la reproducibilidad:
-Pliegos testigo de los tipos moleculares secuenciados en el Herbario JACA (Instituto Pirenaico de Ecología-CSIC), así como duplicados de la población en diferentes herbarios, principalmente ARAN, BC y MA (Sociedad de Ciencias Aranzadi, Institut Botànic de Barceloa-Ajuntament de Barcelona y Real Jardín botánico-CSIC).
-Base de datos espacial de las recolecciones accesible en un set de datos en el portal GBIF.
-Extracciones de ADN en el Banco Nacional de ADN, de los pliegos testigo y a partir de las cuales se generaron las secuencias.
-Colección poblacional de tejido seco en el Herbario JACA de hasta 5 individuos de las poblaciones estudiadas y conservadas en gel de sílice incluyendo el tipo molecular y los duplicados.
-Secuencias plastidiales y de 352 genes nucleares accesibles en repositorios de acceso libre.
PHYLOPHYR PROPORCIONA UNA CANTIDAD DE RECURSOS DE VALOR INCALCULABLE
PHYLOPHYR PROPORCIONA UNA CANTIDAD DE RECURSOS DE VALOR INCALCULABLE
PHYLOPYR es el primer proyecto que se diseña y se ejecuta con la intención de servicio público científico y proporciona trazabilidad desde el primer momento con la inclusión de pliegos testigo hasta el final del proceso con la inclusión de las secuencias en repositorios abiertos. Es una apuesta clara por una ciencia universal y colaborativa y sin duda, como ya está haciendo, generará infinidad de sinergias y oportunidades nuevas para la ciencia.
PHYLOPYR es el primer proyecto que se diseña y se ejecuta con la intención de servicio público científico y proporciona trazabilidad desde el primer momento con la inclusión de pliegos testigo hasta el final del proceso con la inclusión de las secuencias en repositorios abiertos. Es una apuesta clara por una ciencia universal y colaborativa y sin duda, como ya está haciendo, generará infinidad de sinergias y oportunidades nuevas para la ciencia.
Financiación
En la actualidad se cuenta con financiación de dos convocatorias competitivas que en total suman unos 150.000€:
En la actualidad se cuenta con financiación de dos convocatorias competitivas que en total suman unos 150.000€:
-Por un lado PHYLOPYR está financiado con 79.000€ por el Programa red Gipuzkoana de Ciencia, Tecnología e Innovación para secuenciar entre 600 y 1000 especies los años 2023 y 2024.
-Por un lado PHYLOPYR está financiado con 79.000€ por el Programa red Gipuzkoana de Ciencia, Tecnología e Innovación para secuenciar entre 600 y 1000 especies los años 2023 y 2024.
-Por otro lado, el proyecto FLORAPYR 3D (Convocatoria POCTEFA con fondos europeos) aporta unos 71.000€ para trabajar con otras 400-500 especies entre los años 2024 y 2026 en una de sus tareas (Tarea 3.1 FLORAPYR 3D).
-Por otro lado, el proyecto FLORAPYR 3D (Convocatoria POCTEFA con fondos europeos) aporta unos 71.000€ para trabajar con otras 400-500 especies entre los años 2024 y 2026 en una de sus tareas (Tarea 3.1 FLORAPYR 3D).
Por otro lado, la coordinación de PHYLOPYR está financiada por fondos propios del Departamento de Botánica de la Sociedad de Ciencias Aranzadi y del Instituto Pirenaico de Ecología del CSIC .
Por otro lado, la coordinación de PHYLOPYR está financiada por fondos propios del Departamento de Botánica de la Sociedad de Ciencias Aranzadi y del Instituto Pirenaico de Ecología del CSIC .
Los análisis genómicos de PHYLOPHYR, incluido el personal técnico de apoyo para las colecciones de Herbario y los trabajos de laboratorio, se estiman en unos 400.000€, lo que equivale a unos 100€ por especie. El reto es conseguir información genómica para más del 95% de las especies antes del 2030.
Los análisis genómicos de PHYLOPHYR, incluido el personal técnico de apoyo para las colecciones de Herbario y los trabajos de laboratorio, se estiman en unos 400.000€, lo que equivale a unos 100€ por especie. El reto es conseguir información genómica para más del 95% de las especies antes del 2030.
¿Quién participa?
EN PHYLOPHYR HAY MAS DE 50 COLABORADORES DE 15 ENTIDADES DIFERENTES
EN PHYLOPHYR HAY MAS DE 50 COLABORADORES DE 15 ENTIDADES DIFERENTES
PHYLOPYR se estructura en dos grupos de trabajo, uno dedicado a la correcta identificación y priorización de las especies, para garantizar su correcto tratamiento botánico (EQUIPO FLORA) y otro encargado de asesorar y apoyar en los análisis genómicos (EQUIPO GENOMICA). Finalmente contamos con un nutrido grupo de colaboradores que apoyan en la recolección de campo.
PHYLOPYR se estructura en dos grupos de trabajo, uno dedicado a la correcta identificación y priorización de las especies, para garantizar su correcto tratamiento botánico (EQUIPO FLORA) y otro encargado de asesorar y apoyar en los análisis genómicos (EQUIPO GENOMICA). Finalmente contamos con un nutrido grupo de colaboradores que apoyan en la recolección de campo.
Financiado por:
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