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花嶼島上開發不多，因此保留許多生物的原始棲地，尤其是鳥類，據本校黃國揚主任的研究觀察紀錄，就有215種，保存極豐富的鳥類資料庫，是賞鳥者的天堂；而花嶼南方的貓嶼，島上的燕鷗族群總數居全國之冠，每逢鳥季，鳥群遮天蔽日的壯麗美景「貓嶼翔禽」也列為澎湖的八大景觀之一，同時此地亦為國內第一個野生動物保護區，在我們規劃的「海峽飛羽」系列課程中，所有鳥類的影片及照片皆是本校黃國揚主任所拍攝，由師生自製的鳥類教學影片亦為整體課程中的重點項目，目前仍陸續建置中。
戴勝
L30cm
英名：Eurasian Hoopoe
學名：Upupa epops
山鷸
L33~35cm
英名：Eurasian Woodcock
學名：Scolopax rusticola
綠繡眼
L10~12cm
英名：Japanese White-eye
學名：Zosterops Japonicas
金背鳩
L30cm
英名：Oriental Turtle Dove
學名：Streptopelia Orientails
池鷺
L45cm
英名：Chinese Pond Heron
學名：Ardeola bacchus
灰鶺鴒
L18cm
英名：Gray Wagtail
學名：Motacilla cinerea
白腹鶇
L22~23cm
英名：Pale Thrush
學名：Turdus pallidus
白腹秧雞
L28~33cm
英名：White Breasted Waterhen
學名：Amaurornis phoenicurus
褐色柳鶯
L12cm
英名：Dusky Warbler
學名：Phylloscopus fuscatus
黃眉柳鶯
L11cm
英名：Yellow-Browned Willow Warbler
學名：Phylloscopus inornatus
紅尾伯勞
L20cm
英名：Brown Shrike
學名：Lanius cristatus
花雀
L14~15cm
英名：Brambling
學名：Fringilla montifringilla
黃尾鴝
L15cm
英名：Daurian Redstart
學名：Phoenicurus auroreus
黃頭鷺
L50cm
英名：Cattle Egret
學名：Bubulcus ibis
澎湖小雲雀
L15cm
英名：Oriental Skylark
學名：Alauda gulgula coelivox
桑鳲
L18-23cm
英名：Mask Hawfinch
學名：Coccothraustes personatus
白眉燕鷗
L36cm
英名：Bridled Tern
學名：Sterna anaethetus
銅藍鶲
英名：Verditer Flycatcher
學名：Eumyias thalassinus
田鷸
L27cm
英名：Common Snipe
學名：Gallianago gallianago
白鶺鴒
L17~19cm
英名：White Wagtail
學名：Motacilla alba
赤腹鷹
L30cm
英名：Goshawk
學名：Accipiter soloensis
小鵐
L13cm
英名：Little Bunting
學名：Emberiza pusilla
髮冠卷尾
L32cm
英名：Hair-crested Drongo
學名：Dicrurus hottentottus
玄燕鷗
L39cm
英名：Common Noddy
學名：Anous stolidus
別名：褐燕鷗、白頂玄鷗、黑鳥仔
黃雀
英名：Spruce Siskin
學名：Carduelis spinus
日本松雀鷹
L23-33cm
英名：Japanese Sparrow Hawk
學名：Accipiter gularis
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