水豚種類

現存兩個種的分佈，綠色的是水豚，紅色的是小水豚。 系統發生學研究顯示水豚屬與岩豚鼠屬有較近的親緣關係，因此都被放在豚鼠科下。 Woods 和Kilpatrick 將其分在水豚亞科下，水豚亞科和岩豚鼠屬在1200萬年前的中新世中期開始分別進化。