โรงเรียนบ้านกลางนาเดื่อ ตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 9 พฤษภาคม 2473 โดยอาศัยศาลาวัดศรีชมชื่นบ้านกลางเป็นสถานที่เล่าเรียนชั่วคราว
และมีผู้บริหารโรงเรียนเรียงตามลำดับ ดังนี้ คือ
ตั้งแต่เริ่มตั้งโรงเรียนจนถึงปัจจุบัน ได้มีเหตุการณ์เคลื่อนไหวและเปลี่ยนแปลงพอสังเขป ดังนี้
พ.ศ. 2558
พ.ศ. 2558
พ.ศ. 2558
นายมโน ทามณี ได้เกษียณอายุราชการ ทาง สพป.สกลนคร เขต 1 ได้มีคำสั่งแต่งตั้ง (ย้าย) นางกษมน มังคละคีรี ตำแหน่งผู้อำนวยการโรงเรียนบ้านแป้นสามัคคีราษฎร์บำรุง มาดำรงตำแหน่ง ผู้อำนวยการโรงเรียนบ้านกลางนาเดื่อ
ปรับปรุงต่อเติมอาคารเรียน อนุบาล ทาสีอาคารเรียน
ปรับปรุงต่อเติมห้องผู้อำนวยการโรงเรียน ห้องพักครู ห้องวิชาการ ห้องพัสดุ ห้องปกครอง